Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,736,852 | Δ1 bp | intergenic (+4/+193) | xylR → / ← bax | DNA‑binding transcriptional regulator XylR/protein bax |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,736,851 | 0 | A | . | 99.3% | 1372.4 / 1.2 | 289 | intergenic (+3/+194) | xylR/bax | DNA‑binding transcriptional regulator XylR/protein bax |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); new base . (147/139); total (150/139) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
AACCACCTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGTTCGTAGCTCAACTG > NZ_CP025268/3736713‑3736982 | aaCCACCTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAACAGCGATGTCATGTTGTAGCGat > 1:2833099/1‑139 (MQ=255) ccaccTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCGatga > 1:2454905/1‑137 (MQ=255) ccTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑Atgatga > 2:3345975/1‑140 (MQ=255) ccTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑Atgatga > 1:3708575/1‑140 (MQ=255) ccTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑Atgatga > 2:1126563/1‑140 (MQ=255) ttGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATgaga > 2:2009260/1‑140 (MQ=255) gTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAAt > 2:3004838/1‑140 (MQ=255) gATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGt < 2:2614533/140‑1 (MQ=255) cAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCCATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCgg > 2:4426318/1‑140 (MQ=255) aaTGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGc > 1:421981/1‑140 (MQ=255) aaTGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGGAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGc > 2:1234616/1‑140 (MQ=255) attaggtatCGCAAATGTGCGGTTATCGACCGCTGCAATATTCCTACTATGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTTTCGCGATGTAAATCGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAAAATTGTCGGCg < 2:971881/134‑1 (MQ=255) aTGAGTGATCGCAAGTGGGCGGTTATCCATCGCTGCACTATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCg < 2:1921127/140‑1 (MQ=255) aTGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCg < 1:1935658/140‑1 (MQ=255) aTGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCg < 1:3079954/140‑1 (MQ=255) gagaTATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTc < 2:601744/140‑1 (MQ=255) atatCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTcaca < 2:668857/140‑1 (MQ=255) atatCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTcaca > 1:1304021/1‑140 (MQ=255) atatCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTcaca < 2:1506379/140‑1 (MQ=255) atatCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTcaca < 1:3105944/140‑1 (MQ=255) atCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATc > 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cGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGc > 1:2018240/1‑140 (MQ=255) cGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGc > 2:3072830/1‑140 (MQ=255) ggTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg < 1:4155916/140‑1 (MQ=255) ggTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg < 1:3961162/140‑1 (MQ=255) ggTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg < 2:3262461/140‑1 (MQ=255) ggTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg < 2:3820313/140‑1 (MQ=255) tATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAACAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTgg < 1:5047190/140‑1 (MQ=255) tATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAATAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTgg < 1:856487/140‑1 (MQ=255) aTCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGt > 1:1685343/1‑140 (MQ=255) tCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGtt > 1:291745/1‑140 (MQ=255) cATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAACAATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGCATTGTCGGCGGCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGt < 2:2534384/140‑1 (MQ=255) cGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCgg > 2:3886893/1‑140 (MQ=255) cGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTAGTCgg > 2:4495499/1‑140 (MQ=255) cTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCTGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGAt > 2:2370537/1‑140 (MQ=255) cTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCAATGTAAATAGCGAGGCCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGAGTGGTTGTCGGAt > 2:3196610/1‑140 (MQ=255) cTGCAATATTTCTACTCTGTTTGTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCTCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGC‑TATGATTAGAATTGTTTTCGTCACATCAGTTAATGCTGCGTGGTTTTCTGAt > 2:2118442/1‑140 (MQ=255) cAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATgcg > 1:2972041/1‑140 (MQ=255) tttCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTg < 1:925149/140‑1 (MQ=255) tttCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGGAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGTGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTg < 1:1588982/140‑1 (MQ=255) cTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAAc > 2:883919/1‑140 (MQ=255) cTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGAGGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAAc > 1:4916502/1‑140 (MQ=255) aCTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGc < 1:976315/140‑1 (MQ=255) aCTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGc < 1:3004930/140‑1 (MQ=255) ctGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCtt > 1:686221/1‑140 (MQ=255) tGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTa < 1:1518478/140‑1 (MQ=255) tGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTa > 1:4118667/1‑140 (MQ=255) gTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAt < 2:1694943/140‑1 (MQ=255) tttttAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATc > 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tCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACcaacaa < 2:507142/140‑1 (MQ=255) cgcgATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCaacaac > 1:3895919/1‑140 (MQ=255) cgcgATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCaacaac < 2:2842448/140‑1 (MQ=255) cgATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGc > 1:2589678/1‑140 (MQ=255) tGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCAGCAACAACGCTTc > 1:4370810/1‑140 (MQ=255) tGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTc > 1:3164916/1‑140 (MQ=255) tGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTc > 1:776450/1‑140 (MQ=255) aTAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGATAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAggct < 2:3587381/140‑3 (MQ=39) aTAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAggct < 2:3286034/140‑3 (MQ=255) aTAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAggct < 2:4773956/140‑3 (MQ=255) aTAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAggct < 1:2075351/140‑3 (MQ=255) aGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCg < 2:1591878/140‑1 (MQ=255) gAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGAt < 1:2399051/68‑1 (MQ=255) gAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAg > 2:5016801/1‑140 (MQ=255) ggTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAGCt > 2:4377542/1‑140 (MQ=255) ggTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAGCt > 2:3728035/1‑140 (MQ=255) gTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCGACAACGCTTCAGGCTCGTAGCTc > 1:662018/1‑140 (MQ=39) cATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAGCTCaa < 1:1245931/140‑1 (MQ=255) tgttgtAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAGCTCAACt > 1:3408732/1‑140 (MQ=255) | AACCACCTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGTTCGTAGCTCAACTG > NZ_CP025268/3736713‑3736982 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |