Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,728,808 | (C)10→8 | pseudogene (1254‑1255/1457 nt) | xylB ← | xylulokinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,728,800 | 0 | C | . | 89.2% | 345.4 / 35.0 | 93 | pseudogene (1263/1457 nt) | xylB | xylulokinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (7/3); new base . (48/35); total (55/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.19e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | NZ_CP025268 | 3,728,801 | 0 | C | . | 89.5% | 293.6 / 49.2 | 93 | pseudogene (1262/1457 nt) | xylB | xylulokinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base . (42/35); minor base G (9/0); total (55/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.38e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATCCCCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGACATCCA > NZ_CP025268/3728661‑3728933 || ggCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATc < 1:2060953/140‑1 (MQ=255) cTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccg > 1:283119/1‑139 (MQ=255) tAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccccccc < 2:2468919/140‑1 (MQ=255) aGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccccccccg < 1:66278/140‑2 (MQ=255) ggCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccccccccgtac < 1:2042413/140‑5 (MQ=255) ggCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccccccccgtac < 2:3478954/140‑5 (MQ=255) gCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccgccgccgggcg > 2:594662/1‑135 (MQ=255) aTAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccccccccgtacggt < 1:601842/140‑8 (MQ=255) cGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATc > 1:2683367/1‑140 (MQ=255) tGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAg < 2:2726798/140‑1 (MQ=255) tGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCAC‑T‑GGCCCCCCCGTACGGtctgggtg > 1:3719690/1‑133 (MQ=255) tGCGCATCTGGAAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGAACGGGAATCGAg > 1:845925/1‑140 (MQ=255) gcATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAgctg < 1:2153321/140‑1 (MQ=255) gcATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAgctg < 1:2154597/140‑1 (MQ=255) cATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACA‑‑GCCCCCCCCGTGCGGTACTCGAgctgc > 2:4179919/1‑140 (MQ=255) cATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCACCAT‑‑CCCCCCCCGGCCGGTCATCGAgctgc > 2:4179970/1‑140 (MQ=255) cTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGa < 2:6189442/140‑1 (MQ=255) tAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGc < 2:4996827/140‑1 (MQ=255) tAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCACCCGTACGGTAATCGAGCTTCTGACCGc < 2:4058691/140‑1 (MQ=255) aTGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACGT‑‑CCGCCCCCGGCCGGTACTCGAGCTGCGGAgcgcggt > 1:5298436/1‑137 (MQ=255) gCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGata < 1:5265872/140‑1 (MQ=255) gACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCAC‑‑CTCCCCCCCCGTACGGTACTCGAGCTGCTGACCGCTGAtctc > 2:6178623/1‑140 (MQ=255) gACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCAC‑‑CGCCGCCCCCGGACGGGCAGCGGGCTGCTGACCGCGGAGATc > 2:6178832/1‑140 (MQ=255) aCTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACA‑‑GCCCCCCCCGTGCGGTTATCGAGCTGGTGACCGCGGATGTcc > 2:598115/1‑140 (MQ=255) aCTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCAC‑‑CTCCCCCCCCGTGCGGTGGGCGTGCTGCTGGCCGCTggggtgc > 1:5010870/1‑134 (MQ=255) cTGGTCTAACGGTAGTTGCGGCACCACTTCAATGAGCGATTGCTCTGGCTGCGCCGCGAGCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCCCA‑‑GGCGCCCCCGTACGGGAGGCGAGCGGCGGACCGCGGAGGTCCg > 2:2744405/1‑140 (MQ=255) aCGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCAC‑‑CGCGGCGCCCGGACGGGTATGGGGCTGCTGGCCGCTGATTGCCGCCAGCCTc > 1:166655/1‑140 (MQ=255) cGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCt < 2:2060475/140‑1 (MQ=255) gTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACGT‑‑CCCCCCCCGGACGGTGAGCGCGCTGCTGGCCGCTGGTGTCCGCCGGCAGCTgg > 1:4428449/1‑139 (MQ=255) gTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGa < 2:2147524/140‑1 (MQ=255) aGTTGCGGCAACAATTCATTGAGCGATTTCTCTGTATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCACCCCCGTCCGGTCATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACg > 2:1723679/1‑140 (MQ=255) aGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CGCCCCCCGGAGGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATTTCCGCCAGGTTCTGACg > 1:4196454/1‑140 (MQ=255) aGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGGCCGCGGATATCCGCCCGCCGCTGACg > 1:2797293/1‑140 (MQ=255) aGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACg < 1:6088016/140‑1 (MQ=255) aGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGGAAGCGGGCTGCGGACCGCGGATATCCGCCAGCATCTGACg > 2:2530639/1‑140 (MQ=255) aGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGGACGGTAATCGAGCTGCGGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACg > 1:2796862/1‑140 (MQ=255) aGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGGACGGGCATCGAGCTGGGGACCGCTGATGTCCGGCAGCATCTGACg > 1:6069459/1‑140 (MQ=255) aGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCACCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCATCAT‑‑CCCCCCCCGTTCGGGATTCGAGCTGCTGACCGATGATATCAGCAAGCATCTGACg > 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ttGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGa > 1:661602/1‑136 (MQ=255) gCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCAAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAg < 1:1780546/140‑1 (MQ=255) cGGCAACAATTCAATGAGCGAATTCTCAGGATTCGCCGCGAACTGCGCCAGCCTTGATGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGGACGGTAATCGAGCTGCTGCCCGCTGATCGCCGCCAGCAGCGGACGcccgg > 2:105648/1‑137 (MQ=255) gCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTGCGGTAATCGAGCTGCTGTCCGCTGATGTCCGCCAGCATCTGACGCCGGTAc > 2:5846334/1‑140 (MQ=255) taGCGATTTCTCTGGATTCGCAGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGTTAATCGAGCTGCTTAACGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCATTACTCACTACGcgccc < 2:1432569/139‑1 (MQ=255) gAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGCGCGGCTGACCGCGGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGcgccc < 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aTTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGcgccccgccc < 2:5761858/140‑1 (MQ=255) tttCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGGACGGTAATCGCGCTGCTGAGCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCGAGTACTCACTACGcgccccgccgc > 1:1192203/1‑138 (MQ=255) tctcTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCa < 1:2031714/140‑1 (MQ=255) tctcTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCa < 1:2031744/140‑1 (MQ=255) tctGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAAt < 2:3461363/140‑1 (MQ=255) tctGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAAt < 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ccTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGTCCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCC‑ATCAACGTACCACTTTGCGGTTTAATAcc > 2:1054952/1‑140 (MQ=255) ccTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCAGCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAAttc > 1:984466/1‑138 (MQ=255) gctgcGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCAGCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGGAACACTTTGCGGGTTAATACCGCa > 2:3764061/1‑140 (MQ=255) gctgcGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCGGTTTTCGGCCTGCATCTGACGCCCGGACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAAGCAACGTAACACGTTGCGGTTTAAGACCGCa > 1:1464569/1‑140 (MQ=255) gctgcGCCCAGTGCTGGCCCCACA‑‑GCCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGGTGACCGCGGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCa > 2:3347760/1‑140 (MQ=255) ctgcGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCACCCGTACGGTAATCGAGCTGATGACCGCTGATATCCGCCAGCAACTGACTCCAGTACTCACTACGCGCACCGCCCCCAATCAACTTAACACTTTGCGTTTTAATACCTCAg < 2:3863486/140‑1 (MQ=255) cgcCCAGTGCTGGCCCCCCAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCa < 2:222717/140‑1 (MQ=255) cgcCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCa < 1:594662/140‑1 (MQ=255) cgcCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCa < 1:4333150/140‑1 (MQ=255) aGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTCCGGGACTCGTGCTGCTGGCCGCGGATCTCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTGGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCAc > 1:6242713/1‑140 (MQ=255) aGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCCATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAAGACCGCAGGCATGccc < 2:4936049/140‑3 (MQ=255) tGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTCATCGTGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATATGACGCCAGTACTCACTCCGCGCCCCGCCCCCATTCAACGTAACACTTTGCGGGTTATTGCCGCAGGCATGCACGa > 1:1899180/1‑140 (MQ=255) tGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGGCCGCTGGTATCCGCCAGCATCTGTCGCCAGTACTCACGACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGGAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGa > 1:2349610/1‑140 (MQ=255) tGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGGAATCGAGCTGCTGACCGCGGATATCCGCCAGCCTCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCACTCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGa > 1:2349466/1‑140 (MQ=255) cgggCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGTGCTGCTGACCGCGGTTATCCGCCAGCATATGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCGATTCAACGGACCACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGACa < 2:1548436/138‑1 (MQ=255) ggCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGTCCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGGTTAATACCGCAGGCATGCACGACATc > 1:3132526/1‑140 (MQ=255) gCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTACTCGCGCGGCTGTCCGCTGATAGCCGCCAGCAGGTGACGCCTGGACTCACTACGCGCCCCGCCCCCACTCAACGGAACGCTTTGCGGGTTAATACCGCAGGCATGCACGACCTcc > 2:6429823/1‑140 (MQ=255) gCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGGTATCCGCCAGCATCAGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGACATca > 2:2706091/1‑139 (MQ=255) gCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGACATcc > 2:1468584/1‑140 (MQ=255) gCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAAAACCGCAGGAATGCACGACATcc > 2:2432287/1‑140 (MQ=255) gCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCGGACGCCAGGACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACATTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGACATcc > 2:525557/1‑140 (MQ=255) gCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCGGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTTCGCGCCCCGCCCCCAAGCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGACATcc > 2:2632198/1‑140 (MQ=255) gCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGGAATCGAGCTGCGGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGACATcc > 1:449752/1‑140 (MQ=255) ccccACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGACATCCa < 2:3402561/140‑1 (MQ=255) || GGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATCCCCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGACATCCA > NZ_CP025268/3728661‑3728933 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |