| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NZ_CP025268 | 1293574 = | 281 (1.010) | noncoding (66/85 nt) | CXP41_RS06855 | tRNA‑Tyr | |||||
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
GCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGT > NZ_CP025268/1292962‑1293240 | gCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:4883450‑M1/1‑140 (MQ=255) ggCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcg < 2:2934383‑M1/140‑3 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCGCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAACTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcga < 2:5009216‑M1/140‑4 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcga < 1:1120086‑M1/140‑4 (MQ=255) 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1:3571765‑M1/140‑138 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccg < 1:4494602‑M1/140‑138 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgcttttgactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccg > 2:5159621‑M1/1‑3 (MQ=255) | GCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGT > NZ_CP025268/1292962‑1293240 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |