Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 1,437,092 | A→G | A1075A (GCA→GCG) | stfR → | prophage tail fiber N‑terminal domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 1,437,092 | 0 | A | G | 99.8% | 1458.7 / NA | 440 | A1075A (GCA→GCG) | stfR | prophage tail fiber N‑terminal domain‑containing protein |
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Only 100 of 442 total aligned reads displayed.
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ctgcAAGCGCAGTTGCACACGCGCATACTGTCGGTATTGGTGCTCATACGCACTCCGTTGCGATTGGTTCACATGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCTGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATCGCATTTAAc > 2:5035974/1‑140 (MQ=255) ctgcAAGCGCAGGTGCACACGCGCATACTGTCGGTATTGGTGCTCATACGCACTCCGTTGCGATTGGTTCACATGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCTGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATCGCATTTAAc > 2:1639344/1‑140 (MQ=255) ctgcAAGCGCAGGTGCACACGCGCATACTGTCGGTATTGGTGCTCATACGCACTCCGTTGCGATTGGTTCACATGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCTGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATCGCATTTAAc > 1:250855/1‑140 (MQ=255) ctgcAAGCGCAGGTGCACACGCGCATACTGTCGGTATTGGTGCTCATACGCACTCCGTTGCGATTGGTTCACATGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCTGGTAACACGGAAAACACCGTCAAAAACATCGCATTTAAc > 2:4227680/1‑140 (MQ=255) ctgcAAGCGCAGGTGCACACGCGCATACTGTCGGTATTGGTGCTCATACGCACTCCGTTGCGATTGGGTCACATGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCTGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATCGCCTTTAAc > 2:3347332/1‑140 (MQ=255) aGCGCAGGTGCACACGCGCATACTGTCGGTATTGGTGCTCATACGCACTCCGTTGCGATTGGTTCACATGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCTGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATCGCATTTAACTatat > 1:1920610/1‑140 (MQ=255) aGGTGCACACGCGCATACTGTCGGTATTGGTGCTCATACGCACTCCGTTGCGATTGGTTCACATGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCTGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATCGCATGTAACTATATTGTGa > 1:607553/1‑140 (MQ=255) tGCACACGCGCATACTGTCGGTATTGGTGCTCATACGCACTCCGTTGCGATTGGTTCACATGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCTGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATCGCATTTAACTATATTGTGAGGc < 1:4578408/140‑1 (MQ=21) tGCACACGCGCATACTGTCGGTATTGGTGCTCATACGCACTCCGTTGCGATTGGTTCACATGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCTGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATCGCATTTAACTATATTGTGAGGc < 1:4518967/140‑1 (MQ=21) acGCGCATACTGTCGGTATTGGTGCTCATACGCGCTCCGTTGCGATTGGTTCACATGGACACAACATCACCGTTAACCCTGCTGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATCGCATTTAACGATATTGTCAGGCTTGCa < 2:2429977/140‑1 (MQ=11) | ACGGCTAGTGCTAACTCCGGTGCTGGTAGTGCATCAACAAGATTGTCTGTTGTGCATAATCAAAACTATGCAACATCATCTGCTGGCGCACATACCCACTCACTGTCCGGCACTGCTGCAAGCGCAGGTGCACACGCACATACTGTCGGTATTGGTGCTCATACGCACTCCGTTGCGATTGGTTCACATGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCTGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATCGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCA > NZ_CP025268/1436955‑1437227 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |