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                             aTCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTaca                         >  1:5062586/1‑140 (MQ=255)
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                              tCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTacac                        >  1:4845569/1‑140 (MQ=255)
                               cGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATGGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACg                       <  1:726791/140‑1 (MQ=255)
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                                 cTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCt                     <  1:189259/140‑1 (MQ=255)
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                                      agagCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCaa                <  2:4684800/140‑1 (MQ=255)
                                       gagCCTGTTGTAATAACCATTCCCCATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAATCTTCTTTTAAAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGATATCaaa               <  2:109299/140‑1 (MQ=255)
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                                              gtgtAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCaa        <  2:3347517/140‑1 (MQ=255)
                                                  aataaCAATTCCCGATCGTCTTTGGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATGcc    >  2:3307750/1‑140 (MQ=255)
                                                  aataaCAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATGcc    >  2:3307765/1‑140 (MQ=255)
                                                  aataaCAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATGcc    <  2:1656219/140‑1 (MQ=255)
                                                  aataaCAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATGcc    <  1:1028591/140‑1 (MQ=255)
                                                   ataaCAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCTTGTATAATAGGAATGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATGccc   >  2:2618984/1‑140 (MQ=255)
                                                    taaCAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAATAATCAATGCCCa  >  2:3605290/1‑140 (MQ=255)
                                                    |                                                                                                                                           
GCAAGCTCGTCAGGCGCTGGAGTGGATTTATCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATGCCCA  >  NZ_CP025268/2861912‑2862103

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: