Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 1,013,520 | +G | pseudogene (463/542 nt) | zapC → | cell division protein ZapC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,013,518 | 1 | . | G | 97.8% | 1102.8 / 14.3 | 322 | pseudogene (461/542 nt) | zapC | cell division protein ZapC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/4); new base G (150/165); total (153/169) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 352 total aligned reads displayed.
TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑T‑G‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013380‑1013651 | tGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑T‑g > 1:4523467/1‑140 (MQ=255) tGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑T‑g > 1:1429781/1‑140 (MQ=255) tGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTGGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑T‑g > 1:572144/1‑140 (MQ=255) gggCGATGCCGACTGCGAAAGGTAGCGCCATACTCACTAGCAGGTCAATTAGATGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGACGCACTATGCCTGCTGGCACAAACATGAGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGAGGCA‑G‑T‑T‑g‑ggcg > 2:3946695/1‑137 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑T‑g‑ggcga < 2:3111586/140‑5 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑T‑g‑ggcgac < 1:6069125/140‑6 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑T‑g‑ggcgac < 2:6179972/140‑6 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑T‑g‑ggcgac < 2:4441028/140‑6 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGATAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCa > 1:681493/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCa > 2:115296/1‑140 (MQ=255) cgCGGCCAGCGTTTGGCTGATCGATACTCACGAGCAGGTCAAATAGCTGGACGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTAGGCCTGCTGGAACACCCCTGCGTTGTTATAGCTGCTAGCGCGATGAA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCa < 2:466937/139‑1 (MQ=255) gCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCAt > 1:5273813/1‑140 (MQ=255) ggCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTa < 1:1016085/140‑1 (MQ=255) cTGCGTTTGGTTGAGAGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTaaaa < 2:5063488/140‑1 (MQ=255) gTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCATTTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGTTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCAATTAAAATCAt < 1:3929685/140‑1 (MQ=255) gTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCAt < 1:1905408/140‑1 (MQ=255) gTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCCATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCTGGACGCGCGCTGCAGG‑T‑G‑G‑GCGACGCCATTATAAGCATGaagg > 2:4900403/1‑138 (MQ=255) ttGAGCTATACTCACTAGCAGGTCTATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATTCTGCACTATGACTGCTGTCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGTTCGCGCGTTGCA‑GTT‑T‑G‑GCGACGCAATTAAAATCATGAACGa < 2:1767071/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:5154775/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAAGTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:479131/140‑1 (MQ=255) tgcccGATACTCACTAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCGGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCGGCGTTGTTATTGCGGGTGGCGCGATGCA‑T‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAACTCATGATCgcc < 2:5786642/136‑3 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 2:1662804/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 1:4588122/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 2:3005896/1‑140 (MQ=255) 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gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 2:4800549/140‑1 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:6314004/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:883628/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:5832233/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:2251070/1‑140 (MQ=255) 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cAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATg > 1:2999536/1‑140 (MQ=255) tggCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAACTGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGa < 2:5893007/138‑1 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 2:2977194/1‑140 (MQ=255) tGGTCGGTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACACCCCTGCGGTGTTCTTGCGGGTCGCGCGATGCAGG‑G‑G‑G‑GCGACGCCATTAAAATCGTGACCGTCAGGCTGAATCCGCGGGGTAATGGTGACCGc > 2:4168186/1‑140 (MQ=255) ggTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGACCGCCAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCt < 2:2668491/140‑1 (MQ=255) ggTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCAGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCt > 2:1907084/1‑140 (MQ=255) gTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 2:5271062/140‑1 (MQ=255) ttGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGc < 1:4666705/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 1:5089503/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 1:6128013/140‑1 (MQ=255) 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cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt > 1:3295157/1‑140 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt > 1:4420688/1‑140 (MQ=255) tgggtggttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATGAAAAGGCTGAACGACAGGCTGAAAGCGCTGGTTAGTGTTGTCCGCTTCCGCCTCGAACAGGCAGTGTGACGCGCGCCCTTACGTGCAGTCTTCgg > 2:1083491/7‑140 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 2:3414977/140‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 1:779132/140‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTGAAGTGCAGTCTTCGGTa > 2:2335581/1‑140 (MQ=255) ttgatcttGCGGGACGCGCGATGCA‑G‑T‑T‑GCGCGACGCCATTAAAATCCTGACCGACAGGCAGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTGAAGGGCCGTCTGCGGGaca < 2:131776/134‑1 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:3233354/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:3621518/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:5903179/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:1432850/1‑140 (MQ=255) aTTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCt < 1:1998846/140‑1 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 2:5576270/1‑140 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 1:3270416/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 1:3106004/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 2:601074/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 1:948026/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGCCAGGCTGAAACCGCAGGTTCATGTTGACAGCTTCAGCCTCGACCAGGCAGTCTAACGCGCCCCCTTAAGTGCAGTCTTCGGTCCCCAGCTACCGCaaa > 2:3448292/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 2:5636967/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:3314733/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:401999/1‑140 (MQ=255) cgcgcgATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAg > 1:5221924/1‑140 (MQ=255) gcgcgATGCA‑G‑TGG‑G‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGa < 2:5339427/140‑1 (MQ=255) cgcgATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGACCCGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa < 2:5558436/140‑1 (MQ=255) cgcgATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACCGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa > 2:624489/1‑140 (MQ=255) cgcgATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa > 1:463208/1‑140 (MQ=255) cgcgATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGATGGTTATTGTGGACAGCTTCCGCCTCGAACAGGCAGGCGAACGCGCCAGCTTGAGTGCAGTCGTCGGTACACAGCTCCAGCAAAGaa > 2:6374799/1‑140 (MQ=255) cgATGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATg < 1:2924152/140‑1 (MQ=255) tGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGTACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTg < 2:202370/140‑1 (MQ=255) tGCA‑G‑T‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTg < 1:4148808/140‑1 (MQ=255) | TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑T‑T‑G‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013380‑1013651 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |