Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 2,033,768 | (C)5→6 | pseudogene (190/920 nt) | yedA → | drug/metabolite exporter YedA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 2,033,763 | 1 | . | C | 97.0% | 1455.6 / 34.0 | 429 | pseudogene (185/920 nt) | yedA | drug/metabolite exporter YedA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (8/5); new base C (204/212); total (212/217) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.12e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 480 total aligned reads displayed.
TGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑CC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCC > NZ_CP025268/2033625‑2033897 | gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTCTTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc > 2:5922075/1‑140 (MQ=255) gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc > 1:6210400/1‑140 (MQ=255) tataTCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc‑c < 1:3318612/140‑1 (MQ=255) atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc‑cc > 2:1505877/1‑140 (MQ=255) atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc‑cc > 1:4230941/1‑140 (MQ=255) atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc‑cc > 1:6189177/1‑140 (MQ=255) aTTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc‑ccccgct < 2:1902035/140‑5 (MQ=255) ttGGGGCTCACCCTATTTGGTCATGCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCGCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTAc < 2:6315026/140‑1 (MQ=255) ttGGGGCTCAACCTATTTGGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTAc < 1:981370/140‑1 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGt > 1:3210380/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGt > 1:6303343/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGt > 1:3154392/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGt > 2:394704/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGt > 1:5554517/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGt > 2:5037483/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGt > 1:5855028/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGt > 2:5381866/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGt > 2:4377053/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGAAACTAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGt > 2:1032054/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGAGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGt > 2:6383593/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTAAATGATGTCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGt > 2:2134608/1‑140 (MQ=255) gggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTc < 2:1248948/140‑1 (MQ=255) gCTCATCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCg < 1:1938508/140‑1 (MQ=255) aaCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGAGGGCGTTCGATTCATGGCGGCCGGGATGTTATTGCTGGCATTTGTGCTTCTGCGCGGAGACAATC‑TCCC‑CCC‑GCTAGGTCCgctgc > 2:5649828/1‑140 (MQ=255) aCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCgctgct < 1:3095851/140‑1 (MQ=255) ttttGTCAGTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATg < 2:4453115/140‑1 (MQ=255) gTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc > 2:1573407/1‑140 (MQ=255) cATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCgcgc > 1:4055609/1‑140 (MQ=255) aTTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCt > 2:3020622/1‑140 (MQ=255) cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt > 2:2963279/1‑140 (MQ=255) cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt < 1:2036847/140‑1 (MQ=255) gATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTg < 2:65790/140‑1 (MQ=255) aTTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTgg < 2:1091074/140‑1 (MQ=255) tGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGcc > 2:307342/1‑140 (MQ=255) tGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGcc > 2:3632420/1‑140 (MQ=255) ggCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCt > 2:5241223/1‑140 (MQ=255) gCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTg < 1:1147059/140‑1 (MQ=255) cGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGt > 2:1687665/1‑140 (MQ=255) aaaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTg > 1:2388189/1‑140 (MQ=255) cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg < 1:3428879/140‑1 (MQ=255) cTGGCCTACGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTCTTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCCATGCCGCGCTGATTGGCGTGGTATTgctgg > 2:4965264/1‑140 (MQ=255) tGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggc > 1:1021003/1‑140 (MQ=255) tGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggc < 1:918213/140‑1 (MQ=255) tGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggc > 1:4857371/1‑140 (MQ=255) ggCCTCCGTTACTGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct < 1:3665070/140‑1 (MQ=255) ccTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGt < 2:3157082/140‑1 (MQ=255) tCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCg > 2:4823567/1‑140 (MQ=255) cGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTAGGTGATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCGACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGt > 2:5089355/1‑140 (MQ=255) ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 2:2810360/1‑140 (MQ=255) ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 1:765191/1‑140 (MQ=255) ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 2:910014/1‑140 (MQ=255) ttCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGtt > 1:4372191/1‑140 (MQ=255) aTTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCg < 1:1664154/140‑1 (MQ=255) ttCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCAATTGAGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAGTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGa < 2:3626659/140‑1 (MQ=255) cTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACa < 1:4730272/140‑1 (MQ=255) ggCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTATTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGACCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGATATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATc > 2:5559136/1‑140 (MQ=255) aTTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCg > 1:5466720/1‑140 (MQ=255) ttGCTGGCAGTTTTGCTACTGCGCGGACACCAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCgg > 2:1360002/1‑140 (MQ=255) tGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGc > 1:1217535/1‑140 (MQ=255) cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAATCTGTTCCTTCCGGCag > 2:3843529/1‑139 (MQ=255) cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 1:3596506/1‑140 (MQ=255) cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt < 1:4316346/140‑1 (MQ=255) cTGGCATTTGTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGAGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt < 1:568579/140‑1 (MQ=255) cTGGCATTATTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCACTGCCGCGCTGATGGCCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt < 2:2265853/140‑1 (MQ=255) ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACGC‑CC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGACCATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcg < 2:4238860/140‑1 (MQ=255) ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcg > 1:2995742/1‑140 (MQ=255) ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcg > 2:5807943/1‑140 (MQ=255) ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcg < 1:5242224/140‑1 (MQ=255) tttttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgccgc < 1:4499787/140‑1 (MQ=255) tttttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgccgc < 2:3355497/140‑1 (MQ=255) tttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGccgccg < 1:2576265/140‑1 (MQ=255) tGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 1:5037483/140‑1 (MQ=255) tGCTACTGCGCGAACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 1:63568/140‑1 (MQ=255) cTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGt < 2:3278016/140‑1 (MQ=255) cTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGt < 2:6031030/140‑1 (MQ=255) aCTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa > 1:4622208/1‑136 (MQ=255) cTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGt > 1:2878546/1‑140 (MQ=255) tGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCGGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGtt > 1:2711419/1‑140 (MQ=255) gcgcGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTg > 2:5325681/1‑140 (MQ=255) gcgcGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTg > 2:1940433/1‑140 (MQ=255) gcgcGGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTg > 1:3825389/1‑140 (MQ=255) cgcgGACACCCAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAGTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAACATGTTCCTTACGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGc < 2:2391914/140‑1 (MQ=255) cgcgGACACAATC‑T‑CCGCCC‑GCTACGTCCGCTGCTCTATGCCGCGCTGAGTGGGCTGTTATTGATGGCTGTCGGTGCTGGCATGGTGACGGTTGCCGACCCTCTAAATGTGCCTTCCGGGAGCGCCGCGGTAGTGGGTGc > 2:3049734/1‑140 (MQ=255) cgcgGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGc > 1:6095309/1‑140 (MQ=255) cgGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAATTGTTCCTTCCGGCCTCGCCGCCGTAGTGGTTGCaa > 2:548865/1‑140 (MQ=255) cgGACACAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCaa > 2:4647333/1‑140 (MQ=255) acacAAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCg > 2:6260205/1‑140 (MQ=255) acaAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCggg < 2:4062194/140‑3 (MQ=255) acaAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTg < 2:1189594/140‑1 (MQ=255) acaAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTg < 1:2134608/140‑1 (MQ=255) acaAAC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTg > 2:2573277/1‑140 (MQ=255) caaC‑T‑CC‑CCCAGCTACGTCCGCTGCTCATTGCCTCGCTGATTGTCCTGTTATTGGTTGCTGTCGGTAATTGCATGTTGAAGGTTGCCGAACATCTAAATGTTCCTTACGGAATCGCCTCCGTAGTGGTTGCAACCGTgag < 2:4193309/139‑3 (MQ=255) aaaC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 1:3986254/140‑1 (MQ=255) aaaC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 1:4932565/140‑1 (MQ=255) aaaC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 2:2755548/140‑1 (MQ=255) aaaC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 1:1551763/140‑1 (MQ=255) aaaC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 1:5381887/140‑1 (MQ=255) aaaC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 2:5847080/140‑1 (MQ=255) aaaC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 1:2809794/140‑1 (MQ=255) aaaC‑TCCC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAAGGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCGGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 2:880578/140‑1 (MQ=255) | TGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑CC‑CCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCC > NZ_CP025268/2033625‑2033897 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |