Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 1,768,801 | +G | pseudogene (23/1487 nt) | sufB ← | Fe‑S cluster assembly protein SufB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,768,801 | 1 | . | G | 99.6% | 909.6 / NA | 272 | pseudogene (23/1487 nt) | sufB | Fe‑S cluster assembly protein SufB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); major base G (95/174); minor base T (0/1); total (97/175) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
ACTCCGGCTCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑A‑TTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCTTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGACTTCCGTG > NZ_CP025268/1768662‑1768934 | aCTCCGGCTCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑a > 1:1853556/1‑140 (MQ=255) aCTCCGGCTCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCAGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑a > 1:5108059/1‑140 (MQ=255) tCCGGCTCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑agt > 1:3554846/1‑138 (MQ=255) tCCGGCTCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑agt < 1:4019161/140‑3 (MQ=255) cTCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCTTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTTACATCGTC‑AGTTGCtt < 2:3588331/140‑1 (MQ=255) cTCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCtt > 2:3597171/1‑140 (MQ=255) cTCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCtt < 1:3219895/140‑1 (MQ=255) cTCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCtt > 2:2441612/1‑140 (MQ=255) cTCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCtt < 1:2471843/140‑1 (MQ=255) cTCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCtt > 2:1482819/1‑140 (MQ=255) cTCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTCATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCtt < 2:4806041/140‑1 (MQ=255) tCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTc < 2:5292234/140‑1 (MQ=255) tCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTc < 1:1697945/140‑1 (MQ=255) tCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTc < 1:1350714/140‑1 (MQ=255) tCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTc < 1:2501656/140‑1 (MQ=255) tCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTc < 1:2726248/140‑1 (MQ=255) tCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTc < 1:940811/140‑1 (MQ=255) aTTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAg < 2:3197381/140‑1 (MQ=255) aTTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAg < 2:699657/140‑1 (MQ=255) aTTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTACGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGCGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAg < 2:4974572/140‑1 (MQ=255) tACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCTGGGCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTa > 2:1190928/1‑140 (MQ=255) tACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCTTC‑AGTTGCTTCAGTa > 1:1156306/1‑140 (MQ=255) gCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTAttg < 2:2964798/140‑2 (MQ=255) gCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTa < 1:750916/140‑1 (MQ=255) gCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTa < 2:1008763/140‑1 (MQ=255) ttCTCCGACATCGCGCGCACCAACTCTTAGTTTATCCCCTTTGACAGCTCATCGGTGGCTACCTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCAGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg < 2:2566394/140‑1 (MQ=255) ttCGCCGAAATTGCGCGCCCCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg < 1:347359/140‑1 (MQ=255) ttCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTCTCCCCTTTTCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTCACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg < 2:3072299/140‑1 (MQ=255) ttCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCGGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg < 2:4829963/140‑1 (MQ=255) ttCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg > 2:2138501/1‑140 (MQ=255) ttCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg < 1:214765/140‑1 (MQ=255) ttCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg < 1:3013764/140‑1 (MQ=255) ttCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg < 2:1038099/140‑1 (MQ=255) ttCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg < 2:2095229/140‑1 (MQ=255) ttCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg < 2:2955676/140‑1 (MQ=255) ttCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg < 1:4256095/140‑1 (MQ=255) ttCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg < 2:2729384/140‑1 (MQ=255) ttCGCCGAAATTGCGCACACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCACCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg < 1:3101255/140‑1 (MQ=255) cGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACgag < 1:1097344/140‑1 (MQ=255) cGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACgag > 1:1453214/1‑140 (MQ=255) cGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACgag > 1:5509580/1‑140 (MQ=255) cGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg > 2:3832417/1‑138 (MQ=255) gCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACgaga > 1:3598714/1‑140 (MQ=255) ccGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGAc < 1:1596783/140‑1 (MQ=255) aTTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGt < 1:349913/140‑1 (MQ=255) aTTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGt < 1:3375000/140‑1 (MQ=255) ttGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTa < 1:3070303/140‑1 (MQ=255) tGCGCGCACTACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCCTCGGTTGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCCTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTAc < 2:3675660/140‑1 (MQ=255) tGCGCGCACCACCTCTTCGTTTTTCCCCGTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTAc < 2:5391087/140‑1 (MQ=255) gcgcgcACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTAcc < 1:4438967/140‑1 (MQ=255) tctTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCa < 2:4458660/140‑1 (MQ=255) tctTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCa < 1:490433/140‑1 (MQ=255) tttATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCtt > 1:5540365/1‑140 (MQ=255) tATCCCCTTCGCCAGCTCATCGCTGGCTAACTCGCTGAAGAATTCTCCTTTATAATTCAGCGCGCCGCCGGTCCATGTTTTGACATAGTC‑ACTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCTTATATCCCAAAGCTTTc > 2:768710/1‑140 (MQ=255) aTCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCg > 1:1727254/1‑140 (MQ=255) tCCCCTTTGCCAGCTTATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCGTCTGTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTGTTGACAGCGTCGG‑TTGATTCAGTATTACGAGGCATAGTACCGCCTATAGCGCAAAGGTTTCgc > 2:3314124/1‑140 (MQ=255) cccTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTTGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCgcca < 2:5207588/140‑1 (MQ=255) cccTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCgcca < 1:5314181/140‑1 (MQ=255) cccTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACGGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCTCCGCTCCAGGTTTTGACATCGTC‑ATTTGCTTCAGTACTACGAGACATAGACCCGCACACACCCCCACACTTACgcca < 2:4942343/140‑1 (MQ=255) ttGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCgccacagc > 2:687277/1‑140 (MQ=255) ttGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGGTGATTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCgccacagc < 2:4369883/140‑1 (MQ=255) tGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCgccacagcc > 1:3027704/1‑140 (MQ=255) tGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCgccacagcc > 2:5102790/1‑140 (MQ=255) cTCATCGGTGTCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGTCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCGGTATTATGAGACATAGTATGGCTTGTACGTCAAATCTTTCGCCACGGCGActttg > 2:1612736/1‑139 (MQ=255) cTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCAccttc > 1:2660526/1‑140 (MQ=255) cTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCAcattc > 2:5454867/1‑140 (MQ=255) tCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCAcattca > 1:2247761/1‑140 (MQ=255) aTCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTAGAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAACTTACGCCACAGCCAcattcatt < 2:617947/140‑1 (MQ=255) tCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACattcattc < 2:1374267/140‑1 (MQ=255) tCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACattcattc < 2:5488159/140‑1 (MQ=255) cGGTGGCTAACTGGGTGTAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACCTCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTCCGAGACATAGTACCGCCTGTACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCt < 2:2843675/140‑1 (MQ=255) cGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTCTACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCt < 2:1802093/140‑1 (MQ=255) cGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCt > 2:3821628/1‑140 (MQ=255) ggTTGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTg < 2:2263941/140‑1 (MQ=255) ggTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTg < 1:687277/140‑1 (MQ=255) ggTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTg < 1:372065/140‑1 (MQ=255) tAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCttt < 1:2197104/140‑1 (MQ=255) aaCTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTa > 2:3969495/1‑140 (MQ=255) ggTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGtt > 1:2329315/1‑140 (MQ=255) ggTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGtt > 1:2550718/1‑140 (MQ=255) tGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTtgt > 2:3411014/1‑140 (MQ=255) tGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTtgt > 2:4587502/1‑140 (MQ=255) gaagaaTCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTtgtg < 1:1176794/140‑1 (MQ=255) aaTCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAAt > 1:4352317/1‑140 (MQ=255) aaTCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAAt < 1:5594318/140‑1 (MQ=255) aTCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCAGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAAtt > 2:819843/1‑140 (MQ=255) tcttcttTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCATC‑AGTTGCTTCAGTATTCCGAGACATAGTACCGCCCATACCCCAAAGCTTGCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTg < 1:4941570/139‑1 (MQ=255) ccTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTg > 1:1584815/1‑140 (MQ=255) ccTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTg > 1:3778307/1‑140 (MQ=255) ttcttTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACg < 2:748436/63‑1 (MQ=255) taATTCAGCGGGCCGCCTGTCCAGGTTTAGGCATCGTC‑AGTTGCCTCACTACTCCGAGACATAGTACCGCCCATACCCCACGGCTTTCGCCACAGCCCCATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGATATTTGCATATCTGa < 2:3710142/140‑1 (MQ=255) taATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGa > 1:648088/1‑140 (MQ=255) aTTCTGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCAGATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGAtt > 2:2072535/1‑140 (MQ=255) cAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGCTGTGAAATTTGAATCTCTGATTAAg > 2:4182269/1‑140 (MQ=255) cGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTcc > 1:5045596/1‑140 (MQ=255) cGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTcc > 1:4540627/1‑140 (MQ=255) cGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTcc > 1:3965625/1‑140 (MQ=255) tgccATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGACtt > 2:4081345/4‑140 (MQ=255) tGACATCGTC‑AGTTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGACtt > 1:5404540/1‑140 (MQ=255) tCGTC‑AGTTGCGTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCCTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGACTTCCGTg < 2:2368325/140‑1 (MQ=255) | ACTCCGGCTCATTACGCTTCGCCGAAATTGCGCGCACCACCTCTTCGTTTATCCCCTTTGCCAGCTCATCGGTGGCTAACTGGGTGAAGAATCCTTCTTTATAATTCAGCGGGCCGCCGGTCCAGGTTTTGACATCGTC‑A‑TTGCTTCAGTATTACGAGACATAGTACCGCTTATACCCCAAAGCTTTCGCCACAGCCACATTCATTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGACTTCCGTG > NZ_CP025268/1768662‑1768934 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |