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gCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTAc > 1:2762319/1‑140 (MQ=255) tCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTg < 1:4411619/140‑1 (MQ=255) aCGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGt > 1:385288/1‑140 (MQ=255) aCGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGt > 1:5601687/1‑140 (MQ=255) aCGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGt > 1:5238853/1‑140 (MQ=255) ccccccTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGc < 1:858880/140‑1 (MQ=255) tctTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGc < 2:5385176/140‑1 (MQ=255) tGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCaa < 1:456020/140‑1 (MQ=255) tGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATAGCGTAATCGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCaa > 1:2290129/1‑140 (MQ=255) tAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACa > 2:3455582/1‑140 (MQ=255) aaTAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATc > 2:4192659/1‑140 (MQ=255) aaTAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATc > 2:3289550/1‑140 (MQ=255) aTAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTACTGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATcc < 1:4932738/140‑1 (MQ=255) | TGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGTTACT‑TACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCC > NZ_CP025268/2828377‑2828646 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |