| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,936,791 | (G)6→5 | pseudogene (1097/1180 nt) | purT → | formate‑dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,936,786 | 0 | G | . | 98.4% | 1477.3 / 9.8 | 312 | pseudogene (1092/1180 nt) | purT | formate‑dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/1); new base . (138/169); total (142/170) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.81e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
TGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGATCGG > NZ_CP025268/1936648‑1936917 | tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 1:3169786/140‑1 (MQ=255) tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg > 1:3592129/1‑140 (MQ=255) tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 1:2521013/140‑1 (MQ=255) tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 1:2045589/140‑1 (MQ=255) tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 1:190543/140‑1 (MQ=255) tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg > 1:4850318/1‑140 (MQ=255) tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGGCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg > 2:4413801/1‑140 (MQ=255) tCCTGCAGCTTCTGCCGTTAGTCGGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGGGCATATTTGCATATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 2:3549411/140‑1 (MQ=255) tCCGGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAAGGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATGTGCAGAGGCGTTTATTTTTTAAGCCGGATATTGATGGCAGCGGTCGTCgggggg > 2:2938065/1‑140 (MQ=255) cTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTgggggtg > 1:239670/1‑138 (MQ=255) cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GTGGGTGGCa > 2:839314/1‑140 (MQ=255) cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCa < 1:693984/140‑1 (MQ=255) cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCa > 2:3348019/1‑140 (MQ=255) cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCa < 2:5448768/140‑1 (MQ=255) cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTGGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCa > 1:4658009/1‑140 (MQ=255) cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAAGGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCa < 2:2592187/140‑1 (MQ=255) cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCAAAACTGACCCGTCCCAATGTCACGTTTGATACTGCGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTTGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggctggca < 2:3383689/140‑7 (MQ=255) gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:937158/140‑1 (MQ=255) gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 2:319408/140‑1 (MQ=255) gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:4062377/140‑1 (MQ=255) gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:1754916/140‑1 (MQ=255) gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTCGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 2:3225236/140‑1 (MQ=255) ttCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGTCCAGTCAGAATGTGACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTgg < 2:3898156/140‑1 (MQ=255) ttCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTgg > 2:3734536/1‑140 (MQ=255) ttCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTgg < 1:4505984/140‑1 (MQ=255) tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 2:2277824/1‑140 (MQ=255) tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 2:1767071/1‑140 (MQ=255) tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:3558581/1‑140 (MQ=255) tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGGCAGAATGTCACGTCTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGTGCAGATTTGCAGATTGGTTTATTTGGTAAGCCGGAATTTGATGGCAGCCGCCGTGTGGGGGG‑CGCACTGGc > 2:1222525/1‑140 (MQ=255) cTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCt < 2:57623/140‑1 (MQ=255) ttATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGCTAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCa < 2:4377810/140‑1 (MQ=255) ttATTCCGCCATATCTGTCCAGTCAAAATGTGACGCTTGATTACCTGCAGAATGACGGAGACGCAGACTTGCAGATTCGTCTACTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCa < 2:467427/140‑1 (MQ=255) aTTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCaga > 1:3905289/1‑140 (MQ=255) aTTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCaga < 2:4464715/140‑1 (MQ=255) aTTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCaga < 1:4955707/140‑1 (MQ=255) aTTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCaga < 1:208217/140‑1 (MQ=255) aTTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCa > 1:1480629/1‑138 (MQ=255) gCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAgtg < 1:2178780/140‑1 (MQ=255) ccACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTCCTGCAGAGAgtgt > 1:551989/1‑140 (MQ=255) aaCTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTgttgtt < 1:264934/140‑1 (MQ=255) cTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGa < 1:813460/140‑1 (MQ=255) cTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGa < 2:248837/140‑1 (MQ=255) cTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGa > 1:4764850/1‑140 (MQ=255) tGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGAc < 1:4286745/140‑1 (MQ=255) gACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACg > 1:532679/1‑140 (MQ=255) gACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACg > 2:208302/1‑140 (MQ=255) ccAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGcc > 1:4092278/1‑140 (MQ=255) tCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTg < 1:1018238/140‑1 (MQ=255) tCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTg > 1:3818987/1‑140 (MQ=255) tCAGAATGTCACGTTTGATAAGGTGCGGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTg < 2:1365255/140‑1 (MQ=255) aGAATGTCACGTTTGATAATGTGCCGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGaa < 1:2091593/140‑1 (MQ=255) aGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGaa < 1:4924009/140‑1 (MQ=255) aGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGaa < 1:1558932/140‑1 (MQ=255) aaTGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGG‑GGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAAcg > 1:3397965/1‑140 (MQ=255) aTGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAAcgc > 2:5115773/1‑140 (MQ=255) aCGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGaa > 2:5207602/1‑140 (MQ=255) aCGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGaa > 1:3976006/1‑140 (MQ=255) aCGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACGGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGaa > 2:5426647/1‑140 (MQ=255) aCGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGATAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGaa > 1:3031248/1‑140 (MQ=255) tttGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCa < 1:4341279/140‑1 (MQ=255) ttGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCAc > 1:4691583/1‑140 (MQ=255) tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGACATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 1:2636586/140‑1 (MQ=255) tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 2:4165514/140‑1 (MQ=255) tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa > 2:2724847/1‑140 (MQ=255) tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 1:1316845/140‑1 (MQ=255) cAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGG‑GGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGCCGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACa < 2:5500742/140‑1 (MQ=255) cAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACa < 1:1059750/140‑1 (MQ=255) gAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGCGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAgg > 2:1015509/1‑140 (MQ=255) aaTGCCGTAGGCTCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGTAAATTGATGGCAGCCGTCGGCT‑GGGGGTGGCACTGGTTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTTAACGCGCGAAGCACGCAGCCGGACAggg > 2:71745/1‑139 (MQ=255) aaTGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGt < 1:2752699/140‑1 (MQ=255) tGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTCTTTGGTAAGCCGGAAAGTGCTGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaa < 2:489515/140‑1 (MQ=255) tGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAgagaa > 1:4529137/1‑136 (MQ=255) tGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaa < 2:1114834/140‑1 (MQ=255) tGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaa < 1:3734537/140‑1 (MQ=255) tGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaa < 1:2011468/140‑1 (MQ=255) cGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 2:1738400/1‑140 (MQ=255) cGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 1:1411137/1‑140 (MQ=255) cGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTGTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 2:5033501/1‑140 (MQ=255) cGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTGTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTGGGTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCTGCCGGACAGGGAAAAg > 2:864131/1‑140 (MQ=255) tAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa > 2:1569969/1‑140 (MQ=255) tAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 2:681108/140‑1 (MQ=255) tAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 1:4024634/140‑1 (MQ=255) ggCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACa < 2:289438/140‑1 (MQ=255) ggCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACa < 1:5211585/140‑1 (MQ=255) gcgcAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAg > 1:5054245/1‑140 (MQ=255) aGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGtt > 2:2144505/1‑140 (MQ=255) tCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCaaa > 1:2878477/1‑140 (MQ=255) tCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCaaa > 1:3261667/1‑140 (MQ=255) tCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCaaa > 1:5582853/1‑140 (MQ=255) gTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCaaaaa < 1:880513/140‑1 (MQ=255) ttGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaa > 1:3476119/1‑108 (MQ=255) ggTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTAc > 2:1464158/1‑140 (MQ=255) aaGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCACGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACaaa > 1:616123/1‑140 (MQ=255) cGGAAATTGAGGGCAGCCGTCGTCTGGGGTG‑GGCACTGGCTACTGCAGAGAGGGTGGTTGACGCCATTGAACGGTCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATg > 1:1787908/1‑140 (MQ=255) gAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGcc < 1:3782788/140‑1 (MQ=255) gAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGcc < 2:59933/140‑1 (MQ=255) gAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGcc < 1:4413801/140‑1 (MQ=255) gAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGcc < 2:2527029/140‑1 (MQ=255) tGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTc > 2:2826386/1‑140 (MQ=255) gCAGCCGTCGTCT‑AGGAGCGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGTCATTGAACGCGAGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGGTAAATCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGa > 2:4134724/1‑140 (MQ=255) | TGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGATCGG > NZ_CP025268/1936648‑1936917 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |