| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,013,520 | +G | pseudogene (463/542 nt) | zapC → | cell division protein ZapC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,013,518 | 1 | . | G | 98.2% | 887.0 / 7.6 | 271 | pseudogene (461/542 nt) | zapC | cell division protein ZapC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (5/0); new base G (140/125); total (146/125) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.36e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑T‑G‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013380‑1013651 | tGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑T‑g > 1:4337321/1‑140 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑T‑g‑ggcga > 1:4214451/1‑136 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACGCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCGGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑T‑g‑ggcga < 1:3750424/140‑5 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGGGTTTGGTTGAACGATCCTCACGAGCAGGTCAACTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCATGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑T‑g‑ggcgac < 2:778908/140‑6 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑T‑g‑ggcgac > 1:169690/1‑135 (MQ=255) cGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACg > 1:4451468/1‑140 (MQ=255) aTGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑T‑g‑ggcga < 2:268008/136‑5 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCa > 1:1794138/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCa > 1:1332196/1‑140 (MQ=255) gCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTaa < 1:1411014/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:4184434/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:1288047/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:2426420/140‑1 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTACTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGACATTAAAATCATGAACGACAg > 1:4034858/1‑140 (MQ=255) tACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGa > 1:2230548/1‑140 (MQ=255) caCTCACGCGCACGCCAATCTGCTTGTCGTTGAAGCTGTCCAAACTGCCGTCCCATTCCTACTGGCACAACCCTGCGTTGTGATTGCGGTACGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCCACGCCATTAAAATCATCAACGACCGGCTGa < 2:1424772/139‑1 (MQ=255) cTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGaaa > 1:2120250/1‑140 (MQ=255) cACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAAcc < 1:1649038/140‑1 (MQ=255) cACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAAcc < 1:3404262/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:3181823/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:2214830/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCCCACTAGGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:2001027/140‑1 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 2:2339430/140‑1 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:4299435/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:1682231/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:583938/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:2352325/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:394515/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGCTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTCAAACCGCAggg > 2:919000/1‑139 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCAGGCACTACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTGGCGCGATGCAGGT‑G‑G‑GCGACGGCATGAAAATCGTGAAGGACAGGCTGAAACCGCAgtt > 2:3646970/1‑138 (MQ=255) ggTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGGTa > 1:3898412/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACCACGCTGCGTTGTTAGTGCGGGTCGCGCGAGGCA‑GTGG‑G‑GGGACGCCATTAGAATGATGAAAGGCATGGGGAAAGCGCGGGGTaa > 2:1789927/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:2932270/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:3706251/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCCCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTGaa > 1:4238844/1‑140 (MQ=255) cAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATg < 2:3587158/140‑1 (MQ=255) tttGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTg < 1:832996/140‑1 (MQ=255) tGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAc < 2:1944124/140‑1 (MQ=255) gCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACa > 2:4714367/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATTCCGCACCATGCCTGCTGGCACAACCCTACGTTGTTATTGCGGGTCGCGTGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGGCATTAAGATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 1:3051282/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTTCGTTGGTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGGCGCCATAAGAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGTTTAATGTTGACAGc > 1:148774/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 2:3274253/1‑140 (MQ=255) gTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCTCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 2:4764372/140‑1 (MQ=255) cGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCa < 1:4709140/140‑1 (MQ=255) cTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGaa > 1:4117912/1‑140 (MQ=255) gCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAg > 1:582525/1‑140 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 2:2938033/140‑1 (MQ=255) aaaTGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAg < 2:488754/140‑1 (MQ=255) gCCGCACTATGCCTGCTGGCAAAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTa < 2:2465292/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 2:4214691/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGAACAACACTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACCACCGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 1:105045/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAAc < 2:4031892/121‑1 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 2:2052485/1‑140 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGAAAGGCTGAAACCGCCGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 2:3714682/1‑140 (MQ=255) ctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAg > 1:715405/1‑140 (MQ=255) ctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAg > 1:3207273/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 2:424060/140‑1 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg > 2:1376205/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTAGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCCACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTCAAACCCCAGGATAATGTTGACACCTCCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTGAAGTg > 2:3419271/1‑140 (MQ=255) cacaACCTTTCGTTGTTATTGCGGGTCGTCCGGTGCA‑GT‑T‑GAGCGACGCCAGTGAAATCGTGAACGACAGGCTGAAACCACAGGTTAATGTTGACAGCTTTAGCATCGAACAGGCAGTATTACCCTCCAACGTAAGTgga > 2:2854027/1‑138 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:1164495/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:2229797/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:3593068/1‑140 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:4627126/140‑1 (MQ=255) aCCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCt > 1:2974299/1‑140 (MQ=255) ccgtGCGTTGTTATTGCCGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACTCCATTAAAATCATGAACCACATGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGTCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 2:5108069/137‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt > 2:1039836/1‑140 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 1:4936540/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 2:3465847/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 1:2663578/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt > 1:2560900/1‑140 (MQ=255) cccTGCGTTGATATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGCACGCCAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 1:4994709/140‑1 (MQ=255) tGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACCGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTGCgg > 2:273953/1‑140 (MQ=255) gCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGt > 2:2365474/1‑140 (MQ=255) gCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGt > 1:1599103/1‑140 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 2:4334739/140‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa > 1:2759123/1‑140 (MQ=255) cGTTGTTATTCCGGGTCCCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 2:3117314/140‑1 (MQ=255) gttATTGTGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTAcaca > 1:2004369/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:2188718/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:2890527/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:3267357/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:3465700/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:2174719/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:3890370/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:1881534/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGGCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATTAACTACATGCTGAGACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACGGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:1478187/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGATCGCGCGATGCC‑CT‑TCG‑GCGACGCCATTCAAATCATGAACGACAGGCTGAAACAGCAGGTTAATGTTGACAGCGTCAGCCTCGAACAGGCCGTCTAACGCGCCCACTTAAGTGCAGTCTACGGTACACAg > 2:3795628/1‑140 (MQ=255) tATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGCCAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACCGc < 2:1105854/140‑1 (MQ=255) tATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGc < 2:4451352/140‑1 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 1:1168642/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 1:3369526/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 2:720528/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa < 1:3535813/140‑1 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAAcgcg > 1:3638785/1‑101 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:108021/1‑140 (MQ=255) cgcgcgATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAg < 1:5071194/140‑1 (MQ=255) gcgATGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAAt < 1:1970326/140‑1 (MQ=255) tGCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTg < 2:3851455/140‑1 (MQ=255) gCA‑GT‑TGG‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGc < 1:4824155/140‑1 (MQ=255) | TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GT‑T‑G‑GCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013380‑1013651 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |