Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 1,211,261 | A→G | K54E (AAG→GAG) | CXP41_RS06340 → | DUF4222 domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 1,211,261 | 0 | A | G | 99.6% | 1648.3 / ‑6.4 | 496 | K54E (AAG→GAG) | CXP41_RS06340 | DUF4222 domain‑containing protein |
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Only 100 of 496 total aligned reads displayed.
CAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTATCTACCTCCGCGAAGGTTATGAGCATGAATGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAAAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGG‑CAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCAT > NZ_CP025268/1211125‑1211394 | aaaGATCACTACGGAGGGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTATCTACCTCCGCGAAGGTTATGAGCATGAATGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAggt < 1:3397020/140‑1 (MQ=255) cACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTATCTACCTCCGCGAAGGTTATGAGCATGAATGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCa > 1:4881442/1‑140 (MQ=255) cACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTATCTACCTCCGCGAAGGTTATGAGCATGAATGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCa > 2:419068/1‑140 (MQ=255) aCTACGGCGCGCCCGTCAGCGTCTTTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTATCTACCTCCGCGCCGGCTATGAGCATCAACGCTTCAGCACGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGGCGGCCAt < 2:4789659/140‑1 (MQ=255) 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2:742360/140‑1 (MQ=255) aaCAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGG‑CAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTaa < 1:806396/140‑1 (MQ=255) tttCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGG‑CAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACg < 2:2291160/140‑1 (MQ=255) tttCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGG‑CAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACg < 2:4654872/140‑1 (MQ=255) gtcgtAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGG‑CAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAgg > 1:4117869/1‑140 (MQ=255) ttgtcaaTTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTCAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGG‑CAATTATGGCCCGCCGGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGgt < 2:671989/135‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) | CAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTATCTACCTCCGCGAAGGTTATGAGCATGAATGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAAAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGG‑CAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCAT > NZ_CP025268/1211125‑1211394 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |