| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 1,625,027 | A→G | *73* (TAA→TAG) | marB → | multiple antibiotic resistance protein MarB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NZ_CP025268 | 1,625,027 | 0 | A | G | 99.7% | 1171.2 / NA | 353 | *73* (TAA→TAG) | marB | multiple antibiotic resistance protein MarB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (193/158); minor base T (0/1); total (193/160) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 353 total aligned reads displayed.
GTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGT > NZ_CP025268/1624890‑1625163 | cttcttGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTg > 1:1138012/1‑140 (MQ=255) tcttGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGc < 2:2244007/140‑1 (MQ=255) ttGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGccc > 2:2266074/1‑140 (MQ=255) tgtgCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGcccc > 1:3562272/1‑140 (MQ=255) 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cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCg > 1:4227976/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCg > 1:3485499/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCg > 1:5281713/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCg > 2:5404386/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCg > 1:5544217/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCg > 1:788585/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCg > 2:4890813/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCg > 2:2887628/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCATATTAACGTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCTCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGACATAATGACCACCGCACCTAAAAATTGCATACCCg > 2:1019905/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTACTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACGTCCCACCTTTACCGCGTGACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCGAAAAATAGCAGACCCg > 2:618710/1‑140 (MQ=255) gCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCACGCCAAATACATTGATATCCAGCCCGGTCATAATGAACACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTa > 2:2130361/1‑140 (MQ=255) tGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCg < 2:3914551/140‑1 (MQ=255) tGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGATCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCg > 2:4567961/1‑140 (MQ=255) | GTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGAC‑ATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGT > NZ_CP025268/1624890‑1625163 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |