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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 2,792,259 | 0 | A | G | 99.8% | 1855.5 / NA | 529 | pseudogene (1841/2252 nt) | CXP41_RS24390 | alpha‑amylase family glycosyl hydrolase |
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Only 100 of 529 total aligned reads displayed.
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cACGCGTGTCGGCGGTGAGGCGTAGCTTAATAAAGGTTGCTCTACCTATCAGCAGCTCTACAATGAATTCCACGCATTATATATAGATAAAGCAGGAATATGGAGCGCATTTGAGGGTGTATCTGCAACTAAAAACGTTc < 2:7255252/140‑1 (MQ=255) cgcgTGTCGGCGGTGAGGCGTAGCTTAATAAAGGTTGCTCTACCTATCAGCAGCTCTACAATGAATTCCACGCATTATATATAGATAAAGCAGGAATATGGAGCGCATTTGAGGGTGTATCTGCAACTAAAAACGTTCTg < 1:8422296/140‑1 (MQ=255) gtCGGCGGTGAGGCGTAGCTTAATAAAGGTTGCTCTACATATCACCAGCTCTAAAATGAATTCCACGCATTATATATAGATAAAGCAGGAATAAGGAGCGCATTTGAGGGAGTATCTGCAACTAAAAACGTTCTGGCCtt > 2:1118038/1‑140 (MQ=255) tCGGCGGTGAGGCGTAGCTTAATAAAGGTTGCTCTAc > 1:9391945/1‑37 (MQ=255) tCGGCGGTGAGGCGTAGCTTAATAAAGGTTGCTCTAc < 2:9391944/37‑1 (MQ=255) tCGGCGGTGAGGCGTAGCTTAATAAAGGTTGCTCTACCTATc > 1:1211523/1‑42 (MQ=255) tCGGCGGTGAGGCGTAGCTTAATAAAGGTTGCTCTACCTATCAGCAGCTCTACAATGAATTCCACGCATTATATATAGATAAAGCAGGAATATGGAGCGCATTTGAGGGTGTATCTGCAACTAAAAACGTTCTGGCCttt > 1:2586484/1‑140 (MQ=255) ggTGAGGCGTAGCTTAATAAAGGTTGCTCTACCTATCAGCAGCTCTACAATGAATTCCACGCATTATATATAGATAAAGCAGGAATATGGAGCGCATTTGAGGGTGTATCTGCAACTAAAAACGTTCTGGCCTTTAGTCg < 2:1000921/140‑1 (MQ=255) gAGGCGTAGCTTAATAAAGGTTGCTCCACCTATCAGCAGCTCTACAATGAATTCCACGCATTATATATAGATAAAGCAGGAATATGGAGCGCATTTGAGGGTGTATCTGCAACTAAAAACGTTCTGGCCTTTAGTCGTgg < 1:8191040/140‑1 (MQ=255) gTAGCTTAATAAAGGTTGCTCTACCTATCAGCAGCTCTACAATGAATTCCACGCATTATATATAGATAAAGCAGGAATATGGAGCGCATTTGAGGGTGTATCTGCAACTAAAAACGTTCTGGCCTTTAGTCGTGGGGAtt < 1:2040876/140‑1 (MQ=255) | GATGAACAATTAGCAATGGCATATATAGCCGCTCTGCCGTTCAGCAGGCCTTTAGTTTACTGGGATGGCCAAGTATTAAAATCAACGACTGAAATTAAAAATTATGATGGGTCCACGCGTGTCGGCGGTGAGGCGTAACTTAATAAAGGTTGCTCTACCTATCAGCAGCTCTACAATGAATTCCACGCATTATATATAGATAAAGCAGGAATATGGAGCGCATTTGAGGGTGTATCTGCAACTAAAAACGTTCTGGCCTTTAGTCGTGGGGATT > NZ_CP025268/2792122‑2792395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |