Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,098,977 | A→G | *97* (TAA→TAG) | yggU → | DUF167 family protein YggU |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,098,977 | 0 | A | G | 99.1% | 761.9 / NA | 223 | *97* (TAA→TAG) | yggU | DUF167 family protein YggU |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (88/133); minor base T (1/1); total (89/134) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
GTGAAGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAAGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGC > NZ_CP025268/3098840‑3099113 | gTGAAGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGt > 2:5681734/1‑140 (MQ=255) aaGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTTCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATc > 1:3631200/1‑140 (MQ=255) aaGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATc > 1:3119038/1‑140 (MQ=255) aaGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATc > 1:6227858/1‑140 (MQ=255) aaGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATc > 1:1787834/1‑140 (MQ=255) aGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTTGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGTCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACACATCCCTCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTATGTATcc < 2:2945243/140‑1 (MQ=255) aGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATcc < 2:5349337/140‑1 (MQ=255) ctcGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGc < 2:833456/140‑1 (MQ=255) tcGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCa < 2:4296518/140‑1 (MQ=255) tcGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCa > 1:5173453/1‑140 (MQ=255) ggTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCaaa < 1:4324697/140‑1 (MQ=255) tAAGCAATTCCGGGTTGCCAACAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCaaaaa < 1:2121016/140‑1 (MQ=255) gCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGtt < 1:5121334/140‑1 (MQ=255) aTTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTc > 1:1401812/1‑140 (MQ=255) cGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCg < 1:5297236/140‑1 (MQ=255) ggTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGNAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCa < 1:6460338/140‑1 (MQ=255) ggTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCa < 2:5198800/140‑1 (MQ=255) ggTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCa < 1:4229394/140‑1 (MQ=255) ggTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCa < 1:821083/140‑1 (MQ=255) ggTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTGGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCa < 1:5819126/140‑1 (MQ=255) ccAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCgg > 2:670134/1‑140 (MQ=255) ccAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCgg < 1:5189597/140‑1 (MQ=255) ccAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCgg > 2:4033119/1‑140 (MQ=255) cAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGc < 1:6294254/140‑1 (MQ=255) cAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGc < 2:1955459/140‑1 (MQ=255) accgCCAGGTGGTTCATGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTACCCTCAGTAATCCGCAACACATCCCGCCCGACCGCGCGGCGATAATTCATAAGGGCTCCGCGCCAACAAGTGGGCCTCGCACCCGGCaa < 2:4846566/137‑1 (MQ=255) aaaGCCAGGTTGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCTTTTATACGCAACAAATCACGCCTGATATCGCTGCGTTAATTAATTTGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCTGcta < 2:6228220/140‑3 (MQ=255) aaaGCCAGGTGGTTATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAAATAAAATCAATAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 2:5281030/140‑1 (MQ=255) aaaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTTATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 1:5263602/140‑1 (MQ=255) aaaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 2:4438707/140‑1 (MQ=255) aaaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 2:3459751/140‑1 (MQ=255) aaaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 1:3905806/140‑1 (MQ=255) aaaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 1:3415715/140‑1 (MQ=255) aaaGACAGTTTGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGTCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCTCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATTCAAACAGTTGTAATCGCAACCGGCaa < 2:574108/140‑1 (MQ=255) aaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAAt < 2:5501471/140‑1 (MQ=255) aGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATg < 1:6152754/140‑1 (MQ=255) ggtggtGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAATCAAATTAAAATCATTAATCCGCTACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAGAATGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCggg > 2:3540151/1‑139 (MQ=255) ggtggtGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGt > 1:1086341/1‑140 (MQ=255) ggtggtGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGt > 1:1060652/1‑140 (MQ=255) ggtggtGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGt > 2:5926599/1‑140 (MQ=255) ggtggtGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGt > 1:270801/1‑140 (MQ=255) tgATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGt > 2:3037757/1‑140 (MQ=255) tgATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGt > 1:2982585/1‑140 (MQ=255) tgAGTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGGCACAAACAATGTAAAATAATTAATCCGCAACTAATCCCGGCAGAAATCGCGGCGTGAAGTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGAAACCGGCAATGTCGGTAAAgg > 2:2435328/1‑139 (MQ=255) aTTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCCGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAGAGTTGTCCTCGCAACCGGCACTGTCGGTCAAGTGc > 2:6025246/1‑140 (MQ=255) aTTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGGTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGc > 2:2843635/1‑140 (MQ=255) ttGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCATATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCTTCAATGTCGGTAAAGTGCg < 2:1596971/140‑1 (MQ=255) aaaaGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAATTCATTAATACTCAACAAATCACGCAAGAAATCTCGGCGTTAAGTAGTTAGGTATCCAATGCAAAATGGTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCTGTAAAGTGCGTGAg > 2:6436798/1‑140 (MQ=255) aaGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTACAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCt < 2:4742693/140‑1 (MQ=255) ggCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAACTCGCGGCGTTAATTAGTTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTgg < 1:1970452/140‑1 (MQ=255) cGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCg > 1:4024455/1‑140 (MQ=255) gAACTTGGCCGCCACAAACACATTAAAATCATTAATCCGCAACAACTCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGt < 2:1125105/140‑1 (MQ=255) gAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGt < 1:627089/140‑1 (MQ=255) aCTTGGCCGCCACAAACAAATTCAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCg < 2:1617432/140‑1 (MQ=255) aCTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCg > 1:5975916/1‑140 (MQ=255) aCTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCg < 2:2098030/140‑1 (MQ=255) aCTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCg < 2:2549341/140‑1 (MQ=255) gccgccACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCgctgct > 1:5304941/1‑140 (MQ=255) cacaAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCg > 2:4075540/1‑140 (MQ=255) cacaAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCg > 1:1156989/1‑140 (MQ=255) caaacaaaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGAc > 2:3029638/1‑140 (MQ=255) aaacaaaTTAAAATCCTTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACt < 2:3717050/140‑1 (MQ=255) aacaaaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACtt < 2:2376953/140‑1 (MQ=255) aacaaaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACtt < 1:69155/140‑1 (MQ=255) aacaaaTGAAAATCATTAATCCGCAACANATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACtt < 1:5667081/140‑1 (MQ=255) acaaaTTAAAATCCACAATCCGCAACAAATCCCGCCAGACATCGCGGCGTTAAATAATTAGCTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAACTGCGTGAGCCGGCGTCGCTGCTTACCGACtac < 2:3993518/140‑3 (MQ=255) acaaaTTAAAATCATTAATCCGCCACAAATCCCGACAGAAATCCCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTc < 2:6232052/140‑1 (MQ=255) aaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGt < 1:4261572/140‑1 (MQ=255) aTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTc > 1:4525998/1‑140 (MQ=255) aTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTc > 1:3285987/1‑140 (MQ=255) aaaTCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGa > 2:3200087/1‑140 (MQ=255) cATTACTCCGCACCACCTCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTACTTAATTAGGTTTCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATc < 2:4962691/140‑1 (MQ=255) cATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATc < 2:5895952/140‑1 (MQ=255) cATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATc < 1:1282911/140‑1 (MQ=255) cATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATc < 2:1404899/140‑1 (MQ=255) cATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTGAATTAATTAGGTAACCTATGCACAAAGTTGTCCTCGCACCCGGCAATGTCGGTACAGGGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCATGATATc < 2:4447974/140‑1 (MQ=255) aaTCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTgg < 1:3679862/140‑1 (MQ=255) aaTCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTAGCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCGTGATATCGTgg > 2:4659872/1‑140 (MQ=255) tCCGCAAAAAATCCCGCCAGAAATCGCGTCGTTAATTAATTAGGTATACAATGCAAAAAGATGTCCTAGCAACCTGCAATGTATGTAAAGTTCGTGAGCTGGCGTCGCTGATTAGCGACTTAGATCTTGATATCGTGGca > 2:329881/1‑139 (MQ=255) gCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAAAGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCaa > 1:2873977/1‑140 (MQ=255) caacaaATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCaaa > 2:4618681/1‑140 (MQ=255) caacaaATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCaaa > 1:2837875/1‑140 (MQ=255) aacaaATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAAc > 1:1692623/1‑140 (MQ=255) aacaaATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAAc > 1:5015755/1‑140 (MQ=255) tCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCt < 1:4411027/140‑1 (MQ=255) cccGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTc < 1:182426/140‑1 (MQ=255) cccGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCACGCAACCTGCAATGTCGGTAAAGTGAGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCTACTTCGGTCATGATATCGTGGCCCAAACAGACCTc < 2:3891785/140‑1 (MQ=255) gCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAATGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGc > 1:5112182/1‑140 (MQ=255) gCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGc > 1:3092244/1‑140 (MQ=255) aTCGCGGCGTTAATTAGTTCGGTATCCTATGCAATAAGTTGTCCTCGCCACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGGGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGCtt > 2:5407021/1‑140 (MQ=255) gcggcgTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCg < 1:4093859/140‑1 (MQ=255) cggcgTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGc > 2:4148827/1‑140 (MQ=255) cgTTAATTAATTAGGTATCCAATGCAACAACTTGTCCTCGCAACCGGCTATGTCGGAAACGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTCAGCGCCTTCGGTCTTGCTATCGTGGCCCAACCAGCCCTCGGCGTTGCTGCCGCTga < 2:3653051/140‑1 (MQ=255) attaattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGaaa < 1:99036/140‑1 (MQ=255) attaattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGaaa < 1:783324/140‑1 (MQ=255) attaattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGaaa < 1:2478875/140‑1 (MQ=255) ttagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGt > 1:1944327/1‑86 (MQ=255) ttagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGc > 1:1511766/1‑140 (MQ=255) ttagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGc > 2:1772450/1‑140 (MQ=255) ttagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGc > 1:5432717/1‑140 (MQ=255) | GTGAAGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAAGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGC > NZ_CP025268/3098840‑3099113 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |