| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 183,450 | A→G | K386R (AAG→AGG) | cdaR → | DNA‑binding transcriptional regulator CdaR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 183,450 | 0 | A | G | 99.3% | 947.0 / NA | 290 | K386R (AAG→AGG) | cdaR | DNA‑binding transcriptional regulator CdaR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (159/129); minor base T (2/0); total (161/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 290 total aligned reads displayed.
AAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GG‑TGAAGAGCGGTAAGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTT > NZ_CP025268/183316‑183586 | aaaGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTa < 2:598101/140‑1 (MQ=255)aaaGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTa < 2:3873024/140‑1 (MQ=255)aaaGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTa < 2:4407963/140‑1 (MQ=255)aaaGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTa < 1:3899495/140‑1 (MQ=255) gCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCg < 1:644771/140‑1 (MQ=255) ttgttTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGGTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGCAGGTTATGCGTTa > 2:4474038/1‑140 (MQ=255) ttgttTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTCGGTTATGCGTTa > 1:4784078/1‑140 (MQ=255) ttgttTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTa > 2:748266/1‑140 (MQ=255) tCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGACCGGACCGGGCTTGAATTGGGCAATTTTGATGACAGGTCGCTCCCGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTTAGGTTGAg < 2:3355718/140‑1 (MQ=255) tCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAg > 1:4945598/1‑140 (MQ=255) cATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAgg < 1:2827552/140‑1 (MQ=255) cATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAgg < 1:47066/140‑1 (MQ=255) cATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAgg < 2:4714296/140‑1 (MQ=255) cATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAgg < 1:503653/140‑1 (MQ=255) aTCGTAATACCCTGGAGTATGGGCTTGAGCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTGGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTGCAACT‑GGATGAAGTGCGGTAGGTTATGCGTTAAGATTGAggc > 2:1208295/1‑140 (MQ=255) aTCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAggc < 1:107935/140‑1 (MQ=255) cGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAggcgg > 1:809098/1‑140 (MQ=255) aTACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTCCAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCt < 1:1617589/140‑1 (MQ=255) tACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTg < 2:5023280/140‑1 (MQ=255) tGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCa > 2:4173791/1‑140 (MQ=255) tGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCa > 1:1145718/1‑140 (MQ=255) ggAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCAt < 1:4595775/140‑1 (MQ=255) gAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCAtt > 1:535793/1‑140 (MQ=255) gAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGGAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCAtt > 1:2940371/1‑140 (MQ=255) gAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGGGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGGTGAGGCGGCGCTGGCTCAtt > 1:1906600/1‑140 (MQ=255) aGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGATAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGTGGCGGCGCTGGCTCATTc > 2:3992421/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTcccat > 2:3063784/1‑138 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 1:315467/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt < 1:2546072/140‑1 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 2:4943329/1‑140 (MQ=255) cGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACCACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGGTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTc > 2:1669328/1‑140 (MQ=255) cGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACACCTGGG‑TGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATGCCCCTc < 2:3755966/140‑1 (MQ=255) cGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTc < 2:2321597/140‑1 (MQ=255) cGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTc > 2:3280997/1‑140 (MQ=255) ggCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCa < 2:1630626/140‑1 (MQ=255) gCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAg > 1:2516617/1‑140 (MQ=255) aaTCGTATATCGGACCTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 1:2023695/140‑1 (MQ=255) aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 2:1178898/140‑1 (MQ=255) aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 1:4343982/140‑1 (MQ=255) aTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGa < 1:1597917/140‑1 (MQ=255) tCGTCTATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATCTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCAGTCCCCTCAGCCCGaa < 2:841703/140‑1 (MQ=255) tCGTATATCGGCACTGACCGGGCTTGATTTGGGTCATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATATGGCGTTCCAACT‑GGATGGAGAGCCGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 2:2598593/140‑1 (MQ=255) tCGTATATCGGAACTGGCCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 1:1175580/140‑1 (MQ=255) tCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATTACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 2:2353548/140‑1 (MQ=255) tCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 2:5305909/140‑1 (MQ=255) tCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 2:2435094/140‑1 (MQ=255) tCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 1:1288448/140‑1 (MQ=255) tCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 2:2973839/140‑1 (MQ=255) tCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 1:3044804/140‑1 (MQ=255) tCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 1:2217150/140‑1 (MQ=255) tCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGCAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 1:4474038/140‑1 (MQ=255) tataTCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAggg > 1:2174791/1‑140 (MQ=255) tatCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGTCAATTTTGATGACAGGTTGCAGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGATGGTTATGCGTTAAGGTTGAGACGGCGCTGGCTCGTTCCCCTCAGTCGGAAGGGTa > 2:4095009/1‑140 (MQ=255) tatCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCCATTTTGATGACCGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTa > 2:5092897/1‑140 (MQ=255) tatCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTGGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTa > 2:206063/1‑140 (MQ=255) atCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTCGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTag < 2:3495197/140‑1 (MQ=255) gAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAggg > 2:4071835/1‑140 (MQ=255) gAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAggg > 1:3567398/1‑140 (MQ=255) gAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAggg > 2:4659883/1‑140 (MQ=255) aaCTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAgggg < 1:4283322/140‑1 (MQ=255) aCCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGc > 1:2709875/1‑140 (MQ=255) aCCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGc > 2:286261/1‑140 (MQ=255) aCCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGc > 2:2322383/1‑140 (MQ=255) aCCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGc > 1:3973179/1‑140 (MQ=255) aCCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGGAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGc > 1:311241/1‑140 (MQ=255) ggCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTACTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGa > 2:4348907/1‑140 (MQ=255) gCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGaa > 2:4920351/1‑140 (MQ=255) tGATTTTGGCAATTTTAATGACTGCGTGCGGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTCAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAATGTTAGAGGGGAATGCCCGAAttc < 2:1352918/140‑2 (MQ=255) aTTTGGGGAATTTTGATGATAGGTTGCTGCTGTATGTGGCTTTACAACT‑GGAGGAAGATCGGGTTGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCGTGCTCATTCCCCTTAGCCCGTTGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAAc > 2:2167058/1‑140 (MQ=255) tGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGt < 1:3233368/140‑1 (MQ=255) ggCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCa > 1:3762143/1‑140 (MQ=255) ttttGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCg > 1:3722995/1‑140 (MQ=255) tttGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCgg < 1:5280497/140‑1 (MQ=255) tgatgaCAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGa < 1:4242208/140‑1 (MQ=255) tgatgaCAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGGTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGGTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCCGCCCGAAGCGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGa < 2:2669028/140‑1 (MQ=255) atgaCAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTGATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGatt > 2:191665/1‑140 (MQ=255) tgctgcTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTAcgcg < 2:560811/140‑1 (MQ=255) tgctgcTGTATGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGAGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTAcgcg < 2:2540436/140‑1 (MQ=255) aTGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTTGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGttttt > 1:4909923/1‑140 (MQ=255) aTGTGGCGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGGTTATTTACGCGTTAGttttt > 1:121461/1‑140 (MQ=255) cGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCGGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt > 2:3203538/1‑140 (MQ=255) cGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt > 1:2114947/1‑140 (MQ=255) cGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt > 2:5178197/1‑140 (MQ=255) cGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt > 1:1477987/1‑140 (MQ=255) cGTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt < 1:2452838/140‑1 (MQ=255) gTTACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTAGAGGCGGCGCTGGCTGATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGGTTTTCCATATc > 2:2002728/1‑140 (MQ=255) tACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCgg > 1:3022275/1‑140 (MQ=255) tACAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCgg > 2:2893360/1‑140 (MQ=255) aCAACT‑GGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCCGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGc < 2:3591565/140‑1 (MQ=255) tggatGAAGGGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTGCGGGATTATTTACGCGTTAGTCTTTCCAGATCGGCTTCaa < 2:1029067/136‑1 (MQ=255) tggatGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCaa < 2:3414432/136‑1 (MQ=255) tggatGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCaa < 1:2794721/136‑1 (MQ=255) tggatGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCaa < 1:5065883/136‑1 (MQ=255) gatGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtc > 1:3638640/3‑140 (MQ=255) atGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct > 1:5499759/2‑140 (MQ=255) aaGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGc > 1:4160929/1‑140 (MQ=255) agagCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCt < 1:3286130/140‑1 (MQ=255) agagCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCt > 2:1320417/1‑140 (MQ=255) agCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGa > 2:4236262/1‑140 (MQ=255) agCGGTAGGTTATGCGATATGGTTGAGGCGGCGCGGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCGGAATTAACCGGCAGTTTGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCGATGTCGCTgg > 2:3807706/1‑139 (MQ=255) | AAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACT‑GG‑TGAAGAGCGGTAAGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTT > NZ_CP025268/183316‑183586 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |