| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,079,391 | A→G | intergenic (+17/‑28) | dtd → / → fabY | D‑aminoacyl‑tRNA deacylase/fatty acid biosynthesis protein FabY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,079,391 | 0 | A | G | 99.7% | 1163.2 / NA | 350 | intergenic (+17/‑28) | dtd/fabY | D‑aminoacyl‑tRNA deacylase/fatty acid biosynthesis protein FabY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (142/207); minor base T (1/0); total (143/207) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 350 total aligned reads displayed.
TGACTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAACGC > NZ_CP025268/4079254‑4079526 | aCTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCAc > 2:1566554/1‑140 (MQ=255) ttATTTCGTCGAACGATGCCGTGAGCAAGCGATGAACAGGCAAACAGGACGCTTCGCTCCGGATATGTAGGCATCGCTGGGCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGAAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 2:2774282/139‑1 (MQ=255) cTATTTCGTCGACCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTAGGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 2:4815680/140‑1 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 1:3940451/140‑1 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 1:3153768/140‑1 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 1:4919226/140‑1 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 1:4453886/140‑1 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCCGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg > 2:1392047/1‑140 (MQ=255) aTTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACggg < 2:4481942/140‑1 (MQ=255) tttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGa > 1:961211/1‑140 (MQ=255) tttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGa > 2:3226120/1‑140 (MQ=255) tttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGa < 2:3879945/140‑1 (MQ=255) ttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGaa < 1:4392977/140‑1 (MQ=255) tcgtcgAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGaaa < 1:369181/140‑1 (MQ=255) tcgtcgAACGCTGCCGTCAACACGCTGTGAACAGTCATACAGGAGGCTGCGCTCATGATATTCAGGGATGGCTGTGTAATGATGGCCCCGCGACATTCTGGTGGCGGGGAGTAGACAGCAGCCAGGGGTGTCACGGGaaa > 2:4235815/1‑140 (MQ=255) cgtcgAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCCGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAAc < 1:2357587/140‑1 (MQ=255) tcgAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACaa > 2:171973/1‑140 (MQ=255) gAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAaga < 1:3826601/140‑1 (MQ=255) aaaCGGTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGGCGCTTCGCTGCGGTTATGGAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTGCCAGGGTTGGCACGGGAAACAaga < 2:1276950/139‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagaga < 2:2383128/140‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagaga < 1:2483026/140‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagaga < 2:3660556/140‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagaga < 2:4506734/140‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagaga < 1:1416627/140‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagaga < 1:755448/140‑1 (MQ=255) cTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagagagag < 2:1020021/140‑1 (MQ=255) tGCCGTCAGCAAGAGGTGAACACGCAGACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGGTTCCAGGGGTGTCACGGGAAACAAGAGGGAGt < 2:5487445/140‑1 (MQ=255) ccGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAGCAGGACGCTTCGCTGCGCATATGCACGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTAt < 1:5100804/140‑1 (MQ=255) ggcAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 2:2533041/138‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGACCACGCAAACACGACGCTTCTCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTCTGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 2:75867/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 1:5579358/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 2:2174094/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 1:2391856/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 1:1310557/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 1:3209550/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAGATGACCACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 1:5173654/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 1:3910384/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 1:5417029/140‑1 (MQ=255) agagATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTa < 1:2609050/140‑1 (MQ=255) gagaTGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTAt > 1:2521293/1‑140 (MQ=255) gagaTGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTAt > 2:1492202/1‑140 (MQ=255) gagaTGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTAt > 2:473769/1‑140 (MQ=255) gaTGAACACGCAAAAAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGCTATTGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTCGTAGCAGGTATGAGCCAACTCCAAGGGGTGTCACGGGAAACAAGAGCGAGTATCGCTATGTATcc > 2:5597429/1‑139 (MQ=255) acacGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTc > 1:4222330/1‑140 (MQ=255) acacGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATAGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTc > 2:3120353/1‑140 (MQ=255) acGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCgg < 1:3887187/140‑1 (MQ=255) cGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCggg > 1:3631463/1‑140 (MQ=255) gCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGt > 1:3064746/1‑140 (MQ=255) gCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGt < 1:3117469/140‑1 (MQ=255) gCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGt > 1:649589/1‑140 (MQ=255) aCAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCca < 1:488413/140‑1 (MQ=255) cGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCcaca < 2:3320120/136‑1 (MQ=255) cGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCcaca > 1:3320120/1‑136 (MQ=255) cTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACaga > 2:5372919/1‑140 (MQ=255) tCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaag < 1:1097143/140‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaag < 1:1729111/140‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaag < 1:4989/140‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGATATGCAGCGATCGCTGGTCAAGGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaag < 2:520071/140‑1 (MQ=255) gCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGATTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaagaa < 1:5253590/140‑1 (MQ=255) tGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaagaaga > 2:1802714/1‑140 (MQ=255) cGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAAt < 1:545419/140‑1 (MQ=255) gATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTa < 1:535841/140‑1 (MQ=255) gATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTa < 2:2087084/140‑1 (MQ=255) tatGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTaga < 1:4325627/140‑1 (MQ=255) ggTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTa > 1:1909679/1‑140 (MQ=255) ggTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTa > 1:2734502/1‑140 (MQ=255) tATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACt < 1:2928697/140‑1 (MQ=255) gCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCa > 2:5267074/1‑140 (MQ=255) ggTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGtt > 1:2955851/1‑140 (MQ=255) tCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTc > 1:179663/1‑140 (MQ=255) tCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATCAGAGCGTTACTATCAGTTTc > 2:1170102/1‑140 (MQ=255) atgatgGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCt < 2:5421768/140‑1 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaaa > 1:1873433/1‑140 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaaa > 2:401245/1‑140 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGGTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCGGGGaaa > 2:545117/1‑140 (MQ=255) ccccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAAt > 2:2636423/1‑140 (MQ=255) cccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATg < 2:2446559/140‑1 (MQ=255) cccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATg < 2:3622699/140‑1 (MQ=255) ccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGt < 1:1208250/140‑1 (MQ=255) gTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTg > 2:3734405/1‑140 (MQ=255) gTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTg > 2:870346/1‑140 (MQ=255) gTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTg > 2:5061583/1‑140 (MQ=255) gTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCGTCTGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTg > 1:4644910/1‑140 (MQ=255) tGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTGCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGc > 2:2858987/1‑140 (MQ=255) gACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCg < 1:3740810/140‑1 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATTAGCTAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAAGAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTAGCTGGGAAATGTTGCGtt < 2:3444112/140‑2 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACATGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 2:4491554/140‑1 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 1:128154/140‑1 (MQ=255) tGCAGATATGAGCCAGCTTCGAGGTTTGTCACGGGAAATAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACGAACAGCAGAAGACTTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGc < 2:2685883/140‑1 (MQ=255) cAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCAGCAt < 2:5168082/140‑1 (MQ=255) tGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCa < 2:3001574/140‑1 (MQ=255) tGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCa < 1:568826/140‑1 (MQ=255) aGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCaaa > 1:2887428/1‑140 (MQ=255) gCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGtt > 1:866261/1‑140 (MQ=255) cTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTc < 2:3265465/140‑1 (MQ=255) aGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAac < 1:1006213/140‑1 (MQ=255) aGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAac < 1:41159/140‑1 (MQ=255) gggTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAacg < 1:3595156/140‑1 (MQ=255) ggTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAacgc < 2:3489611/140‑1 (MQ=255) ggTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAacgc < 1:4067564/140‑1 (MQ=255) | TGACTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAACGC > NZ_CP025268/4079254‑4079526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |