| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,013,520 | +G | pseudogene (463/542 nt) | zapC → | cell division protein ZapC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,013,518 | 1 | . | G | 97.9% | 770.5 / 7.6 | 235 | pseudogene (461/542 nt) | zapC | cell division protein ZapC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/2); new base G (122/108); total (125/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑GG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCC > NZ_CP025268/1013380‑1013652 | tGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑g > 2:3003248/1‑140 (MQ=255) ccGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑ggg > 1:3473108/1‑139 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGATCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTTGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑TTT‑gggcga > 2:2985386/1‑136 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGTCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcga < 2:3839619/140‑5 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcga < 1:1437066/140‑5 (MQ=255) ggCGATGCGCCCTGCGTTTGGTTGAGCGATCCTCTCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGACAATGCCGCACTATGCCTGCTTGCACAGCCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcga < 2:1709272/140‑5 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcgac > 2:3405360/1‑135 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcgac < 1:1119096/140‑6 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcgac < 1:1119853/140‑6 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGccc > 2:2743808/1‑139 (MQ=255) gCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCAt > 1:691151/1‑140 (MQ=255) ccTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTaaa > 1:4121324/1‑140 (MQ=255) cTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTaaaa < 1:1253287/140‑1 (MQ=255) cTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTaaaa < 2:3336792/140‑1 (MQ=255) tGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAAt > 2:2864940/1‑140 (MQ=255) cGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCa > 1:4428842/1‑140 (MQ=255) cGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCa > 1:4792169/1‑140 (MQ=255) gTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCAt < 1:2928373/140‑1 (MQ=255) gTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCAACACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCAt < 2:651610/140‑1 (MQ=255) ggTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAAc > 1:2471900/1‑140 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCACTTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTACGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 2:3075574/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:2673086/140‑1 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 1:4645677/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 2:194702/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 1:1955733/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 2:2393667/1‑140 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 1:3856848/140‑1 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGATGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 2:4139992/140‑1 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:68329/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:4996803/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:1601750/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:3874581/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGAAGGt > 2:669757/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 2:2763355/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:967476/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:4162840/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:4188016/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:2443644/1‑140 (MQ=255) tGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAc < 2:4827522/140‑1 (MQ=255) gCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGa < 2:4056582/138‑1 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 1:1714786/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 2:3361658/1‑140 (MQ=255) gTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 1:937617/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGTACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 1:3040596/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 2:4090964/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 1:755699/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 1:2163392/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 1:210938/140‑1 (MQ=255) cGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAAc > 1:2304821/1‑140 (MQ=255) aCTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAAcgcg < 1:382665/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 1:3153599/1‑140 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGGCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 1:2734989/1‑140 (MQ=255) gctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTaa > 1:4313893/1‑140 (MQ=255) gctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTaa > 2:3994501/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCGTGCGTTGGTATTGCGGGTCTCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAAGGACAGGCTGAAACCGCGGGTTAATGTGGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAAGGCGCCAACGTAAATg > 2:423257/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 2:3466379/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAACCCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:1239928/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAGTGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:3652681/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 1:4084908/114‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 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cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 2:2701881/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATAATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGGTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCGACTTAAGTGCa > 2:3142766/1‑140 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGAGGGTCGCGCGATGAA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTAAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:4636361/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTAGTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATAAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTTAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:2838427/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 1:2701881/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt > 2:4947669/1‑140 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 2:946701/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt > 1:344946/1‑140 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGCTGACAGCTTCAGCCTCGTACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 2:4428842/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGGTAATGTGGACAGCTTCAGCCGCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 1:526013/140‑1 (MQ=255) tGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GGTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCgg < 2:2281918/140‑1 (MQ=255) gCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCCGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGt > 2:2460704/1‑140 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 2:3438666/135‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa > 2:812261/1‑140 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 1:4668147/140‑1 (MQ=255) gttgttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTac < 1:2865581/140‑1 (MQ=255) gttgttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTac < 1:1473012/140‑1 (MQ=255) gttgttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTac < 1:3915743/140‑1 (MQ=255) ttgttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTaca < 1:59857/140‑1 (MQ=255) ttcttGCGGGTGGCGCGGTGAA‑GTT‑GGTCGACGCCATTAAAATCATGCACGACAGCCTGAAAACGCAGGTTAAGGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCCTCTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg < 2:1136413/137‑1 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:4922582/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:884936/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:3251135/1‑140 (MQ=255) tgaTTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CTTCGCCATTAAAGTCATGTCCGACAGGCTTAAACCGCTGGTTCATGTTGACAGCTTCGGGCTTGAACAGGCAGTCTAACGCCCTTACTTAAGTTCTGTCTTCGGTatatgg > 2:292609/3‑135 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa < 1:2283011/140‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 2:2367006/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 2:2245686/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:1573847/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa < 1:1267892/140‑1 (MQ=255) ggcgATGCAGGTG‑GG‑CGACGCCGTTAACATCATGAGCGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTTACAGCTTCAGCCTCGAAAAGGCAGTCTAACGCGCGAACTTAAGGGCAGTCTTCGGGACACAGCTACAGCAAGGaa > 2:1839009/2‑140 (MQ=255) tGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTg < 1:4533215/140‑1 (MQ=255) tGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTg < 2:4274654/140‑1 (MQ=255) tGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTg < 1:1768547/140‑1 (MQ=255) tGCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTg < 2:2651260/140‑1 (MQ=255) gCA‑GTTGGG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGc < 1:3405360/140‑1 (MQ=255) | TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑GG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCC > NZ_CP025268/1013380‑1013652 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |