Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 1,013,520 | +G | pseudogene (463/542 nt) | zapC → | cell division protein ZapC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,013,518 | 1 | . | G | 97.1% | 977.7 / 19.7 | 306 | pseudogene (461/542 nt) | zapC | cell division protein ZapC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (8/1); new base G (162/135); total (170/136) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.67e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 316 total aligned reads displayed.
TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑G‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013380‑1013651 | ccGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑g‑gg < 1:3639652/140‑2 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑g‑ggcga < 2:3943744/140‑5 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTAAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGACGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGCTGTTATTGCGGGCCGCGCGATGCA‑C‑TT‑g‑ggcga > 2:3548555/1‑136 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑g‑ggcgac > 2:3331824/1‑135 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑g‑ggcgac > 2:3766291/1‑135 (MQ=255) tGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAAt > 1:1483147/1‑140 (MQ=255) gTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCAt < 2:274132/140‑1 (MQ=255) gTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCAt < 1:1224963/140‑1 (MQ=255) gTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCAt < 1:770883/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 2:3437559/140‑1 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAGAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGGCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 2:4405969/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 2:2296979/1‑140 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:5597364/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:3213407/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 1:624599/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 1:1664635/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:5047112/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 1:1346962/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCGGGTCGTTGAATCGGGCGAAAATGGCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:3915844/140‑1 (MQ=255) gAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCa > 1:5049685/1‑140 (MQ=255) gAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCa > 2:2605605/1‑140 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 2:2681742/140‑1 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 2:4505602/140‑1 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:4936011/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:2546121/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:3134386/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:980324/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTCGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:355319/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGG‑TG‑G‑GCGACGCCATTAAAATGATGGACGACAGGCTGAAACCGTAgggtgg > 2:3175139/1‑136 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 2:1549601/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:536587/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:578189/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:705624/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:1952457/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:4300016/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:3090725/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATCGCGGGTCGCGCGATCCA‑GCTC‑G‑GCGACGCCATTAACATCATGCACCACACGCCGCAACCGCAGGGTaa > 2:2381072/1‑140 (MQ=255) tGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAc < 1:2687421/140‑1 (MQ=255) tGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCGGCTGGCACAACCCTCCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATTCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAACCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAc < 2:2138002/140‑1 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 1:1136258/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 1:2739999/1‑140 (MQ=255) gAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCt < 2:5001767/140‑1 (MQ=255) cTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑GCGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCCGAAACCCCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGaa > 2:4690035/1‑140 (MQ=255) tGGAGAAAATGACGCAATACGCATGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGAGCGATGAC‑G‑TTGG‑GCGAAGCCATTAAAATCATGCAAGCCAGGCTGAACCCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAAc < 2:2904360/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 1:2768554/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 2:1000346/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 2:5450417/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGCGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCTCAAGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa < 2:3091410/140‑1 (MQ=255) ctgGCACAACCCTGCGTTTTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATGGACATCATGAACGACAGGCTGAAGCCGCACGTTAATGTTGGCAGCTTCAGCCTCGACCAGGCCCTCTAACTCGCCAACCTaaa > 2:2987025/1‑139 (MQ=255) ctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAg > 2:941538/1‑140 (MQ=255) ctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAg > 2:5102124/1‑140 (MQ=255) ctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAg > 2:4616507/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 2:1262459/140‑1 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 2:1621245/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCC‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACCGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:513522/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACATGCAGTCTAACGCGCGAACTTAAGTGCa > 1:301240/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 2:3674822/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:5339343/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:3835298/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:3447189/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:3296039/1‑140 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:1638778/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:1781045/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:2374103/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:4794909/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt > 1:3511503/1‑140 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:1694958/140‑1 (MQ=255) cgcTGGGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCCTTAAAATCCTGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTCATGCTGACAGCTTCTGCTTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt > 2:890412/3‑140 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 1:1045678/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 1:2179219/140‑1 (MQ=255) tGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGAGCAGTCTTCgg > 1:3324604/1‑140 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 2:4557697/140‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 2:4320606/140‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCAGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 1:4786606/140‑1 (MQ=255) gttgttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTac < 1:3760828/140‑1 (MQ=255) ttgttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTaca < 2:1167751/140‑1 (MQ=255) tgttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTacac > 1:5185701/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:5399369/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:2008987/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:4790327/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:2178895/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:2806726/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:3381271/1‑140 (MQ=255) tATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGc < 2:790902/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:1877572/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:4168860/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGGTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:1974327/140‑1 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 1:3189436/1‑140 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 1:5520068/1‑140 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 1:2339792/1‑140 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCGCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 1:5005102/1‑140 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGAAGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa < 2:4865041/140‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGTAGGGTAATGTTGACAGCTTCAGGCGCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCGACAGCa > 2:2073082/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 1:2551409/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGAAGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa < 1:483441/140‑1 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa < 2:3581974/140‑1 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:2916360/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:4358598/1‑140 (MQ=255) cgcgATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa > 1:4483317/1‑140 (MQ=255) cgATGCA‑G‑TTGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATg < 1:250889/140‑1 (MQ=255) | TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑G‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013380‑1013651 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |