Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,439,827 | T→C | *123* (TAA→TAG) | yhdN ← | DUF1992 domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,439,827 | 0 | T | C | 99.8% | 2004.0 / NA | 576 | *123* (TAA→TAG) | yhdN | DUF1992 domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (342/233); minor base A (0/1); total (342/234) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.06e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 576 total aligned reads displayed.
TTTCGGTATATAGGCGAAACCCACCTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCATTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGATCATCGT > NZ_CP025268/3439690‑3439963 | tataGGCGAACCCCTAAGTCAGTAAGCTCTTCATGCTCCATCATCTGCTCTTTATGGTTCTTACGAATCGTGTCGGCTGTTACTTCCGCCATTATTTCCAGCTCACGATTGAGTTTAATAAATAATCCACTCGTTATcct < 2:3281169/140‑3 (MQ=255) taGGCGAAACCCACCTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTCGTTATCGTTg > 2:10139402/1‑140 (MQ=255) cGAAACCCACCTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGAttt > 1:3130552/1‑140 (MQ=255) aaaCCCACCTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTg > 1:10514679/1‑140 (MQ=255) aaaCCCACCTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTg > 1:8002668/1‑140 (MQ=255) aaaCCCACCTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTg > 1:3829471/1‑140 (MQ=255) aaaCCCACCTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTg > 1:3274168/1‑140 (MQ=255) aaaCCCACCTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTg > 1:1257418/1‑140 (MQ=255) aaaCCCACCTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTg > 2:8506961/1‑140 (MQ=255) aCCCACCTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTc > 1:11381453/1‑140 (MQ=255) aCCCACCTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTc > 1:5037421/1‑140 (MQ=255) cccACCTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTcc < 1:2996652/140‑1 (MQ=255) cTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCcaacaa < 1:1151830/140‑1 (MQ=255) cTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCcaacaa < 1:6645868/140‑1 (MQ=255) ttCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATATTTGCCAGCTCTCCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCAaacaac > 2:6726225/1‑140 (MQ=255) cAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATATTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTACAACAACtt > 2:10998048/1‑140 (MQ=255) gTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATCACGAATCGTGACGGGGGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGt < 2:10832155/140‑1 (MQ=255) gTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGt < 1:10839349/140‑1 (MQ=255) tACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTc < 2:7321287/140‑1 (MQ=255) cGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAg > 1:10956486/1‑140 (MQ=255) cACTTCTTGCTCCATAATATGCTGTTTTTATTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTAATTCCGCGATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATCCATACTCCACTAGTTATCGTTGATATTGTACAACAACTAGTCAGCa > 2:2003790/1‑140 (MQ=255) cACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGcg > 1:7264624/1‑139 (MQ=255) cACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCa > 2:1807374/1‑140 (MQ=255) aCTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCAt > 1:5535601/1‑140 (MQ=255) aTGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATcg > 2:2494525/1‑140 (MQ=255) cTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATcgccg > 2:7590045/1‑140 (MQ=255) ccATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATGGTGTCGGGTGTTACTTCCGCAATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCGACAACGTGTGAGCATATTCgcggcg > 1:8974538/1‑140 (MQ=255) atcatcTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTa > 1:3669882/1‑140 (MQ=255) atcatcTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTa > 2:1653342/1‑140 (MQ=255) atcatcTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTa > 2:9641200/1‑140 (MQ=255) atcatcTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTa > 2:4594118/1‑140 (MQ=255) tcatcTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTaa < 2:5810292/140‑1 (MQ=255) atcTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTaaaa < 1:5328920/140‑1 (MQ=255) atcTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTaaaa < 2:3131479/140‑1 (MQ=255) tcTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTaaaaa > 1:6451891/1‑140 (MQ=255) tgctgTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAAt < 2:9841932/140‑1 (MQ=255) gctgTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATc > 1:11185214/1‑140 (MQ=255) gctgTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATc > 2:545105/1‑140 (MQ=255) ctgTTTTTCGTAATCACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCg > 1:2590690/1‑140 (MQ=255) ctgTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCg < 2:5026303/140‑1 (MQ=255) tttttCGTAATCACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTa < 2:6555703/140‑1 (MQ=255) tttttCGTAATCACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTa < 1:2095619/140‑1 (MQ=255) tttttCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTa < 2:6893136/140‑1 (MQ=255) tttttCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTa < 1:871973/140‑1 (MQ=255) tttttCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTa < 2:10097674/140‑1 (MQ=255) tttttCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGGTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTa < 2:1319884/140‑1 (MQ=255) ttttCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGATCACCAAAGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGGAAAAAATCGGTaa > 2:4760696/1‑139 (MQ=255) tttCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACt < 1:7081632/140‑1 (MQ=255) tttCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACt < 1:4187482/140‑1 (MQ=255) tttCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACAGACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACt < 2:83616/140‑1 (MQ=255) cGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCaa > 1:9613626/1‑140 (MQ=255) ataaCGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTGGGCCAGCTCACCAATGCGATACATACCTACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCa < 2:6432802/140‑1 (MQ=255) tCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCg < 1:4334945/140‑1 (MQ=255) cGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGc < 2:3626149/140‑1 (MQ=255) tgtCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAg > 1:7677739/1‑140 (MQ=255) tCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCt > 1:9156467/1‑140 (MQ=255) tCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCt > 2:3490590/1‑140 (MQ=255) gtTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTTATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAAtt < 1:2389543/140‑1 (MQ=255) gtTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAAtt < 1:4727063/140‑1 (MQ=255) gtTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAAtt < 2:706020/140‑1 (MQ=255) tACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTcc > 1:2820342/1‑140 (MQ=255) aCTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCa > 1:4045299/1‑140 (MQ=255) cTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAg > 2:1507531/1‑140 (MQ=255) tCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTa < 2:4492496/140‑1 (MQ=255) gCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATg > 1:8284792/1‑140 (MQ=255) gCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCt < 1:1538644/140‑1 (MQ=255) gCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCt < 2:2230051/140‑1 (MQ=255) gCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCt < 1:9369972/140‑1 (MQ=255) gCTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCt < 1:11291539/140‑1 (MQ=255) ccTCACCCATGCGATACAAACAGACTCCACTAGTTCACGTAGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCt < 1:9793082/139‑1 (MQ=255) cTCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTa < 2:8922575/140‑1 (MQ=255) tCACCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTaa < 2:4352067/140‑1 (MQ=255) aCCAATGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAAcc > 1:5669940/1‑140 (MQ=255) aaTGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACctct < 1:5858743/140‑1 (MQ=255) aaTGCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACctct < 2:5620882/140‑1 (MQ=255) gCGATACATACATACTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGa < 2:4033952/140‑1 (MQ=255) cGATACATTCATACTCGTCTAGTAATCGTTGATTTTGTCCATCCACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAGAATCGGTCCTCAATGCAGCGTGTCGCAGCGTCAAGTCCTGTATTGTCAATCGACGGCTATCGTCTTgtt > 2:3702653/1‑138 (MQ=255) gATACATACATACTCCACTAGTGATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGata < 1:6857921/140‑1 (MQ=255) atacatacatacTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGatat < 2:3826754/140‑1 (MQ=255) tacatacatacTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGa > 2:2380866/1‑136 (MQ=255) tacatacatacTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATAtt > 1:6227538/1‑140 (MQ=255) tacatacatacTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATAtt > 2:3021114/1‑140 (MQ=255) catacatacTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGc > 2:8677900/1‑140 (MQ=255) tacatacTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCCGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCgg > 2:7837895/1‑140 (MQ=255) acatacTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGa > 1:10076641/1‑140 (MQ=255) acatacTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGa > 2:10633656/1‑140 (MQ=255) catacTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGat > 2:6048687/1‑140 (MQ=255) catacTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGat < 1:851320/140‑1 (MQ=255) atacTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGatc > 2:2886280/1‑140 (MQ=255) atacTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGatc > 2:8114134/1‑140 (MQ=255) acTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGatcat > 1:8408033/1‑140 (MQ=255) cTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCTCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGatcatc > 2:2538669/1‑140 (MQ=255) cTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGatcatc > 1:1939293/1‑140 (MQ=255) cTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGatcatc > 1:1797987/1‑140 (MQ=255) cTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGatcatc > 2:9156685/1‑140 (MQ=255) cTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGatcatc > 2:9433737/1‑140 (MQ=255) cTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGatcatc > 1:7921867/1‑140 (MQ=255) cTCCACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGatcatc > 1:745369/1‑140 (MQ=255) cTCCACTAGTTATCGTTGATAATGTCCAACAACTTGTCAGCATAATAGCCGCGAAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGACGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCAAGATATAGCGGatcatc > 2:11323534/1‑140 (MQ=255) ccACTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGATCATCGt > 1:2224239/1‑140 (MQ=255) | TTTCGGTATATAGGCGAAACCCACCTTCAGTACGCACTTCATGCTCCATCATCTGCTGTTTTTCGTAATAACGAATCGTGTCGGGTGTTACTTCCGCCATTTTTGCCAGCTCACCAATGCGATACATACATACTCCATTAGTTATCGTTGATTTTGTCCAACAACTTGTCAGCATAATCGCCGCGTAAAAAATCGGTACTCAATCCAGCTTGTCGCAGCTTCAATTCCAGTAATGACAATCGACGGCTAACCTCTTGATATTGCGGATCATCGT > NZ_CP025268/3439690‑3439963 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |