Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,016,591 | T→C | *257* (TAA→TAG) | yqeC ← | selenium cofactor biosynthesis protein YqeC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,016,591 | 0 | T | C | 99.9% | 2289.8 / NA | 657 | *257* (TAA→TAG) | yqeC | selenium cofactor biosynthesis protein YqeC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (274/382); minor base A (1/0); total (275/382) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.19e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 657 total aligned reads displayed.
GGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATAT‑CTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGTTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAAAAACGGTTAA > NZ_CP025268/3016455‑3016727 | gggAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTa < 2:10894628/140‑1 (MQ=255) aGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTa > 1:7035560/1‑137 (MQ=255) aGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAAtt > 1:9895550/1‑140 (MQ=255) aGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAAtt > 1:11418218/1‑140 (MQ=255) gAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTcaca > 1:5067352/1‑140 (MQ=255) ccTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAAt < 1:3362409/140‑1 (MQ=255) cGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTg > 2:6170750/1‑140 (MQ=255) ggCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTgc > 1:272908/1‑140 (MQ=255) gCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCGTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAACTCTgcg > 2:9510944/1‑140 (MQ=255) tATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTgcgcg < 1:854900/140‑1 (MQ=255) tATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTgcgcg < 1:9191328/140‑1 (MQ=255) tATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTgcgcg < 1:7363574/140‑1 (MQ=255) tCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGcgcgcg < 2:167830/140‑1 (MQ=255) acaaTTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGAtt > 1:7580010/1‑140 (MQ=255) aTTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCa < 1:7909537/140‑1 (MQ=255) aTTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCa < 1:657939/140‑1 (MQ=255) aTTTGCGACATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCTATTTTTTCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCa < 2:8168121/140‑1 (MQ=255) tttGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAg > 1:10329762/1‑140 (MQ=255) tttGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCAAACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTACGCGCGAATGCAg > 2:3718626/1‑140 (MQ=255) ttGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAgg < 1:2103286/140‑1 (MQ=255) ttGCGCCATAGCAAACGGACAAGTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATAGTCATACCAACCTCACTGGATATCCTGTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTACTTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAgg < 2:10445636/140‑1 (MQ=255) tGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGa < 1:3721700/140‑1 (MQ=255) tGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGa < 1:6469997/140‑1 (MQ=255) tGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGa < 2:6642314/140‑1 (MQ=255) gcgcCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTgcgcg > 1:8813925/1‑128 (MQ=255) cgcCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATg < 2:10553688/140‑1 (MQ=255) cgcCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATg < 2:7036246/140‑1 (MQ=255) cgcCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATg < 2:4861367/140‑1 (MQ=255) cgcCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATg < 2:3387143/140‑1 (MQ=255) cgcCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATg < 2:5245804/140‑1 (MQ=255) cgcCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATg < 2:428719/140‑1 (MQ=255) cgcCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCGTTCAGTATCCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATg < 2:1308578/140‑1 (MQ=255) cATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTc < 2:1868351/140‑1 (MQ=255) aTAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCt > 1:6765535/1‑140 (MQ=255) aTAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCt < 1:3186030/140‑1 (MQ=255) aGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTGCTTg > 1:4669816/1‑140 (MQ=255) aaaCGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGtat < 1:6035528/140‑1 (MQ=255) aaaCGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGtat < 1:9509471/140‑1 (MQ=255) aaaCGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGtat < 1:10553518/140‑1 (MQ=255) aCGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTatat > 1:1387922/1‑140 (MQ=255) ggACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCg < 1:1015122/140‑1 (MQ=255) gACAATTATGCTCTTCGATTAGTGCAGCCTCTGTGAAAATAATCATACCAACCGCAATGGAGATCCTGTCAGTAACCCGGAAGACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGc < 2:7614026/140‑1 (MQ=255) aCAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGcc < 1:9059381/140‑1 (MQ=255) aCAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGcc < 1:7804744/140‑1 (MQ=255) aaTTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATAGTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCcca < 2:5789505/140‑1 (MQ=255) ctctTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGAt < 1:4859270/140‑1 (MQ=255) ctctTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGAt < 1:10015182/140‑1 (MQ=255) ctctTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGAt < 1:2479741/140‑1 (MQ=255) ctctTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGAt < 2:5517301/140‑1 (MQ=255) ctctTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGAt < 2:10321880/140‑1 (MQ=255) ctctTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGAGTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGAt < 2:6825289/140‑1 (MQ=255) ctctTCGAGATTAGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCCATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGAt < 2:11326988/140‑1 (MQ=255) ctTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTg < 2:10765540/140‑1 (MQ=255) ctTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTg < 2:9760836/140‑1 (MQ=255) ctCGAGAATTGCAGCCTCAGTGCAACTATTCATACCAACCTCACGGGATATCCTTTCAGTAACCCCGAATACCCGGGCCGCTAATACACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTAAATCGCCCAGCCAGATTGc < 1:9719378/139‑1 (MQ=255) gTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTa < 1:8944267/140‑1 (MQ=255) tttGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCACCCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGAGTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTAcg < 2:9393033/140‑1 (MQ=255) gCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCACTGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTAcgtcg < 2:1016441/140‑1 (MQ=255) gCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTAcgtcg > 1:8595289/1‑140 (MQ=255) tgAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCa < 1:8108182/140‑1 (MQ=255) tgAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCa < 2:4721358/140‑1 (MQ=255) tgAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTGTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCa < 2:8525889/140‑1 (MQ=255) aaTATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATCTCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGGGTTGTTGCAGCgg > 2:7907364/1‑140 (MQ=255) tatTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGtt > 1:3883727/1‑140 (MQ=255) tCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAAGACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGaa < 2:1436624/140‑1 (MQ=255) ccAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGc < 1:9392574/140‑1 (MQ=255) ccAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGc < 1:279826/140‑1 (MQ=255) ccAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGc < 1:10767071/140‑1 (MQ=255) ccAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGc < 1:3562748/140‑1 (MQ=255) ccAACCTCAATGGATATCCTGTCAGTAACCCGGAAGACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGc < 1:8306976/140‑1 (MQ=255) aaCCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGTAGGAGCTc > 2:560253/1‑140 (MQ=255) aaCCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTc > 2:8814927/1‑140 (MQ=255) aaCCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTc > 1:1101103/1‑140 (MQ=255) ccctccctGGATATCCTTACAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAACTCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCg < 1:5268963/133‑1 (MQ=255) cccTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCg < 2:2061788/139‑1 (MQ=255) aCCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCg > 2:9245021/1‑140 (MQ=255) ccTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAACTCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCATCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGCAGGAGCTCGc > 2:6374797/1‑140 (MQ=255) cTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCt < 2:3542106/140‑1 (MQ=255) cTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCt < 1:3807533/140‑1 (MQ=255) tCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGACTACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTCCGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGACGGAGCTCGCtt < 2:453501/140‑1 (MQ=255) cAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCttt > 2:2709007/1‑140 (MQ=255) gATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAACTCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTCCGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCa < 2:503885/140‑1 (MQ=255) tatccTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAAt < 1:4402950/136‑1 (MQ=255) tatccTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAAt > 2:3123021/5‑140 (MQ=255) atccTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATc > 1:4091401/4‑140 (MQ=255) atccTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATc > 1:11205396/4‑140 (MQ=255) tcctgtCAGTAACCCGGAAGACCCGGGCCGCTAATTCACACATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGCTTGCCTCTCCGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCg < 2:2857345/135‑1 (MQ=255) cTTTCAGTATCCGGGAATAACCGGGCCGCTAATTCTCAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCAAGATTGCCTCTACGTGGTGTTGTTGCTGCGGTTGAAGGAGCTAGCTTTGTGCAATCGCa < 1:686971/140‑1 (MQ=255) gTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGAGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTca > 2:9110178/1‑140 (MQ=255) aaCCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTcaca > 2:2150971/1‑140 (MQ=255) aaCCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTcaca < 2:3780491/140‑1 (MQ=255) aCCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCGTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACAt > 2:2516228/1‑140 (MQ=255) cccGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAAACTGCGCGCGATTGCAGGAGGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACAtg > 2:3948218/1‑139 (MQ=255) aaTACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGaa > 1:5498031/1‑140 (MQ=255) ccGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAAAAACg < 2:10054993/140‑1 (MQ=255) gCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAAAAACGGTTa > 1:1871571/1‑140 (MQ=255) ccGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAAAAACGGTTaa > 2:7363129/1‑140 (MQ=255) ccGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAAAAACGGTTaa > 2:11035819/1‑140 (MQ=255) ccGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAAAAACGGTTaa < 1:5855639/140‑1 (MQ=255) ccGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAAAAACGGTTaa < 1:1599633/140‑1 (MQ=255) | GGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATAT‑CTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGTTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAAAAACGGTTAA > NZ_CP025268/3016455‑3016727 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |