| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,472,140 | C→T | A84A (GCC→GCT) | yfdG → | bactoprenol glucosyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,472,140 | 0 | C | T | 99.8% | 1757.4 / NA | 447 | A84A (GCC→GCT) | yfdG | bactoprenol glucosyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (228/218); minor base G (1/0); total (229/218) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 450 total aligned reads displayed.
TTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCCGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTCTT > NZ_CP025268/2472003‑2472276 | tCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATgc > 2:3128952/1‑140 (MQ=255) ggCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTCTATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTc > 2:301058/1‑140 (MQ=255) cTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTccc < 2:6145438/140‑1 (MQ=255) gtgAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTccccc < 1:1290298/140‑1 (MQ=255) gtgAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTccccc < 1:2758543/140‑1 (MQ=255) tAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATaa > 1:3501234/1‑140 (MQ=255) tAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATaa < 1:6104228/140‑1 (MQ=255) cttcttCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGTTGCGCTACATGCTAGATGGTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATTGGCTGCTGATAGATGCGCAATTCCCCCGATGATAActc > 2:3364519/1‑140 (MQ=255) ttcGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATCTGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGt > 2:1365284/1‑140 (MQ=255) tcGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTc < 2:5035029/140‑1 (MQ=255) cAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTcc < 1:2569481/140‑1 (MQ=255) aTTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCa < 1:4894121/140‑1 (MQ=255) cacaTTCACGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACGGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCa < 2:3583836/140‑1 (MQ=255) aTTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGGGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGcc < 2:4420026/140‑1 (MQ=255) tCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTg < 1:5585402/140‑1 (MQ=255) tCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCGACTGTTGGATGGGCTGCTGAGAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTg < 2:5802195/140‑1 (MQ=255) gCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGtgtg < 1:2100595/140‑1 (MQ=255) tCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCgg > 1:381698/1‑140 (MQ=255) cGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGt > 1:579964/1‑140 (MQ=255) aCTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGttt < 1:3189222/140‑1 (MQ=255) acacCGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGTTAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGt < 2:5833483/140‑1 (MQ=255) aTGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTg < 2:384329/120‑1 (MQ=255) aTGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACGTCCCCCGATGATAACTCtt < 1:3417100/96‑1 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 1:749468/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 2:4282923/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 2:1227590/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 2:270988/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 2:1717126/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 2:1516781/1‑140 (MQ=255) gcgcTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCaa < 1:2297509/140‑1 (MQ=255) gcgcTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCaa < 1:5294910/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGTGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTTTTCGGTTTCTTCTATTCAAAGttaa < 2:2621396/140‑3 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 1:1001015/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 1:2959610/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 2:2959675/140‑1 (MQ=255) aTGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAt < 2:1455402/140‑1 (MQ=255) aTGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAt < 1:3614101/140‑1 (MQ=255) tGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAtt < 2:3791603/140‑1 (MQ=255) tGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAtt < 1:1470221/140‑1 (MQ=255) tGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAtt < 1:2909778/140‑1 (MQ=255) gCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCCTCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTg > 1:3720907/1‑140 (MQ=255) tatGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCtt > 2:5266656/1‑140 (MQ=255) atGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCttt > 1:1125485/1‑140 (MQ=255) gTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAg > 2:5125668/1‑140 (MQ=255) gTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAg > 1:1683601/1‑140 (MQ=255) gTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAg > 1:4787448/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAggg > 1:1835613/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAggg > 1:2459185/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATACACAGTTCATTGTCTTTAggg > 2:876476/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCCGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGt > 2:6407395/1‑132 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCCGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGt < 1:6407396/132‑1 (MQ=255) gggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCa < 1:4163711/91‑1 (MQ=255) gggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGa > 1:3860127/1‑140 (MQ=255) gggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGa > 2:3279424/1‑140 (MQ=255) gggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGa > 2:2669027/1‑140 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt < 1:3124810/140‑1 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt > 1:5904057/1‑140 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt > 2:5528982/1‑140 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt > 2:5605408/1‑140 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt > 1:5459962/1‑140 (MQ=255) gTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATg > 2:4087852/1‑140 (MQ=255) tcctcgggACACTGAGTGCGACTGTGGGAAGGGCTGCTGAGAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCCTCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCg < 2:4183458/135‑1 (MQ=255) tCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCg > 1:1223575/1‑140 (MQ=255) tCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCg > 1:1801460/1‑140 (MQ=255) tCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCg < 2:3540728/140‑1 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa > 2:6003628/1‑140 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa > 1:922821/1‑140 (MQ=255) ggggACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAAt < 2:1148720/140‑1 (MQ=255) gggACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATg < 1:4268991/140‑1 (MQ=255) acacTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAg < 1:265900/140‑1 (MQ=255) acTGTGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTATTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 1:5040300/140‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 1:1441282/140‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 2:1784576/140‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACGTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 2:4747409/140‑1 (MQ=255) acTGAGTGCGACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATACCTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 1:1609022/140‑1 (MQ=255) cTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGata < 2:5377942/140‑1 (MQ=255) tGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCCTTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGatat > 2:725678/1‑140 (MQ=255) tGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGatat > 2:6303031/1‑140 (MQ=255) tGAGTGCTACGGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAAATCTTGACACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTCTTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGatat > 2:2528168/1‑140 (MQ=255) gAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtc < 1:54115/140‑1 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct < 2:4696924/140‑1 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct < 1:6277097/140‑1 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct < 2:4004594/140‑1 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct > 1:6061161/1‑140 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct > 1:4377986/1‑140 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct > 1:4512900/1‑140 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct < 1:4691965/140‑1 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAATGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct > 2:1298222/1‑140 (MQ=255) tACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGt < 2:3764172/140‑1 (MQ=255) aCTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTa > 2:260755/1‑140 (MQ=255) ttGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTNCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTc < 1:5676664/140‑1 (MQ=255) ggATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCt > 2:2262727/1‑140 (MQ=255) ggATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCt < 2:3189029/140‑1 (MQ=255) ggATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCGTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCt > 2:1675946/1‑140 (MQ=255) aTGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGt > 2:1074039/1‑140 (MQ=255) tGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAATGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTc > 2:6074565/1‑140 (MQ=255) tGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTc > 2:2023318/1‑140 (MQ=255) tGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTc < 2:1931938/140‑1 (MQ=255) tGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTc > 1:409010/1‑140 (MQ=255) ggCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTCtt > 2:6236351/1‑140 (MQ=255) | TTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCCGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTCTT > NZ_CP025268/2472003‑2472276 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |