| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 1,798,989 | T→C | *327* (TAA→TAG) | btuC ← | vitamin B12 ABC transporter permease BtuC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,798,989 | 0 | T | C | 99.7% | 1070.6 / NA | 315 | *327* (TAA→TAG) | btuC | vitamin B12 ABC transporter permease BtuC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (175/139); total (176/139) | |||||||||||
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Only 100 of 315 total aligned reads displayed.
CCGGCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGTTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCGCTCGCCCC > NZ_CP025268/1798853‑1799123 | ccGGCGAACTTCTCCAGCGTTGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTGGCATCGATTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGACTTTTTTCGGCTaa > 2:3904724/1‑140 (MQ=255) gCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGt > 1:781521/1‑140 (MQ=255) gCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGt > 1:299088/1‑140 (MQ=255) cGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTc < 2:1185316/140‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |