| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 3,851,710 | 1 | . | C | 98.8% | 1164.1 / 4.8 | 335 | pseudogene (349/1502 nt) | uhpB | signal transduction histidine‑protein kinase/phosphatase UhpB |
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Only 100 of 393 total aligned reads displayed.
GGCGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCC‑G‑CC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGTTAGCCAGT > NZ_CP025268/3851571‑3851844 | ggCGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAAcgcc‑g < 1:117861/140‑1 (MQ=255)ggCGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAAcgcc‑g < 1:5548137/140‑1 (MQ=255)ggCGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAAcgcc‑g < 1:4531173/140‑1 (MQ=255)ggCCAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCTTTCCCCGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCACCACCGCCGCCGCCGTTAAcgcc‑g < 1:3670755/140‑1 (MQ=255) 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2:398385/140‑1 (MQ=255) cGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCC‑GCCC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATggg > 2:3733633/1‑140 (MQ=255) cGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCC‑GCCC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATggg > 1:3230112/1‑140 (MQ=255) gACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCC‑GCCC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGt < 1:3527026/140‑1 (MQ=255) cTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCC‑GCCC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTa < 2:119229/140‑1 (MQ=255) gCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCC‑G‑CC‑CGCGGTTACCGCAAGGTGCGCCAGTGACGCTGATGGCGATAGCGCGAGAGCCGCGCGACGGGCAGTAACGTCCGTAAACTACCGATCATCAAGTACGGAACTTGGGttctc > 2:5635975/1‑137 (MQ=255) caacGCCGCCGCCGTTAACGCC‑GCCC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGAGAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAaccga < 2:3276096/140‑1 (MQ=255) ccgccgccgTTAACGCC‑GCCC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAgcgc > 1:4280787/1‑65 (MQ=255) ccgccgTTAACGCC‑GCCC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGc > 2:2112732/1‑140 (MQ=255) gccgTTAACGCC‑GCCC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGt < 1:5896437/140‑1 (MQ=255) ccgTTAACGCC‑GCCC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGtt < 2:4228120/140‑1 (MQ=255) cgTTAACGCC‑GCCC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGTTa < 1:1723965/140‑1 (MQ=255) tAACGCC‑GCCC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGTTAGcc < 2:2374812/140‑1 (MQ=255) tAACGCC‑GCCC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGTTAGcc < 2:1111808/140‑1 (MQ=255) | GGCGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCC‑G‑CC‑C‑CTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGTTAGCCAGT > NZ_CP025268/3851571‑3851844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |