| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,088,812 | A→G | G251G (GGT→GGC) | tsuA ← | thiosulfate utilization transporter TsuA/YeeE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,088,812 | 0 | A | G | 99.7% | 2410.7 / NA | 697 | G251G (GGT→GGC) | tsuA | thiosulfate utilization transporter TsuA/YeeE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (399/296); minor base T (2/0); total (401/296) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 697 total aligned reads displayed.
CTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACACCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGAT > NZ_CP025268/2088675‑2088946 | cTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcc < 1:3969713/140‑1 (MQ=255)cTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcc < 2:6420895/140‑1 (MQ=255)cTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcc > 1:6485762/1‑140 (MQ=255)cTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcc < 1:10925814/140‑1 (MQ=255) tGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGccc > 1:2052607/1‑140 (MQ=255) ggCACCGAAGCCCNTCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGANGATCCCTAACACCAGGAAAACGcccc > 1:6066362/1‑140 (MQ=255) ggCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcccc > 2:8752024/1‑140 (MQ=255) gCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTACTGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCACTAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCa > 2:2055093/1‑140 (MQ=255) gCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCa < 2:9612492/140‑1 (MQ=255) gCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACACCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCa > 2:8896925/1‑140 (MQ=255) aCCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGt > 1:2518891/1‑140 (MQ=255) aCCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGt < 1:11306752/140‑1 (MQ=255) gAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTaa < 2:6093429/140‑1 (MQ=255) gAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTaa < 1:5452820/140‑1 (MQ=255) aaGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAAt > 2:2830547/1‑140 (MQ=255) aaGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAAt < 1:5839454/140‑1 (MQ=255) aaGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAAt < 2:4185215/140‑1 (MQ=255) ccATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTAt > 2:7794964/1‑140 (MQ=255) tACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTACCACCAGGACAACGCCCCCGGTAAGGTATTTCATGt > 2:8552123/1‑140 (MQ=255) caccTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCAccc > 2:8246158/1‑140 (MQ=255) caccTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGG‑AAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCcg < 2:3457402/140‑1 (MQ=255) caccTAACCCGATACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCAccc > 2:3264112/1‑140 (MQ=255) ccTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCcgc > 1:7073197/1‑140 (MQ=255) ccTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCcgc > 1:6626357/1‑140 (MQ=255) ccTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCcgc > 1:10019603/1‑140 (MQ=255) ccTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCcgc > 2:2374345/1‑140 (MQ=255) cTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCcgcg > 2:5884834/1‑140 (MQ=255) tAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGa < 1:3186330/140‑1 (MQ=255) aaCCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGAc > 1:8508554/1‑140 (MQ=255) aCCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGAcc < 1:10728089/140‑1 (MQ=255) gCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAg > 2:4304678/1‑140 (MQ=255) cTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGaaa < 1:8389728/140‑1 (MQ=255) cTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGaaa < 2:8961298/140‑1 (MQ=255) tAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCa < 2:4632452/140‑1 (MQ=255) aaTGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAg < 1:11076727/140‑1 (MQ=255) aTGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATGTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGa < 1:2163494/140‑1 (MQ=255) ttgtttgtGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAata < 1:3810838/140‑1 (MQ=255) tttgtGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTg > 1:10228371/1‑140 (MQ=255) tttgtGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTg > 1:2737207/1‑140 (MQ=255) tttgtGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTg > 1:3562106/1‑140 (MQ=255) tgtgCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGc > 2:3556571/1‑140 (MQ=255) tgtgCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGc < 2:6669609/140‑1 (MQ=255) cccctCAGCTGCTCGCA‑‑CGCTGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCCATAAATGACCCCACGAAGCTCCCTAACACCAGGAAAACGCCCGAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCg < 2:9132689/136‑1 (MQ=255) gCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGt > 1:4211981/1‑140 (MQ=255) cATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGtt > 1:11231326/1‑140 (MQ=255) aTCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTg > 2:10634027/1‑140 (MQ=255) aTCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTg > 2:7160983/1‑140 (MQ=255) cAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTggg < 1:10515764/140‑1 (MQ=255) gcgcGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGt > 1:4540253/1‑140 (MQ=255) gcgcGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGt > 1:6717920/1‑140 (MQ=255) gcgcGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGt > 1:10313879/1‑140 (MQ=255) gcgcGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGt > 2:1105867/1‑140 (MQ=255) a‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTcc < 1:9492382/140‑1 (MQ=255) a‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTcc < 1:2971190/140‑1 (MQ=255) gcgGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCa > 2:10382673/1‑110 (MQ=255) gcgGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTa < 1:6166497/140‑1 (MQ=255) gcgGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACAACAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTa < 2:2204680/140‑1 (MQ=255) cGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGACGTGATTCCTAACCCAAACAt > 2:6999408/1‑140 (MQ=255) cGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACAt > 2:762916/1‑140 (MQ=255) cTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCg < 2:10163250/140‑1 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1:1703996/140‑1 (MQ=255) gCAATAAAAGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTACTAACCCAAACAAGCGTCCGGTTGCTTc > 1:8812548/1‑140 (MQ=255) cAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCa > 1:8174173/1‑140 (MQ=255) cAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCa > 1:766145/1‑140 (MQ=255) tAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTc < 2:145135/140‑1 (MQ=255) ataTGACCCCACGAAGAGCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCCTGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATCTAGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAACCATGCGTCCGGTTGCTTCACTcc < 2:11425922/138‑2 (MQ=255) aTGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAgg > 1:7315754/1‑140 (MQ=255) aCCCCACGAAGATCCCTAACACCATGAAAACGCCCCAGATAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGc < 2:7400707/140‑1 (MQ=255) aCCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGc < 1:3382869/140‑1 (MQ=255) aCCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGc < 1:2374345/140‑1 (MQ=255) ccccACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGcc > 1:4751668/1‑140 (MQ=255) ccACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAg < 1:1899712/140‑1 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CTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAA‑‑CGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACACCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGAT > NZ_CP025268/2088675‑2088946 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |