Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 448,506 | 0 | T | C | 21.1% | 774.7 / 49.1 | 327 | M396V (ATG→GTG) | cyoB | cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (136/122); new base C (0/69); total (136/191) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.42e-19 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
TTAGGCCACCAGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAATCATTGTGGTGATA > NZ_CP025268/448367‑448645 | ttAGGCCACCAGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCAt < 2:1087461/140‑1 (MQ=255) ggCCACCAGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATccc < 1:698191/140‑1 (MQ=255) caccaGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGcc < 1:2473185/140‑1 (MQ=255) caGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCAc > 1:2944149/1‑140 (MQ=255) caGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCAc > 1:2727137/1‑140 (MQ=255) ggTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCgaga > 2:2559606/1‑140 (MQ=255) tCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCgag > 1:3558195/1‑134 (MQ=255) tCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCgag < 2:3558195/134‑1 (MQ=255) tCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTg > 1:4349059/1‑140 (MQ=255) tCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTg > 1:457829/1‑140 (MQ=255) tCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTg > 1:4922414/1‑140 (MQ=255) tCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTg > 2:113476/1‑140 (MQ=255) tCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTg > 1:1026298/1‑140 (MQ=255) tCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTg > 1:861885/1‑140 (MQ=255) cTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACg > 1:1955650/1‑140 (MQ=255) cGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGGGACGATa > 2:487190/1‑140 (MQ=255) gcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCTTTTTTCCTGTTACGGCGACCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGa < 2:2616017/140‑1 (MQ=255) gcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCTGTTTGCAAGTTACGGCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGa < 2:525610/140‑1 (MQ=255) gcCGAAGACCACGCCGCCGATGACCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCCCCGAGAAGGTGACGATAAAACCGa < 1:4135544/140‑1 (MQ=255) ccccaaGACCACGCCGCAGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCTTTATTAATGATACGGCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGa < 2:3759099/136‑1 (MQ=255) ccGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGAt > 2:4374451/1‑140 (MQ=255) aGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTc < 1:900536/140‑1 (MQ=255) aCCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCCGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGACAGTCACCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCca < 2:1819256/140‑1 (MQ=255) cgccgcCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGc > 1:623960/1‑140 (MQ=255) cgccgcCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGc > 1:3173338/1‑140 (MQ=255) gccgccGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCTGTATTACAGACACGGCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCcacatca < 2:2571639/140‑4 (MQ=255) gccgccGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCa < 1:4735565/140‑1 (MQ=255) cgATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAACCCGATGGTCCACAGCATCGCa < 1:2873498/140‑1 (MQ=255) cgATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCAAGTCACCCCGACCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCa < 2:552535/140‑1 (MQ=255) atgatCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAACCCGCTGGTCCACAGCATCGCAGa > 1:4055178/1‑140 (MQ=255) atCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCTGTTTGAATGATACGGCGACCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATg < 2:396307/140‑1 (MQ=255) aTGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCTCCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGa > 1:155752/1‑140 (MQ=255) aTGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGa > 1:5087035/1‑140 (MQ=255) tgAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTTTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCTGTTCTCATGTCACCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATg < 2:1274893/139‑1 (MQ=255) ggAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTCTGCAGAACCCAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCTTTTTTAATGTTACGGCGACCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATg < 2:1358027/140‑1 (MQ=255) ggAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATg < 1:3915880/140‑1 (MQ=255) ggAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATg < 2:3819144/140‑1 (MQ=255) gAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCTAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGc < 1:1386647/140‑1 (MQ=255) gAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGc < 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aGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGCCCGCGCCCGGTACGGCCAGCTGTACGAATGATACGGCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCgg < 2:863367/140‑1 (MQ=255) tacgcCATAAGGACCCGGCTGTTATGCAGAACGAACTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGTAAGTCCGTCACCCCGACCACCGAGCAGGTGACGATAAAGCCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGcc < 2:4267408/138‑1 (MQ=255) tGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGcc < 1:4459079/140‑1 (MQ=255) tGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGcc > 1:1242728/1‑140 (MQ=255) tGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGcc > 2:2769182/1‑140 (MQ=255) tGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGcc > 1:4861485/1‑140 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1:301120/1‑140 (MQ=255) caTCAGGAAACGGCTGTTAGTCAGCACGAAGTTCGCGCCCGGTACGGCCAGCTTTTTGAATGATACGGCGACCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGAt < 2:1776224/139‑1 (MQ=255) aaTCAGAAACAGGCTGTTATGCAGAACGAACTCCGCGCCCGGTACTGACAGCTTCTTTAAAGATATGGCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGAt < 2:4434041/140‑1 (MQ=255) tCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCa < 2:4202244/113‑1 (MQ=255) tCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATAc > 1:87576/1‑140 (MQ=255) cAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACa < 1:113476/140‑1 (MQ=255) aGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACAt < 1:2711663/140‑1 (MQ=255) aaCAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATggg > 1:2027457/1‑139 (MQ=255) aGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGaa > 1:1011250/1‑140 (MQ=255) aGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGaa < 1:2769182/140‑1 (MQ=255) gCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGa < 1:4375857/86‑1 (MQ=255) gCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACa > 1:3468219/1‑140 (MQ=255) gCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACa > 1:3387308/1‑140 (MQ=255) tGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGc < 2:3226769/140‑1 (MQ=255) tGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGc < 2:4794472/140‑1 (MQ=255) gTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCTTTTTTAATGATACGGCGACCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGcc < 2:2138/140‑1 (MQ=255) gCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTg < 1:1494234/140‑1 (MQ=255) gAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAg < 1:3321723/140‑1 (MQ=255) gAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAg < 1:2654562/140‑1 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2:2312221/140‑1 (MQ=255) gcgcCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGt < 1:4777803/50‑1 (MQ=255) gcgcCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGt > 2:4777571/1‑50 (MQ=255) cccGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCACCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGt < 2:2004004/140‑1 (MQ=255) gTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAAGGGAACGCGATGAGGCTTGGATTGATGGTGAACAGCGAGTTGACGATCGTCCCCCCggccagg > 2:2708242/1‑135 (MQ=255) tACGGCCAGCAGCTCGACTGTCACCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGACCAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGa < 2:22695/140‑1 (MQ=255) tACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGa < 1:214832/140‑1 (MQ=255) tACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGa < 1:3224353/140‑1 (MQ=255) agcagcACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGAt < 2:1497769/140‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATa > 1:343666/1‑140 (MQ=255) gcagcaCGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATa < 1:73397/140‑1 (MQ=255) cagcaCGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCACTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATaa > 1:3647247/1‑140 (MQ=255) aggaCGCCGGTCATCCCACCTCCGGAGAAGGTCACGATGAAGCCGATGGTCCACAGCATCGCTGAGGGGAACACGATCCGGCCCTGGTACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTAGGGATGGCGATAAt < 2:1265640/137‑1 (MQ=255) agcaCGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAAt > 1:1441832/1‑140 (MQ=255) caCGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAATCa < 2:4096426/140‑1 (MQ=255) cGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAATCAtt < 2:3355551/140‑1 (MQ=255) cGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAATCAtt > 1:32929/1‑140 (MQ=255) aGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAATCATTgtgg < 1:4000994/140‑1 (MQ=255) aTCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAATCATTGTGGTGAt < 1:1713271/140‑1 (MQ=255) aTCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAATCATTGTGGTGAt > 1:4541651/1‑140 (MQ=255) tCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAATCATTGTGGTGATa < 2:1696903/140‑1 (MQ=255) | TTAGGCCACCAGTAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGCGCAATCAGGAACAGGCTGTTATGCAGAACGAAGTCCGCGCCCGGTACGGCCAGCAGCACGCCAGTCATCCCGCCCACCGAGAAGGTGACGATAAAACCGATGGTCCACAGCATCGCAGAATGGAACACGATGCGGCCCTGATACATGGTGAACAGCCAGTTGAAGATCTTCACCCCGGTCGGGATGGCGATAATCATTGTGGTGATA > NZ_CP025268/448367‑448645 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |