| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,304,165 | G→A | T280I (ACC→ATC) | mdtO ← | multidrug efflux transporter permease subunit MdtO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,304,165 | 0 | G | A | 99.0% | 1610.3 / NA | 416 | T280I (ACC→ATC) | mdtO | multidrug efflux transporter permease subunit MdtO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (217/194); minor base T (2/2); total (219/197) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 416 total aligned reads displayed.
CATCTGACCCAGTTGTAACAACGTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGGTTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGCCACCATGCGTTTTGAGTTCG > NZ_CP025268/4304029‑4304301 | cATCTGACCCAGTTGTAACAACGTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGAttt > 1:4952761/1‑140 (MQ=255) ccAGTTGTAACAACGTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCt > 1:115094/1‑140 (MQ=255) aGTTGTAACAACGTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTaa > 1:3199415/1‑140 (MQ=255) gTTGTAACAACGTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAAt > 1:422675/1‑140 (MQ=255) gTTGTAACAACGTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAAt > 1:3331060/1‑140 (MQ=255) gTTGTAACAACGTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAAt > 2:2593551/1‑140 (MQ=255) ttGTAACAACGTCTGTCCGATATTCTCCAGGTTACATTCACGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCTCTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAAtt > 2:1766428/1‑140 (MQ=255) ttGTAACAACGTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCCTGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAAtt > 1:862908/1‑140 (MQ=255) acaacGTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGt < 1:2178341/140‑1 (MQ=255) acGTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCgg < 1:502097/140‑1 (MQ=255) cGTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGa > 2:5750121/1‑140 (MQ=255) gTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGaa > 1:3624278/1‑140 (MQ=255) gTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGaa > 1:3461236/1‑140 (MQ=255) gTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTGGTCGGaa > 2:3657700/1‑140 (MQ=255) gATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCAGCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCTGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTGTGGTCGGAATTCaagaa < 2:677461/140‑1 (MQ=255) cagagtctcCAGGTTACATGCCCGTGCCGCCAGCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCACCGGCATGCTGCAGCGTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGACTGCaataa < 2:536761/135‑1 (MQ=255) tatTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAAtt > 1:2678187/1‑140 (MQ=255) atTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGACTTCAATAATTg > 2:2397508/1‑140 (MQ=255) tcCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTCATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTg > 2:6072705/1‑140 (MQ=255) cAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCGTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTAGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTgag > 2:4580648/1‑140 (MQ=255) aGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTgaga < 1:813924/140‑1 (MQ=255) aGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTgaga < 1:5375533/140‑1 (MQ=255) aGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTgaga < 2:5180858/140‑1 (MQ=255) gTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAAt < 1:280657/140‑1 (MQ=255) tACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCa > 1:4461432/1‑140 (MQ=255) aCATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAg < 1:5524653/140‑1 (MQ=255) aCATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAg > 2:1591548/1‑140 (MQ=255) cATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGc > 1:4117919/1‑140 (MQ=255) tCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATGTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCaaa < 2:6006129/140‑1 (MQ=255) cccGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCaaaa < 2:4649763/140‑1 (MQ=255) cccGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCaaaa < 1:2458046/140‑1 (MQ=255) cccGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCaaaa < 1:4562355/140‑1 (MQ=255) cccGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACGGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGACTTCAATAATTGCCTGCGAATCAGCaaaa < 2:4007062/140‑1 (MQ=255) cccGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGAGCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTATTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCaaaa < 1:6427925/140‑1 (MQ=255) cGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCACTAATTGCCTGAGAATCAGCAAAaga > 1:1113482/1‑140 (MQ=255) cGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAaga > 2:4742507/1‑140 (MQ=255) cGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAaga > 1:568945/1‑140 (MQ=255) ccgccATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCCTGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTg > 2:2288506/1‑140 (MQ=255) ccgccATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTg > 1:4831983/1‑140 (MQ=255) ccgccATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTg > 1:1040585/1‑140 (MQ=255) cATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGAt < 2:2338527/140‑1 (MQ=255) cATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGAt < 1:6081104/140‑1 (MQ=255) cATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATGTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGACTTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGAt < 1:5263343/140‑1 (MQ=255) cATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCGTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGAt < 2:6178728/140‑1 (MQ=255) aTCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGATAATTTTTTTCGTAATTCAATAATTTCCTGAGAATAAGCAAAAGAGGTGGGATc > 1:2938132/1‑140 (MQ=255) cTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAg > 2:1969754/1‑140 (MQ=255) cTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAg < 2:3282703/140‑1 (MQ=255) ccccctGAGCCGCCCGTCGCTTTGCCAGCACTGACCCACCGCCACGGCAAGCTGCCGCCAGCTGATTTCATAACCTAAATTTCGTCCCAAATCAAGAATTGCCTGAGCATCACCAAAAGAGCTGGGATCGTAGCGATTCa < 2:898002/136‑1 (MQ=255) cactGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGt < 1:211667/83‑1 (MQ=255) actGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAGGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCg > 1:5956656/1‑140 (MQ=255) actGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCg > 1:1414721/1‑140 (MQ=255) actGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCg < 2:5837115/140‑1 (MQ=255) ctGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCATCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGt < 1:3890383/140‑1 (MQ=255) ctGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGt < 2:4320376/140‑1 (MQ=255) aTCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGa < 1:3676792/140‑1 (MQ=255) aTCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGa > 2:6419687/1‑140 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1:6163562/1‑140 (MQ=255) ccTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCa > 1:631018/1‑140 (MQ=255) cAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCtt > 1:4248460/1‑140 (MQ=255) aGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCttt < 2:3088836/140‑1 (MQ=255) cAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGc > 2:2675017/1‑140 (MQ=255) aCGGCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGcca > 2:4855910/1‑140 (MQ=255) ggCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGccacc > 2:1359068/1‑140 (MQ=255) ggCATGCTGCAGCTTGTTGATGTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGCTTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGacacc > 2:2914492/1‑140 (MQ=255) gCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGccacca < 1:5817813/140‑1 (MQ=255) gCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGccacca < 1:1969754/140‑1 (MQ=255) gCATGCTGCAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGccacca < 1:3766489/140‑1 (MQ=255) tgctgcAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGCCACCATGc > 1:1816796/1‑140 (MQ=255) tgctgcAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGCCACCATGc > 1:1211841/1‑140 (MQ=255) ctgcAGCTTGTTGATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGCCACCATGCGt > 1:5608694/1‑140 (MQ=255) cTTGTTGATTTCTGAATCTAATTTTTGTCGGAATTCAATCATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGGGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGCCACCATGCGTTTTGAg < 2:1666472/140‑1 (MQ=255) gttgATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGCCACCATGCGTTTTGAGTTc > 1:784650/1‑140 (MQ=255) ttgATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGCCACCATGCGTTTTGAGTTCg < 1:1278289/140‑1 (MQ=255) ttgATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGCCACCATGCGTTTTGAGTTCg < 1:520034/140‑1 (MQ=255) ttgATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGCCACCATGCGTTTTGAGTTCg < 1:19075/140‑1 (MQ=255) ttgATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGCCACCATGCGTTTTGAGTTCg < 2:414732/140‑1 (MQ=255) ttgATTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGCCACCATGCGTTTTGAGTTCg < 2:4211900/140‑1 (MQ=255) ttgATTTCTGAAGCTAATTATTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGCCACCATGCGTTTTGAGTTCg < 2:2847804/140‑1 (MQ=255) | CATCTGACCCAGTTGTAACAACGTCTGGCAGATATTCTCCAGGTTACATTCCCGTGCCGCCATCGCTTCACTTTCACTGATCCGCCAGTCGCTTTGCCAGCACTGACCTTCAGCAACGGCATGCTGCAGCTTGTTGGTTTCTGAAGCTAATTTTTGTCGGAATTCAATAATTGCCTGAGAATCAGCAAAAGAGGTGGGATCGTAGCGATTCAGCGTCGAGTAAATGTAGGTTACCGTTGCCACGCAGCTTTGCCACCATGCGTTTTGAGTTCG > NZ_CP025268/4304029‑4304301 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |