| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 1,161,210 | A→G | *270* (TAA→TAG) | pabC → | aminodeoxychorismate lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,161,210 | 0 | A | G | 98.5% | 1344.9 / NA | 396 | *270* (TAA→TAG) | pabC | aminodeoxychorismate lyase |
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Only 100 of 396 total aligned reads displayed.
GAGTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTG > NZ_CP025268/1161073‑1161344 | gTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATTCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTAGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCAt > 1:4344626/1‑140 (MQ=255) tCGTTGCAGGCAGATTAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATTCCAGTGATGCCCCTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAAAATTTATCCCCACATTGTGAGCGCCCGAATTAGTAATg > 2:2007376/1‑140 (MQ=255) tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATTCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTAGTCAGCCACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATg > 1:1139981/1‑140 (MQ=255) tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATTCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATAAGTCaag > 2:2958480/1‑138 (MQ=255) 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tttGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAgaga < 2:365966/140‑1 (MQ=255) ttagtgAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGAATCGCCGCTGGTGTGGTCTACTGGAAGGTTCTCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAgaga > 2:909378/4‑140 (MQ=255) ttGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGAc < 2:3144853/140‑1 (MQ=255) ttGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGATATGGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGAc < 2:2464756/140‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACg > 2:4828870/1‑140 (MQ=255) tgtgAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACg > 1:4624870/1‑140 (MQ=255) tgtgAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTAATGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACg > 2:4530841/1‑140 (MQ=255) aGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGatat < 1:3897551/140‑1 (MQ=255) aGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGatat < 2:4348784/140‑1 (MQ=255) gcgcCCGAATTAGTCATGAAAATAGTGTTAGTGATAATCTAGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGAGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATAtt < 2:3077510/140‑1 (MQ=255) cgcCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATAttt > 1:60387/1‑140 (MQ=255) cgcCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATAttt > 2:1401514/1‑140 (MQ=255) cccGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTAc > 1:1504979/1‑140 (MQ=255) cccGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTAc > 2:1370363/1‑140 (MQ=255) ccGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTAcc > 2:4198174/1‑140 (MQ=255) cGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGGACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTAccc < 2:1603262/140‑1 (MQ=255) | GAGTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTG > NZ_CP025268/1161073‑1161344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |