| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,771,469 | (C)8→7 | intergenic (+91/‑265) | rnlB → / → yfjP | type II toxin‑antitoxin system antitoxin RnlB/GTPase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,771,462 | 0 | C | . | 96.2% | 575.3 / 15.0 | 132 | intergenic (+84/‑272) | rnlB/yfjP | type II toxin‑antitoxin system antitoxin RnlB/GTPase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/4); new base . (20/105); total (21/111) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
AGCCTCTGTTTTGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAA > NZ_CP025268/2771324‑2771592 | aGCCTCTGTTTTGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAAcc < 1:3353/140‑1 (MQ=255) gCCTCTGTTTTGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAAccc < 2:4868855/140‑1 (MQ=255) gCCTCTGTTTTGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAAccc < 2:474516/140‑1 (MQ=255) gCCTCTGTTTTGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAAccc < 2:2755503/140‑1 (MQ=255) ccTCTGTTTTGTATCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACGAGGATAGAATTCGCCCGTTTGGCATGATATTAACTTGTACAATGTGATCAACTAGCATTAActca > 2:28580/1‑137 (MQ=255) ctgtGTTTTGTCTCCCGGTTATGTAGGCCAAGTCCTGTAAATGGATTTTTGACACTCTTCTCGCTAAACGACCCAGTATAGAATTCGCCCTTAGTGAATGATATCACCTTTTCCAATATCATCAACTATCCGTAcccccc < 2:1827165/137‑1 (MQ=255) ctctGTTTTGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAAccccc < 1:2327259/140‑1 (MQ=255) ctGTTTTGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAAcccctcc > 1:2734604/1‑140 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAAccccccctcacn < 1:5065675/140‑6 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 2:1966599/140‑1 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 1:3132466/140‑1 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 2:1437476/140‑1 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 2:1553494/140‑1 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 2:106338/140‑1 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 2:2269662/140‑1 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 2:520387/140‑1 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 2:912376/140‑1 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 1:1692322/140‑1 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 1:1846186/140‑1 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 1:1208263/140‑1 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 1:2481679/140‑1 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTGTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 2:2189170/140‑1 (MQ=255) ttGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAACTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 1:3736818/140‑1 (MQ=255) gTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAAc < 1:2634886/140‑1 (MQ=255) gTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAAc < 1:4809503/140‑1 (MQ=255) tctcCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACg > 1:733576/1‑140 (MQ=255) ctcCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCGCAACGt < 2:4681243/140‑1 (MQ=255) ctcCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGt < 2:2213067/140‑1 (MQ=255) ctcCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGt < 2:2611386/140‑1 (MQ=255) ctcCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGt < 2:4210586/140‑1 (MQ=255) ctcCCGATCATGTACGCCAACTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGACCCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGt < 2:3655572/140‑1 (MQ=255) cgcccGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTGCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGt < 1:479133/138‑1 (MQ=255) tcCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAGCCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTc < 1:4071271/140‑1 (MQ=255) tcCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTc < 1:1001250/140‑1 (MQ=255) tcCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAACTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AGCCCCCC‑CTCACAACGTc < 2:1998391/140‑1 (MQ=255) cGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCCGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACCTGTCCAATATGATCAAATCGCCTTAACCCCCCCGCTcacgcacata > 2:4616857/1‑133 (MQ=255) cGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTg < 1:2225258/140‑1 (MQ=255) cGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAac < 1:4293370/140‑1 (MQ=255) cGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAac < 1:432801/140‑1 (MQ=255) cGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAac < 1:3592042/140‑1 (MQ=255) cGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAac < 1:2943741/140‑1 (MQ=255) cGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAac < 1:2935197/140‑1 (MQ=255) cGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAac < 2:149608/140‑1 (MQ=255) cGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAac < 2:3671514/140‑1 (MQ=255) cGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAac < 2:1060166/140‑1 (MQ=255) cGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAac < 2:2435064/140‑1 (MQ=255) cGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATGAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAac < 1:4772609/140‑1 (MQ=255) aGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGtt < 1:705907/140‑1 (MQ=255) tGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTTTAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGCACACGTTTTccc < 2:5060510/140‑1 (MQ=255) tGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTccc < 2:2998599/140‑1 (MQ=255) tGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTccc < 2:2290776/140‑1 (MQ=255) tGTCAATAGATTTTTGGATGTCTTCTTTCTAAACTAACCACTATCGAAGTCGCCCTTTTGTCATGATATTAACTGGTCCAATATGATCAAATAGCGTTAA‑CCCTCC‑CACCCAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTccc < 2:3354746/140‑1 (MQ=255) aTTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGGATGCTATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCAcc < 1:3645635/140‑1 (MQ=255) aTTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCAcc < 1:3388134/140‑1 (MQ=255) aTTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCAcc < 2:4801932/140‑1 (MQ=255) aTTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCAcc < 2:733576/140‑1 (MQ=255) tGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCACCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGa < 1:3011201/140‑1 (MQ=255) tttttAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCCTAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTccc < 2:3729052/140‑1 (MQ=255) tttgtAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCCCGACTAAATTTccc < 1:4138094/140‑1 (MQ=255) tttctAAACGAACCAGTATAGCATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTccc < 1:1597713/140‑1 (MQ=255) tttctAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTccc < 2:2852031/140‑1 (MQ=255) tttctAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTccc < 1:1041748/140‑1 (MQ=255) tttctAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTccc < 1:1334834/140‑1 (MQ=255) tttctAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTccc < 1:4360248/140‑1 (MQ=255) tttctAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTccc < 1:245712/140‑1 (MQ=255) ctAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTcccccc < 1:812964/140‑1 (MQ=255) aaCGAGTATAGACATCGACATTTTGACATGCTATTAACTTGTACAGTCTGATCAAAGAGAATTAA‑CCCCCC‑CTCCCGGCGTCCTGCATAGGCAACACGTTTTACCCTGTGCACCCACGACTAACTTCCCACCCCTTTaaa < 2:1353223/140‑1 (MQ=255) aaCCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAGCTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTaaa < 1:5044983/140‑1 (MQ=255) aaCCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTaaa < 2:684489/140‑1 (MQ=255) aaCCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTCGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AGCCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGCAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTaaa < 2:356798/140‑1 (MQ=255) ccAGTATAGAATTCCCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑ACCCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAAACt < 2:701275/140‑1 (MQ=255) cAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAAACtt < 1:3035320/140‑1 (MQ=255) cAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAAACtt < 2:3436253/140‑1 (MQ=255) cttCGCCCTTCTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑ACCCACCC‑CTCACCACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCGCCTGTGCACCCACGACTAAAGTTCCCCCCCTTTAAACTTCTCaataat < 2:3740120/139‑1 (MQ=255) aTTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAAACTTCTCaataat < 1:4087870/140‑1 (MQ=255) gCCCTTTTGGCATGATATTAAGTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca > 2:4245149/1‑61 (MQ=255) gCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 1:410098/61‑1 (MQ=255) gCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca < 1:4245266/61‑1 (MQ=255) gCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca > 2:410098/1‑61 (MQ=255) gCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTcaca > 2:409915/1‑61 (MQ=255) gCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTGCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTACCCCCCTTTAAACTTCGCAATAATGTCa > 1:1338425/1‑140 (MQ=255) gCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTTCACCCACGACTAAATTTCACCCCCTTTAAAATTGTCAATAATGTCa > 1:2691428/1‑140 (MQ=255) gCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑ACCCCC‑CTCACAACGTACTGCATAGAGAACAAGATTTCCCCTGTAAACACACGACTAAATTTCCTACCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCa > 1:1805073/1‑140 (MQ=255) tGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACCAAATTTCCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTgg < 2:4003788/140‑1 (MQ=255) atatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGGCCTGCATAGGGTACACCTTTCCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAAGCTTCTCAATAATGCCACCACTTTTCTggca > 1:4061013/1‑138 (MQ=255) atTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAAACTTCTCAATCATGTCACCAATTTTCTGGAAAt < 1:2646397/140‑1 (MQ=255) cTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTat < 1:1562767/140‑1 (MQ=255) gTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAAACTTCTCGATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgat < 2:4864405/140‑1 (MQ=255) gTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTACAGCATAGGGAACACGGTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCACCCTTTAAAATTTTCAATAATGTAACCAATGTTCTGGAAATCCTatgat > 2:171557/1‑140 (MQ=255) tCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CTCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAGACTTCTCAATAATGCGACCAATTTTCTGGCAATCCTatgatt > 1:4000124/1‑139 (MQ=255) tCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CGCACC‑CTCACAACGTCCTGCATGGGGAACACGTTTTCCACTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCTCCTTTAAACTTCTCAAGAATGTTACGAATTTTCTGGAAATCCTatgatg > 2:295043/1‑140 (MQ=255) tCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCT‑CTCACAATGTCCGGAATAGGGAACTCGTTTTCCCCTGTGCATCCACGACTAAATTTCATCCCCTTCAAATTTCTAGATAATTTCCTCTATTTTCTGGTAATCCTataatt > 2:4795387/1‑139 (MQ=255) tCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCCAC‑CTCACAACATCCTTCATAGGAAACACATTTCCACCTATGCACCCACAACTAAATTTCCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAAAGTCACAAATTTTCTTACAATCCTatgatg > 2:1040304/1‑140 (MQ=255) tCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CACCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGAGAACACGTTTTACCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCGCCCCCTTTAAACTTCTCAATAAGATAACAAATTTTCTGGTAATCTTatgatt > 2:3594774/1‑139 (MQ=255) tCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑ACCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgatg < 1:1949814/140‑1 (MQ=255) aaaTATCCTCAAATAGCATTAA‑CCCCCA‑CTCACAACGTCCTACATAGGCAACACGTTTTCCCCTGTGCACCAACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGcc < 2:1102274/139‑1 (MQ=255) atGATCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTc < 1:1717300/140‑1 (MQ=255) aTCAAATAGAAACAA‑CCCCCC‑CTCACAACGTACTGCATAGGGAACACCTCCTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCACCCTTGAACCTTCTCAATAATGTCACCAATATTCTGGAAATCCTATAACGCCTTTCCCg < 2:2981018/140‑1 (MQ=255) tCAAATAGCATTAA‑CCCCTC‑CTCACAACGTGCTGCATAAGGAACACTTTTACTCCGTTGCACTCATGACTAAATTTCCCCCTCTTTAAACTTCTGAATAATGTCACCAATTTTGTGGACACCCTATGACGGCtttgctgg > 2:609397/1‑135 (MQ=255) tCAAATAGCATTAA‑CCCCCC‑AACACACCATCCTCCATGGTGAAGACGTTATACCCTGTGCAGTCACAAATACACATACCCCCCTTTAAATTTAACAATACTGTCACACATGTCCTACAAATCCTACGACGCTTTGCTCgg > 2:609575/1‑140 (MQ=255) | AGCCTCTGTTTTGTCTCCCGATGATGTACGCCAAGTCCTGTCAATGGATTTTTGAAACTCTTCTTTCTAAACGAACCAGTATAGAATTCGCCCTTTTGGCATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCC‑CTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTCCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAA > NZ_CP025268/2771324‑2771592 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |