| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,026,646 | A→G | *246* (TAA→TAG) | fliP → | flagellar type III secretion system pore protein FliP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,026,646 | 0 | A | G | 99.5% | 1409.0 / NA | 406 | *246* (TAA→TAG) | fliP | flagellar type III secretion system pore protein FliP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (207/197); minor base T (1/1); total (208/198) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 413 total aligned reads displayed.
GCCAGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAAAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACGC > NZ_CP025268/2026509‑2026782 | gCCAGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGAGGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTagag > 1:1552444/1‑140 (MQ=255) gCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGc > 1:31999/1‑140 (MQ=255) gCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGc > 2:617085/1‑140 (MQ=255) gCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGc > 1:1900859/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGGTGCTGTTTGTACTGGTGGCTGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTGTTAAAGCGAGAGAGGCa > 2:3461416/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCa > 1:3031290/1‑140 (MQ=255) ttGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAAt < 1:5997474/140‑1 (MQ=255) ttGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAAt < 1:785838/140‑1 (MQ=255) gATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGa < 1:856658/140‑1 (MQ=255) gATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCATTCAACTGATGCTGATTGTACTGGGGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTAGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGa < 2:2075098/140‑1 (MQ=255) aTGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGac > 2:5557897/1‑140 (MQ=255) gCAGTGGGGATGATGATGGGTCCCCCAGCCACCCTTGCTCTGACCTTTAACCTGATGCTGTGTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCGGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTGTTACAGCTAGAGAGGCTCAATGacggc > 2:1929542/1‑137 (MQ=255) aTTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTg > 2:2615384/1‑140 (MQ=255) ttGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGa < 1:4619159/140‑1 (MQ=255) tGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGaa > 1:3572596/1‑140 (MQ=255) tGGGGATGAGGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTGTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGaa > 2:2319997/1‑140 (MQ=255) ggggATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAAt < 2:3002518/140‑1 (MQ=255) tgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatg > 1:6093237/1‑140 (MQ=255) tgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatg > 1:2595738/1‑140 (MQ=255) gTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatgat < 1:4254666/140‑1 (MQ=255) gTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatgat > 1:2038560/1‑140 (MQ=255) gTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCATTCAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatgat < 2:1301734/140‑1 (MQ=255) gtCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatgatg < 1:5238454/139‑1 (MQ=255) ccccAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATgggg > 1:4588868/1‑140 (MQ=255) ccaccaTTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGaa > 1:3407894/1‑140 (MQ=255) ccaccaTTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGaa > 1:4118610/1‑140 (MQ=255) caccaTTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAg > 2:3102058/1‑140 (MQ=255) ctctGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGaaa > 1:1679429/1‑140 (MQ=255) ctGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGt < 2:2186742/140‑1 (MQ=255) tGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTc > 1:3735496/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 2:2419611/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 1:3831823/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 2:6316074/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 1:1460037/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 2:1013841/1‑140 (MQ=255) ccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgcg < 2:339227/140‑1 (MQ=255) ccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgcg < 1:1942202/140‑1 (MQ=255) tttAAACTGATGCTGTTGGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCCTGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCt > 2:854028/1‑140 (MQ=255) aaaCTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGc < 1:4018127/140‑1 (MQ=255) aaCTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCa < 1:2775692/140‑1 (MQ=255) tGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTg > 2:3687578/1‑140 (MQ=255) tGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTg > 2:1647862/1‑140 (MQ=255) tGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTg > 1:1254011/1‑140 (MQ=255) gATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGcactggcactgg < 1:3988115/140‑1 (MQ=255) aTGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGc < 1:6188124/140‑1 (MQ=255) tGCTGTGTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATAGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCCGAGCTTTTACAGCTCGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGcg > 2:2899180/1‑139 (MQ=255) gCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTg < 1:6321661/140‑1 (MQ=255) gTTTGTCCTGGTGGCTGGCTGGCCAGTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGTGCGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACGGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCGGccc < 2:1162479/140‑1 (MQ=255) gTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGccc > 1:5110242/1‑140 (MQ=255) ggaCTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCt < 2:4603935/138‑1 (MQ=255) gTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCt < 2:4900824/140‑1 (MQ=255) gTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCt < 2:5271079/140‑1 (MQ=255) gTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGACGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCAGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCt < 2:5696154/140‑1 (MQ=255) tACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTa < 1:1068225/140‑1 (MQ=255) aCTGGTGGATGGCTGGCATTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGAGGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAt < 2:588119/140‑1 (MQ=255) aCTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAt < 2:1749254/140‑1 (MQ=255) ggtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgt > 2:791804/1‑140 (MQ=255) ggtggATGGCCGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgt > 1:734297/1‑140 (MQ=255) gtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt > 1:2123528/1‑140 (MQ=255) gtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt > 1:4826665/1‑140 (MQ=255) tggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgttg > 2:4045647/1‑140 (MQ=255) tggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgttg > 2:4439566/1‑140 (MQ=255) gATGGCTGGCAATTGCTGGTCGTTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGATTCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGt > 2:4831990/1‑140 (MQ=255) gATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGt > 2:5020309/1‑140 (MQ=255) gATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGt > 1:4893076/1‑140 (MQ=255) gATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGt > 2:3272554/1‑140 (MQ=255) tggctggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAg > 1:2241013/1‑140 (MQ=255) tggctggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAg > 2:1366971/1‑140 (MQ=255) tggctggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAg > 1:2259292/1‑140 (MQ=255) tggctggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAg < 1:178949/140‑1 (MQ=255) gctggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCg < 2:1599693/140‑1 (MQ=255) gctggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCg < 1:1635169/140‑1 (MQ=255) ctggcAAGTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGt < 2:2812779/140‑1 (MQ=255) ggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTg > 1:5858753/1‑140 (MQ=255) aTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCa < 1:5603021/140‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCa < 2:3966302/140‑1 (MQ=255) ttGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCAc < 1:3102058/140‑1 (MQ=255) ttGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCAc < 2:762913/140‑1 (MQ=255) tGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACg < 1:5353043/140‑1 (MQ=255) gcgggTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACgg < 2:3930239/137‑1 (MQ=255) gCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACgg < 1:4363762/140‑1 (MQ=255) tGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGc < 1:493029/140‑1 (MQ=255) tCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCtt < 2:4977856/140‑1 (MQ=255) tCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCtt < 1:530754/140‑1 (MQ=255) ttCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatca > 2:4249681/1‑140 (MQ=255) tCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatcat < 1:4447508/140‑1 (MQ=255) gCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTAtcatca < 1:4169736/140‑1 (MQ=255) gCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTAtcatca < 1:5020309/140‑1 (MQ=255) tGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGt < 1:3478496/140‑1 (MQ=255) cAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAACATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTAtttt > 2:4132907/1‑140 (MQ=255) ttACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGAGGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGgccg < 2:107054/140‑1 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGTATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATTAAAGTCGCGCTGGCACTGGCGGCCCCGCTATTGTTGTTAGCGTTGGTCACGGGCCTTCTCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACg < 2:1230931/140‑1 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTCTCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACg > 1:1017386/1‑140 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACg < 1:2419611/140‑1 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACg > 1:254218/1‑140 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACg < 2:3870495/140‑1 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACg < 2:1533104/140‑1 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAGTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCGTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACg < 2:5427297/140‑1 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAGTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCGTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACg > 2:6279906/1‑140 (MQ=255) cTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACGc > 1:5501786/1‑140 (MQ=255) | GCCAGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAAAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACGC > NZ_CP025268/2026509‑2026782 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |