Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,341,273 | C→T | S105L (TCA→TTA) | yrbG → | calcium/sodium antiporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,341,273 | 0 | C | T | 99.4% | 2548.7 / NA | 671 | S105L (TCA→TTA) | yrbG | calcium/sodium antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (353/314); minor base G (0/4); total (353/318) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 671 total aligned reads displayed.
CGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATCACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTTAAACTTGCACGTCAGGCT > NZ_CP025268/3341136‑3341409 | cgcgTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTAc > 2:1378994/1‑140 (MQ=255) gcgTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTAcc < 2:6271956/140‑1 (MQ=255) gcgTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTAcc < 2:5221454/140‑1 (MQ=255) ctctGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTa < 1:743336/140‑1 (MQ=255) tctGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTaa < 1:9123938/140‑1 (MQ=255) tctGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTaa < 2:6880512/140‑1 (MQ=255) tctGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTaa < 1:4474185/140‑1 (MQ=255) tGCACGAACAACGCGATTTAGCCTTTGGTACAGCCCTCTGCTCTAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGATGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACACTTAAtg < 2:8344214/140‑1 (MQ=255) gAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATgttgtt < 2:4382226/140‑1 (MQ=255) acaacGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTgg > 2:2440798/1‑140 (MQ=255) acaacGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTgg > 1:3163447/1‑140 (MQ=255) acaacGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCGTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTgg > 2:1676705/1‑140 (MQ=255) ccgcgATTGAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAACCATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCa < 1:8859328/139‑1 (MQ=255) acGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCCATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCa > 2:11270279/1‑140 (MQ=255) acGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCa > 2:5470127/1‑140 (MQ=255) acGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCACGGCTCAAACATTATCAATATATAGCTGATCCTCCGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGGGAATTACCCTTAATCTTGATGGTCa > 2:7704291/1‑140 (MQ=255) gcgATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGGTGGTCAGc > 1:7876048/1‑140 (MQ=255) gCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCATACATTATCACTATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGGTCGGCCGTTTACCGTCCATTCTTAGGGTCAACGCGGTGAATTACCCTTCATGTGGAGTGTCAGCGTGGTGGc < 2:1990300/140‑1 (MQ=255) gCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCACACAGTATCAATCTATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGc < 2:2977742/140‑1 (MQ=255) gCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTTGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGc < 1:2210548/140‑1 (MQ=255) gCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGc < 1:9457985/140‑1 (MQ=255) gCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGc < 1:11379519/140‑1 (MQ=255) gCCGTAGGTACAGCCCTCGGCTCAAACAATCTCAATATAGTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGAGGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTTGTCAGCGTGGTGGc < 2:4750579/140‑1 (MQ=255) ccGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGcc > 1:9697126/1‑140 (MQ=255) cGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCg < 1:3362674/140‑1 (MQ=255) cGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCg < 2:3901325/140‑1 (MQ=255) cGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCg < 2:5817630/140‑1 (MQ=255) tGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGtt > 1:10747502/1‑140 (MQ=255) ggTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTc > 1:2779205/1‑140 (MQ=255) tACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCg < 1:1221960/140‑1 (MQ=255) cAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTa < 1:5647507/140‑1 (MQ=255) cAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTa < 1:6429282/140‑1 (MQ=255) gCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTAct > 1:10579369/1‑140 (MQ=255) cccTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTActc > 1:6811118/1‑140 (MQ=255) cccTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGGCCATTCTGAGGGTCTACGCCGTGCATTACCCTTAATGGTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTGCCGTActc > 2:8041725/1‑140 (MQ=255) cGGCTCACCCATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCGGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGGGGCCGGTTCCGTACTCTATg < 2:2091572/140‑1 (MQ=255) cGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTTATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATg < 2:10498994/140‑1 (MQ=255) cGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATg > 1:5487156/1‑140 (MQ=255) cGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATg > 1:587229/1‑140 (MQ=255) cGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATg < 2:9153495/140‑1 (MQ=255) ggCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGa > 2:2623940/1‑140 (MQ=255) ggCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGa > 1:8497754/1‑140 (MQ=255) cTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACg < 1:3709566/140‑1 (MQ=255) aaaCATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGAc > 2:6809623/1‑140 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1:10468132/1‑140 (MQ=255) gcTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTgg < 1:10011170/140‑1 (MQ=255) gcTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTgg < 1:387953/140‑1 (MQ=255) gcTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTgg < 1:6286681/140‑1 (MQ=255) cTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGc > 2:8788190/1‑140 (MQ=255) cTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGc < 1:10320860/140‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGtt < 1:9977871/140‑1 (MQ=255) ctCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGCCAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGtt < 2:4902187/139‑1 (MQ=255) tCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTCATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGGTCCGTACTCTATGACGGACAACTTTGTCGAATCGATGGTATCTGTCTCATCTTTCTGGCTGTGCTATGGctgctggtg > 2:9735367/1‑137 (MQ=255) tCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTCTGGCTGCTGTTc > 2:7371688/1‑140 (MQ=255) tCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTc > 2:7852551/1‑140 (MQ=255) cATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCAt > 1:826218/1‑140 (MQ=255) ttCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTg > 2:6006130/1‑140 (MQ=255) tCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTTTTCATTGt > 1:8625855/1‑140 (MQ=255) tCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGt < 2:3592868/140‑1 (MQ=255) gATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCGTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTTaa < 2:9575039/140‑1 (MQ=255) aTGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTTaaa > 2:10907578/1‑140 (MQ=255) aTGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTTaaa > 1:8330452/1‑140 (MQ=255) ttCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTGATACtt > 2:9078799/1‑140 (MQ=255) cTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTTAAACTTGc > 1:9252576/1‑140 (MQ=255) cTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTTAAACTTGc < 1:5280099/140‑1 (MQ=255) cTACGCCGTGAATTACCCTGAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGAGGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCGATGGCTGCTGGTCATTGTTATTCTTGc > 2:10315424/1‑140 (MQ=255) tACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTTAAACTTGCa > 1:10207505/1‑140 (MQ=255) gCCGTGAATTACCCATAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTTAAACTTGCACGt < 2:2813542/140‑1 (MQ=255) tGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGGTGCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTCTCGTTCTCCTGGTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGGTCGTTGTGACAGGTGCACGGCAgg > 2:8212333/1‑140 (MQ=255) ggAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTATCTGGATGTGCTATTGCTGCTGTTCATTTTTAAACTTGCACGTCAgg < 2:761263/139‑1 (MQ=255) aaTTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTTAAACTTGCACGTCAGGCt < 1:2977889/140‑1 (MQ=255) aaTTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTTAAACTTGCACGTCAGGCt > 2:3233677/1‑140 (MQ=255) | CGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATCACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTTAAACTTGCACGTCAGGCT > NZ_CP025268/3341136‑3341409 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |