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gACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCat < 1:5029900/140‑2 (MQ=255) aCCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACGAACTGAGCTACGTAGCCAGACTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCatc > 1:3072259/1‑138 (MQ=255) catcatTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCatccgta < 1:5015543/140‑7 (MQ=255) atcatTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGCTTGTTTCTTCGATGACTGGGGTAGCTGTATTCGAACCAGGGAATGCAGGTATCAAAAACGGGTGCCTTACCTCTTCGCGATACCCCatccgtac > 2:4162068/1‑133 (MQ=25) atcatTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCatccgtac > 1:2961916/1‑133 (MQ=255) atcatTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCatccgtac > 1:3689339/1‑133 (MQ=255) atcatTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCatccgtac > 1:1683159/1‑133 (MQ=255) atcatTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCatccgtac > 1:1039002/1‑133 (MQ=255) atcatTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTCTCCTACGTAGCCATATTGTTTCTTCCATGCCTAGGGGAGCAGGATTCGATCCTGGGAATGCCAGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCatccgtac > 2:3974342/1‑133 (MQ=18) aTGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGc > 2:3316413/1‑111 (MQ=255) aTGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGc < 1:3316413/111‑1 (MQ=255) | ACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCG > NZ_CP025268/695665‑695885 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |