Predicted mutation
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RA	NZ_CP025268	1,576,151	T→G	I238I (ATA→ATC)	gadB ←	glutamate decarboxylase

Read alignment evidence...
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*	NZ_CP025268	1,576,151	0	T	G	98.8%	183.8 / NA	84	I238I (ATA→ATC)	gadB	glutamate decarboxylase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/1);  new base G (43/40);  total (43/41)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

CCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCTATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCATG  >  NZ_CP025268/1576084‑1576286                                                                    |                                                                                                                                          cccAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCa                                                                   <  1:2982135/140‑1 (MQ=11) cccAGACGACATCCGGTGCGACGAACGGTGCGAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACTGGTATCGGCCTGAAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCa                                                                   <  1:2982136/140‑1 (MQ=11)  ccAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑g                                                                >  2:3445197/1‑140 (MQ=14)   cAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTAACA‑‑gt                                                               >  2:2055194/1‑140 (MQ=17)    aGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑gtg                                                              >  2:987086/1‑140 (MQ=18)         atatCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGt                                                         <  2:1269056/140‑1 (MQ=18)         atatCCGGGGCGACGAAAGGTGCCAGGACGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGt                                                         <  2:1268044/140‑1 (MQ=12)          tatCCGGGGTGACGAACGGTGCCAGGAAGCCGCCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACTA‑‑GTGTAGGTc                                                        >  2:1136933/1‑140 (MQ=255)          tatCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGCTGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTc                                                        >  2:1136828/1‑140 (MQ=9)          tatCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTc                                                        >  1:99009/1‑140 (MQ=18)          tatCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTc                                                        >  1:5327977/1‑140 (MQ=18)          tatCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTc                                                        >  2:4910726/1‑140 (MQ=14)          tatCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTc                                                        >  1:2173158/1‑140 (MQ=18)          tatCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTc                                                        >  1:4490832/1‑140 (MQ=18)          tagccGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGTGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTc                                                        >  1:418283/4‑140 (MQ=9)           atCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCa                                                       >  2:1774758/1‑140 (MQ=17)            tCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATGCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCAc                                                      >  2:5345933/1‑140 (MQ=12)              cGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTCGGTCACGc                                                    <  2:3361510/140‑1 (MQ=18)                gggCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCg                                                  >  2:1827933/1‑140 (MQ=18)                gggCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCg                                                  >  1:2160838/1‑140 (MQ=18)                gggCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCg                                                  >  1:4508268/1‑140 (MQ=14)                gggCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCg                                                  <  2:4481662/140‑1 (MQ=18)                gggCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCg                                                  >  1:4085501/1‑140 (MQ=18)                gggCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCg                                                  >  1:3084733/1‑140 (MQ=18)                 ggCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGa                                                 >  1:435415/1‑140 (MQ=17)                 ggCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGa                                                 >  1:5402078/1‑140 (MQ=18)                 ggCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGa                                                 <  2:1868629/140‑1 (MQ=18)                   cgacgaACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGaaa                                               >  1:385813/1‑140 (MQ=18)                    gacgaACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAg                                              >  2:2565865/1‑140 (MQ=18)                      cgaACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTc                                            >  1:4868917/1‑140 (MQ=18)                      cgaACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTc                                            >  2:888892/1‑140 (MQ=18)                           ggTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGcac                                       <  2:3855928/140‑1 (MQ=17)                             tGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGcacca                                     >  1:2366682/1‑140 (MQ=17)                               ccAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACg                                   <  1:4287453/140‑1 (MQ=18) 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                                      ccACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGCTGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGCACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGgt                           >  1:4653860/1‑140 (MQ=255)                                       ccACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCAGTGTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATg                             >  1:2589018/1‑140 (MQ=11)                                       ccACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGgt                           >  2:4280310/1‑140 (MQ=18)                                       ccACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGgt                           >  2:658590/1‑140 (MQ=17) 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                                                cAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTca                 <  2:2181352/140‑1 (MQ=18)                                                 cAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTca                 <  2:3877044/140‑1 (MQ=18)                                                 cAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTca                 <  2:3384007/140‑1 (MQ=17)                                                 cAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTca                 <  2:1637112/140‑1 (MQ=17)                                                 cAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTca                 <  2:2386446/140‑1 (MQ=18)                                                 cAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTca                 <  2:2473317/140‑1 (MQ=18)                                                 cAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTca                 <  2:2473316/140‑1 (MQ=18)                                                 cAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTca                 <  2:2384774/140‑1 (MQ=18)                                                 cAGAGTCGATGTGAAAGTCGATCTAGCTACCGGTATCGGCCTGGACTTTATCCAGCGCATAGTACAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACAA‑‑GTGTAGGTAACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTca                 <  2:4278482/140‑1 (MQ=11)                                                  aGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTcac                <  2:5136472/140‑1 (MQ=18)                                                   gCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCCTAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTcaca               <  1:2398373/140‑1 (MQ=18)                                                   gCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTcaca               <  2:4798208/140‑1 (MQ=14)                                                   gCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTcaca               <  2:2430845/140‑1 (MQ=18)                                                   gCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTcaca               <  2:2446944/140‑1 (MQ=18)                                                   gCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTcaca               <  2:5106045/140‑1 (MQ=14)                                                   gCGTCGATGTGCACGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGCATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAATTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCCCACCGAAAGTCGGCACCACGCCGCTGGTGTTTTCGTcaca               <  2:4798222/140‑1 (MQ=11)                                                      ccGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGc            <  2:2118683/139‑1 (MQ=18)                                                       cGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCt           <  2:5571295/140‑1 (MQ=18)                                                          tgtgCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCa        >  2:942877/1‑140 (MQ=18)                                                           gtgCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCaa       <  1:564496/140‑1 (MQ=17)                                                              cATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAGGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCa    <  2:5566821/140‑1 (MQ=12)                                                               atgtcgatgtcgATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCAt   >  1:2838952/1‑140 (MQ=17)                                                                tgtcgatgtcgaTACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGTATGTCATAGTTATCA‑‑GTGTAGGTCACGGTGATAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTTGTGATACTCTTCaacgatt  >  2:5334922/1‑135 (MQ=11)                                                                tgtcgatgtcgaTACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCATg  <  2:2131647/140‑1 (MQ=18)                                                                tctCTATGTCGGTATCGGTATCGGCCCTTAATTTATCCAGCGCATTGTTCAGCCGTTGTGGGACATCATACTTACCA‑‑GTGTATGTCACGCAGACAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCATg  <  2:4486277/138‑1 (MQ=11)                                                                    |                                                                                                                                          CCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCTATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTGTGGGAACTCATAGTTACCA‑‑GTGTAGGTCACGCCGAAAGTCGGCACCACGCCGATGGTGTTTTCGTCACAGGCTTCAATCATG  >  NZ_CP025268/1576084‑1576286

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑