Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 886,964 | A→G | *372* (TAA→TAG) S208S (AGT→AGC) |
yliI → gstB ← |
aldose sugar dehydrogenase YliI glutathione S‑transferase GstB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 886,964 | 0 | A | G | 99.6% | 943.9 / NA | 274 | *372* (TAA→TAG) S208S (AGT→AGC) | yliI gstB | aldose sugar dehydrogenase YliI glutathione S‑transferase GstB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (125/147); minor base T (0/1); total (125/149) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
AGTGACAGAAGATGGCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAACTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGAACGGTGCGATAGCGAT > NZ_CP025268/886829‑887098 | cAGAAGCTGGCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGa < 1:4009455/140‑1 (MQ=255) cAGAAGATGGCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTTGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGa < 1:3639778/140‑1 (MQ=255) gaagaTGGCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAat < 1:4725329/140‑1 (MQ=255) aagaTGGCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAatc > 1:577298/1‑140 (MQ=255) tGGCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAAtcatca > 2:2049881/1‑140 (MQ=255) gggcGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGAGAATTCGTGATGTTCGCACTAGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGACGCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGAGAATCATcac > 2:3746556/4‑140 (MQ=255) gCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAATCATcacc < 2:2441962/140‑1 (MQ=255) gCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAATCATcacc < 1:2011542/140‑1 (MQ=255) gTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACt < 1:854024/140‑1 (MQ=255) tATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAAATAGCTAACGGGAATCATCACCACtt > 2:3379841/1‑140 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(MQ=255) aaTTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTg > 1:661886/1‑140 (MQ=255) ttACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTa > 2:743953/1‑140 (MQ=255) tAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGACTCATCACCACTTTGCGCACTCCGGGGCGTTAAGTGAGTTGCTGATACCAGCGGTGCAGATTTCGACGCGGCGTCCAGGCCCGGCAAACGTTAAACAAATTGTAGATGa > 2:2113620/1‑140 (MQ=255) aaaGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGaa < 2:2091892/140‑1 (MQ=255) aaaGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGaa < 2:128560/140‑1 (MQ=255) aaGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGAAc > 2:382641/1‑140 (MQ=255) aGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGAACg < 2:2883643/140‑1 (MQ=255) aGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGAACg > 1:4318597/1‑140 (MQ=255) gCCCACGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGAACGGTgcg > 1:1823651/1‑140 (MQ=255) gCCCACGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGAACGGTgcg > 2:2341333/1‑140 (MQ=255) cccACGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGAACGGTgcga > 2:1421967/1‑140 (MQ=255) cccACGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGAACGGTgcga < 2:3437637/140‑1 (MQ=255) cGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGt < 2:1862634/98‑1 (MQ=255) cGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGAACGGTgcgatagc > 1:2212116/1‑140 (MQ=255) cGCAATTAGCTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGAACGGTgcgatagc > 1:1971935/1‑140 (MQ=255) | AGTGACAGAAGATGGCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAACTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGAACGGTGCGATAGCGAT > NZ_CP025268/886829‑887098 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |