| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,215,634 | +C | pseudogene (402/405 nt) | tfaP → | tail fiber assembly protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,215,634 | 1 | . | C | 98.8% | 1092.2 / 4.4 | 331 | pseudogene (402/405 nt) | tfaP | tail fiber assembly protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/0); new base C (203/124); total (207/124) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 344 total aligned reads displayed.
GGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCA‑GTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCAGA > NZ_CP025268/1215495‑1215767 | ggCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATGATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGACACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑Gtt < 2:3481084/140‑1 (MQ=255) ggTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCGAGATATTGAATGGCCTACGGCTCCGGCA‑Gttcaggc > 2:3895832/1‑135 (MQ=25) tAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCa > 1:2132741/1‑140 (MQ=255) aGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGa > 1:1328413/1‑140 (MQ=255) aGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGa > 1:1551324/1‑140 (MQ=255) aGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGa > 2:4985520/1‑140 (MQ=255) aGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGa > 2:2453119/1‑140 (MQ=255) aGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGa > 1:185743/1‑140 (MQ=255) aGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGa > 2:1895416/1‑140 (MQ=255) gCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATg > 1:93397/1‑140 (MQ=255) gCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATg < 2:5561/140‑1 (MQ=255) cATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACAt > 1:1052393/1‑140 (MQ=255) cATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACAt > 1:849935/1‑140 (MQ=255) cATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACAt > 2:1236570/1‑140 (MQ=255) cATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACAt > 1:2487738/1‑140 (MQ=255) cATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACAt > 1:1203490/1‑140 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:3721061/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:4609480/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:1465322/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:625767/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 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aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 1:2678824/1‑140 (MQ=255) cTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTg < 2:2516085/140‑1 (MQ=255) aagaagATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTgg > 1:4341170/1‑140 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt > 1:2969924/1‑140 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt > 1:3141022/1‑140 (MQ=255) gCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGc > 1:4289548/1‑140 (MQ=255) cTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGcc > 2:1554649/1‑140 (MQ=255) aCAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCAc < 1:3214910/140‑1 (MQ=255) tataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACcgcg > 1:4140443/1‑140 (MQ=255) tataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACcgcg < 2:2614221/140‑1 (MQ=255) tataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACcgcg > 2:1923307/1‑140 (MQ=255) tataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACcgcg > 1:3234487/1‑140 (MQ=255) ataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGt < 1:1953544/140‑1 (MQ=255) ataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGt < 2:2728752/140‑1 (MQ=255) ataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGt < 2:3716305/140‑1 (MQ=255) aTTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCaa < 1:3416370/140‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACCTCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATg < 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ggCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAAt > 1:4565164/1‑140 (MQ=255) gCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATc > 1:2257555/1‑140 (MQ=255) cTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATcc > 2:446551/1‑140 (MQ=255) gATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATg < 2:773003/131‑1 (MQ=255) gATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGc > 1:4715100/1‑140 (MQ=255) gATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGc > 2:464999/1‑140 (MQ=255) aTTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGca > 2:2962115/1‑140 (MQ=255) ttATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGcac < 1:1418192/140‑1 (MQ=255) ttATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGcac < 2:4203671/140‑1 (MQ=255) ttATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGcac < 2:2003561/140‑1 (MQ=255) ttATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGcac < 1:70194/140‑1 (MQ=255) ggAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGtt < 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ggTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGACAGATGACATCCGGTGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTc > 2:4711999/1‑140 (MQ=14) gTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTct > 2:3314095/1‑140 (MQ=255) aTACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTctgcct > 2:3778015/1‑140 (MQ=255) ccAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCa > 2:1644502/1‑140 (MQ=255) ccAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCa > 2:66527/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGttt > 2:911602/1‑140 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2:1311755/1‑140 (MQ=14) ttGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCTTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCt < 2:3658502/140‑1 (MQ=255) tGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTg > 1:1937009/1‑140 (MQ=255) tGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCGGGTGGTTTCTTCCTGCGGCAGTTTACTGCCGGCCTg > 2:1398333/1‑140 (MQ=14) tGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAAt < 2:4385824/140‑1 (MQ=255) tGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAAt < 2:2899060/140‑1 (MQ=255) ggCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAAtt < 1:2785317/140‑1 (MQ=255) cctACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTc > 2:2103076/3‑140 (MQ=255) cctACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTc > 2:543665/3‑140 (MQ=255) cctACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTc > 1:3925950/3‑140 (MQ=255) cctACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGGCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTc > 2:845123/3‑140 (MQ=255) ctACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCa > 1:1132558/2‑140 (MQ=255) aCGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGt < 2:1807610/140‑1 (MQ=255) aCGCCTCCGGCA‑GTTCAGGACAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGt < 1:1763683/140‑1 (MQ=255) tCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATGCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAAt < 2:4042654/140‑1 (MQ=255) tCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTCTCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAAt < 1:660648/140‑1 (MQ=255) cGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCa > 1:3830517/1‑140 (MQ=255) 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1:1538460/140‑1 (MQ=255) gCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCAGa < 2:3205392/140‑1 (MQ=255) | GGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCA‑GTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCAGA > NZ_CP025268/1215495‑1215767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |