Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,096,538 | C→T | A283T (GCA→ACA) | yggR ← | type IV pilus twitching motility protein PilT |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,096,538 | 0 | C | T | 99.6% | 931.7 / NA | 268 | A283T (GCA→ACA) | yggR | type IV pilus twitching motility protein PilT |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (149/117); total (150/118) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
CGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGCGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACC > NZ_CP025268/3096402‑3096674 | cGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGtt > 1:3539522/1‑140 (MQ=255) cGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGtt > 1:3829173/1‑140 (MQ=255) cGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTGGAATAACATGCGGTAACGGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGtt > 1:1646831/1‑140 (MQ=255) cGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGCTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGtt > 2:1199958/1‑140 (MQ=255) caAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCa < 1:3234387/140‑1 (MQ=255) caAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCAGACCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCa < 2:4441750/140‑1 (MQ=255) gCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAAt < 1:1029777/140‑1 (MQ=255) gCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAAt < 1:2385106/140‑1 (MQ=255) ttCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCCCCGCGGGTGGGTTATTCAGCAATTCaa > 2:2124343/1‑140 (MQ=255) ttCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCaa < 1:5086907/140‑1 (MQ=255) cccccACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAAt < 2:3943482/140‑1 (MQ=255) cccACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAg > 2:2532149/1‑140 (MQ=255) cccACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAg < 1:1194128/140‑1 (MQ=255) gTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCAcgc > 2:1740894/1‑140 (MQ=255) gTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCAcgc > 2:2673823/1‑140 (MQ=255) gTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCAcgc > 1:1768478/1‑140 (MQ=255) gTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCAcgc > 1:2470470/1‑140 (MQ=255) tGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCAcgcg > 2:150891/1‑140 (MQ=255) tGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCAcgcg < 2:1088283/140‑1 (MQ=255) tGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCAcgcg < 2:2847643/140‑1 (MQ=255) tGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAAGAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAAGTCCCCACCGCGGGGGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCCcgcg > 2:5205576/1‑140 (MQ=255) atcaCTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTCGAATAACATGCGGTACCTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCCAATTCCCCACCGCGGCTGTGTTCATCCGCAATTCAAATAGCTCCACGCTgcctt > 2:4746188/4‑140 (MQ=255) gaCTCTGCTGAAACGTTATCATCCCGAGCTGCTGCGCGATTTGAATAACGTGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAAGCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGtccttcc < 2:811963/139‑1 (MQ=255) tctGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGACTAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGTATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGt > 2:5452987/1‑140 (MQ=255) tctGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGt > 1:498093/1‑140 (MQ=255) tctGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGt > 2:2625864/1‑140 (MQ=255) tctGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGt > 1:3483448/1‑140 (MQ=255) tctGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGt > 2:1678810/1‑140 (MQ=255) tctGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTAAAATAGCGCCACGCCTCCTTCCTGt > 2:4896471/1‑140 (MQ=255) tgctgAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGttt > 2:1374851/1‑140 (MQ=255) tgctgAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGttt > 1:3718026/1‑140 (MQ=255) tgctgAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGttt > 1:1401670/1‑140 (MQ=255) tgctgAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGttt > 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aaaCGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGACTCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCa < 1:2139936/140‑1 (MQ=255) gTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTc < 1:3967391/140‑1 (MQ=255) gTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTGCCTGTTTATCCACTTc < 1:2349365/140‑1 (MQ=255) ttATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTcc > 1:2084885/1‑140 (MQ=255) tATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCa < 2:1047609/140‑1 (MQ=255) atcatcCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAg > 1:3347785/1‑140 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2:540380/140‑1 (MQ=255) cccACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGGTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCTACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATATCGCCACGCGTCCTTCGTGTTTATTCACTTCCAGCTTTtg > 2:5128276/1‑140 (MQ=255) cACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTtgtg > 1:4408546/1‑140 (MQ=255) cACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTtgtg > 1:3897932/1‑140 (MQ=255) aCCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTCACTGGTGAGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTGAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCAAGCTTTTGTGa < 2:3599871/140‑1 (MQ=255) aCCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGa < 1:505893/140‑1 (MQ=255) aCCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGa > 1:1880666/1‑140 (MQ=255) tgctgcCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAg > 2:5549873/1‑140 (MQ=255) ctgcCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCTAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGcc > 2:5193850/1‑139 (MQ=255) ctgcCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCa > 1:4498016/1‑140 (MQ=255) ctgcCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCa > 1:413459/1‑140 (MQ=255) ctgcCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCa > 1:1479345/1‑140 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aTAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACTGCACTGCCCGCAAAcc > 1:3101273/1‑139 (MQ=255) cATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCt > 2:442758/1‑140 (MQ=255) cATGCGGTAACTGGGGGGTTTTCCCTTCGCGACTCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATCCAAATAGCGCCACCCGTCCTTCCTGTTCATCCACATCCAGCTTTTCTGACAGCCCTGCCCGTAAACTACCt > 2:4228065/1‑140 (MQ=255) aTGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTg > 2:3166092/1‑140 (MQ=255) aTGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGGAAACTACCTg > 1:2660697/1‑140 (MQ=255) tGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGc < 2:2932039/140‑1 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1:2690828/1‑140 (MQ=255) gggTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGc > 1:2827878/1‑140 (MQ=255) ggTTGTCCCTTCGTGAAGCAAATTCCCGAGCGCGGGTGTGTTAATGAGCAAATCAGAGAGCGCCACGGGTCCTGCCTGGTTATTCACTTCCAGCTTTTTTGACAGCACTGCCCGTAAACCACCTGCCAGTTGTCTACGcc > 2:1945270/1‑139 (MQ=255) gTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCAc < 1:479614/140‑1 (MQ=255) tttCCCTTCGCGACTCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACgg < 1:4077194/140‑1 (MQ=255) tttCCCTTCGCGACTCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACgg < 1:4376955/140‑1 (MQ=255) tttCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACgg < 1:1972952/140‑1 (MQ=255) tttCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACgg < 1:4692200/140‑1 (MQ=255) cgcgAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCtttt > 1:2258991/1‑140 (MQ=255) aTCAAATTCCCCCCCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTg < 2:2030383/140‑1 (MQ=255) aTCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTg > 1:4028709/1‑140 (MQ=255) aaaTTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTgcgc < 2:4799534/140‑1 (MQ=255) ccccACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATACACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGGTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGaa < 2:2018611/140‑1 (MQ=255) ccACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAAt > 1:4968109/1‑140 (MQ=255) cACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTCTTTCTTCGCCGGCAATg > 2:2802021/1‑140 (MQ=255) cgcgGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAAt > 1:686438/1‑140 (MQ=255) cgGGTGTCTTAATCCGCAATTCAAATAGAGCCACGCGTCCATCCTGTTTATCCACTTCCAGCTCTTGTGACAGTACTGCACGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATcg < 2:4642262/140‑2 (MQ=255) | CGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGCGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACC > NZ_CP025268/3096402‑3096674 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |