Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 4,426,468 | 1 | . | C | 98.5% | 1096.1 / 6.7 | 329 | pseudogene (249/275 nt) | yjfY | DUF1471 family protein YjfY |
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Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
ATTTCCTTCCTCGGGAGATAACTGGTCTAATTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGTTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCG‑T‑G‑A‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATCACGC > NZ_CP025268/4426329‑4426601 | ttccttccTCGGGAGATAACTGGTCTAATTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCG‑T‑gca < 1:3850438/140‑3 (MQ=255) tccttcctCGGGAGATAACTGGTCTAATTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCG‑T‑gcat < 1:485304/140‑4 (MQ=255) ggAGACAACTGGTCTAATCCCGCCGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCATGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATAGCAATGTATCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATTCCCGCGCTGGCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTa < 2:4860102/140‑1 (MQ=255) agaTAACTGGTCTAATTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCTAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTACt < 2:5474766/140‑1 (MQ=255) 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aTAAATATCCGCGCTGGCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTAtgat < 2:5394162/140‑1 (MQ=255) aTAAATATCCGCGCTGGCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTAtgat < 2:1942270/140‑1 (MQ=255) aaaTATCCGCGCTGGCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTAtgattg > 1:3277476/1‑140 (MQ=255) gcgcTGGCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTTCGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAAt < 1:4660868/140‑1 (MQ=255) gcgcTGGCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAAt < 1:4329808/140‑1 (MQ=255) gcgcTGGCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAAt < 1:698002/140‑1 (MQ=255) gcgcTGGCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAAt < 1:1877079/140‑1 (MQ=255) gcgcTGGCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCACAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAAt < 1:5093633/140‑1 (MQ=255) ccgcTGGCG‑T‑GCA‑TCGAGCCGTTACTCCCCGGCGCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGGACGTTGCGCCTTGCGCATCTGGTTCTTCCTTGATTGCATGACGTGCTTCGCTTTCCGTGGCGAAATTATGATTGATATGAAt < 2:3132115/139‑1 (MQ=255) cgcTGGCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATc > 2:1856094/1‑140 (MQ=255) cTGGCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATCAc > 2:4295053/1‑140 (MQ=255) cTGGCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATCAc > 2:1328733/1‑140 (MQ=255) ggCG‑T‑GCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATCACGc > 2:3912000/1‑140 (MQ=255) | ATTTCCTTCCTCGGGAGATAACTGGTCTAATTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGTTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCG‑T‑G‑A‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATCACGC > NZ_CP025268/4426329‑4426601 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |