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(MQ=255) ccccccTCTTGTAAATAGATAATGTACTCGCGACAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGCGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGc < 2:4444481/140‑1 (MQ=255) ctctTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTTCCAGACAGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTTACGGGTGAAGTTGTAGAATTTTGGCAGACCGTACCAGTACTGGTGGCCGGTg > 2:1939746/1‑140 (MQ=255) ctTGTTAATAGTTACTGTACTCGCGCCACCGCCACGGCTTGGCCTACCTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTACCGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGcc < 2:3494571/140‑1 (MQ=255) ctTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGcc < 2:1371846/140‑1 (MQ=255) ctTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGcc < 1:5290316/140‑1 (MQ=255) ctTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGcc < 1:155291/140‑1 (MQ=255) tGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCaa < 1:5045760/140‑1 (MQ=255) tAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACa > 1:2817967/1‑140 (MQ=255) tAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACa > 1:5181215/1‑140 (MQ=255) aaTAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATc > 1:3830093/1‑140 (MQ=255) | TGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGTTACT‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAG > NZ_CP025268/2828377‑2828654 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |