| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | = 3743324 | 0 (0.000) | 107 (0.360) | 50/274 | 2.1 | 100% | intergenic (‑100/‑82) | yiaJ/galK | IclR family transcriptional regulator YiaJ/galactokinase |
| ? | NZ_CP025268 | 3744556 = | 0 (0.000) | intergenic (+2/‑99) | galK/yiaK | galactokinase/3‑dehydro‑L‑gulonate 2‑dehydrogenase | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCCTGTTGACAATTAATCATCGGCATAGTATATCGGCATAGTATAATACGACAAGGTGAGGAACTAAACCCAGGAGGCAGATCATGAGTCTGAAAGAAAAAACACAATCTCTGTTTGCCAACGCATTTGGCTACCCTGCC > NZ_CP025268/3743188‑3743462 | tctcGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCag > 1:2422609‑M1/1‑138 (MQ=255) ctcGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCaga < 2:11124‑M1/140‑4 (MQ=255) ctcGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCaga < 2:10344‑M1/140‑4 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCGCGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:4557175‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 1:3524914‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:1421905‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTGCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:2020824‑M1/140‑9 (MQ=255) ctctTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcct > 1:3062280‑M1/1‑131 (MQ=255) tgttttccCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgtt < 2:3251195‑M1/138‑14 (MQ=255) tttCCCATCACTTGTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGACATTCATCAATCagattgccttgttaaa < 2:5102523‑M1/140‑17 (MQ=255) tttCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaa < 1:3194329‑M1/140‑17 (MQ=255) tttCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaa < 1:505423‑M1/140‑17 (MQ=255) aTCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtga > 1:1353830‑M1/1‑118 (MQ=255) tCACTTCTTTCCTCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttacaaagtgat < 2:3616838‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:1188300‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:4178295‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 2:4157741‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 2:4319444‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:1294711‑M1/140‑24 (MQ=255) acaCTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:4503602‑M1/139‑24 (MQ=255) ttcttTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgat < 1:3335585‑M1/140‑28 (MQ=255) cccATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttg > 1:3375160‑M1/1‑106 (MQ=255) ccATGTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAATGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGTCAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCGTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttga > 2:167663‑M1/1‑105 (MQ=255) tttGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatc < 2:2422609‑M1/140‑40 (MQ=255) 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2:1580671‑M1/1‑80 (MQ=255) cgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattt > 1:1840295‑M1/1‑80 (MQ=255) cgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCGCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattt > 2:1080507‑M1/1‑80 (MQ=255) cAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaatttta < 2:1926616‑M1/140‑63 (MQ=255) cAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaatttta < 2:2504594‑M1/140‑63 (MQ=255) aaaGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTTATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtggtcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaa > 1:2084681‑M1/1‑77 (MQ=255) 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2:4912553‑M1/140‑76 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgat > 2:471182‑M1/1‑63 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgat > 1:948859‑M1/1‑63 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgat > 1:2789429‑M1/1‑63 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgat > 2:1190993‑M1/1‑63 (MQ=255) cACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatca > 1:1262659‑M1/1‑61 (MQ=255) 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2:1361396‑M1/4‑26 (MQ=255) tATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaagaaaacatgggatgaaagtgacatttga > 2:2889272‑M1/1‑24 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgacatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 2:3375160‑M1/140‑118 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 1:4672365‑M1/140‑118 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 1:1721411‑M1/140‑118 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 1:2148702‑M1/140‑118 (MQ=255) 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1:861119‑M1/1‑18 (MQ=255) tttGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagtta > 1:4681541‑M1/1‑17 (MQ=255) tttGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatattgtaaagcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctggtatgaaagtgacatttgagcagtta > 1:2592467‑M1/1‑17 (MQ=255) ttGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgagattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaa > 2:4711745‑M1/1‑16 (MQ=255) ttGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaa > 1:850854‑M1/1‑16 (MQ=255) aaaTTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaag < 1:1469397‑M1/140‑128 (MQ=255) 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TCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCCTGTTGACAATTAATCATCGGCATAGTATATCGGCATAGTATAATACGACAAGGTGAGGAACTAAACCCAGGAGGCAGATCATGAGTCTGAAAGAAAAAACACAATCTCTGTTTGCCAACGCATTTGGCTACCCTGCC > NZ_CP025268/3743188‑3743462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |