New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
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< 1:4964982‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaacctccgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccccttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 2:1093662‑M1/140‑135 (MQ=255) gATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaaggctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgcc > 1:4240094‑M1/1‑4 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccg < 1:3720278‑M1/140‑138 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgcgcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccg > 2:954351‑M1/1‑3 (MQ=255) ttcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccacca < 2:291714‑M1/69‑68 (MQ=255) tcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccgct > 1:4063142‑M1/1‑1 (MQ=255) tcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccgct > 1:948998‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGT > NZ_CP025268/1292962‑1293240 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |