Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 4,270,410 | (T)8→7 | intergenic (+181/+322) | tyrB → / ← CXP41_RS22090 | aromatic amino acid transaminase/protein YjbS |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 4,270,403 | 0 | T | . | 85.2% | 324.9 / 61.3 | 101 | intergenic (+174/+329) | tyrB/CXP41_RS22090 | aromatic amino acid transaminase/protein YjbS |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/15); new base . (8/78); total (8/93) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.08e-01 |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGA > NZ_CP025268/4270265‑4270538 | tGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGtt < 2:1878642/140‑1 (MQ=255) tGAAATTAAACTGTCGTCGCTGTCACTCTTTCTTTATAGATGATATTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGtt < 1:3334199/140‑1 (MQ=255) aaCTGTCGTCTCTTTCACTCTTTATTTATAGATGATTTTTTTGATGCCCTCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTggg < 1:1185420/140‑1 (MQ=255) aaCTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTggg < 1:3788233/140‑1 (MQ=255) 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ttAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCt < 2:1149668/140‑1 (MQ=255) ttttATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCt < 1:1193422/140‑1 (MQ=255) ttttATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCt < 1:5158128/140‑1 (MQ=255) gcgtATCCCAATTATCTGGAATTCCTGATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCt < 1:6293920/137‑1 (MQ=255) gCTTCTCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCt < 1:2533426/140‑1 (MQ=255) gCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCt < 2:4185625/140‑1 (MQ=255) ttATCCCAATTATCTGGAATTCCTTCTCCTG‑GTTTATTGGGTTGATTAATAATTTCTGCACATCTACACATTATTATATCTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTAAGATAGAATCTTTCTATAGCCTCAAGAATATGCttt < 2:5768108/140‑1 (MQ=255) aTCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTaataat > 1:5865520/1‑51 (MQ=255) aTCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTaataat < 2:5865520/51‑1 (MQ=255) cAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTa < 2:150950/140‑1 (MQ=255) cAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTa < 1:4585772/140‑1 (MQ=255) cAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTa < 1:4585302/140‑1 (MQ=255) cAATTATCTGGAATTCCTGATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCTTTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTa < 2:5832216/140‑1 (MQ=255) tCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCt < 1:1413292/140‑1 (MQ=255) aTTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCTAATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACt < 1:6008950/140‑1 (MQ=255) tCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTACTAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTGTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTgaga < 2:5888862/140‑1 (MQ=255) | TGAAATTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCTGTGACTTTCTGAGA > NZ_CP025268/4270265‑4270538 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |