New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP025268 | = 779967 | 351 (1.190) | 6 (0.030) +ATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATACTCAAA |
6/176 | 9.1 | 3.1% | noncoding (76/76 nt) | CXP41_RS04095 | tRNA‑Lys |
? | NZ_CP025268 | = 2525348 | 232 (0.790) | noncoding (61/76 nt) | CXP41_RS13270 | tRNA‑Lys | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 351 total aligned reads displayed.
CTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCA > NZ_CP025268/779829‑780106 | gCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACa < 1:2713465/140‑1 (MQ=33) cccccccccTTACAGGGGGGGGGTGGGGGGTCCGTCCCCGCCATCACCACCCCCCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACa < 2:2553134/134‑1 (MQ=11) aCCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCTGTTTGATCCCGTCATCACCCACCAGCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGCAGGGCAGTTGACTTTTAGTCGATTAGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATc > 1:3057223/1‑140 (MQ=11) aCCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATc > 2:441843/1‑140 (MQ=33) tCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGaa < 1:4377642/140‑1 (MQ=37) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACGGGGTCGTTAG‑CGTAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑GAGGGTCGAATCCTGCACGGCCCACCAGTTTTAATATCGAAg > 2:2426713/1‑140 (MQ=11) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCCTCGGTT‑GTAGAGGAGTTTACTTTTAATCAATTGGTCGCCGGGTTCG‑ATCCTTCCCGACCCACCAGGTTTAAACTCGaaa > 1:4933401/1‑139 (MQ=11) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGGTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAg > 1:516336/1‑140 (MQ=37) ccttcataggtggGGGTCGGGAGCTAGAACCCGCCAGCACCCACCACCGGGGCGTTAG‑GTCAGAGGGTAGGGCAGTTGACATTTGATCACTCGGGCG‑TAAGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATcgacga < 2:3849411/133‑1 (MQ=2) ccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGa < 1:1985916/140‑1 (MQ=38) ccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGa < 1:2300208/140‑1 (MQ=38) ccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGa < 1:2785698/140‑1 (MQ=38) ggaggCGGTCGGTGATTCGATCCCGACATCACCCAACACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGtt < 2:3380423/140‑1 (MQ=14) aggGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTaa > 1:625328/1‑140 (MQ=255) aggGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTaa > 2:2410378/1‑140 (MQ=255) aggGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTaa < 2:509431/140‑1 (MQ=255) aggGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTaa < 1:1738297/140‑1 (MQ=255) aggGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGGCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGGTaa > 2:144770/1‑140 (MQ=255) aggCGGTCGGCGGTTCGATCCCATCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTaa < 2:4755571/140‑1 (MQ=255) agagggTCGGCGCTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTGG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTaa < 2:4634721/137‑1 (MQ=255) agacgggcggcggTTCAATCCCATCATCACCCAACACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTaa < 2:2181605/133‑1 (MQ=14) ggggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACGCACCAATGTTAACATCGAACTCAGATGtgaggc > 2:2099929/1‑135 (MQ=11) ggggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGc > 2:3099211/1‑140 (MQ=255) ggggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGc > 2:3212186/1‑140 (MQ=255) ggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCgt < 1:1793165/140‑1 (MQ=255) gTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCgtg < 2:4233509/140‑1 (MQ=255) tCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGt > 1:4720057/1‑131 (MQ=255) gcggTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAACACAGATGTTAAGCGTGTAgg > 1:301727/1‑140 (MQ=255) tCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAAc < 1:3212186/140‑1 (MQ=255) tcatcaCCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTaa < 1:717231/117‑1 (MQ=255) tcatcaCCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCa > 2:1750448/1‑140 (MQ=255) tcaCCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCa < 1:4217117/140‑1 (MQ=255) acccaccACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑TAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGTAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAAc < 1:2831765/140‑1 (MQ=255) acccaccACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAAc < 1:4051427/140‑1 (MQ=255) acacgccacgGGGTCGTTCG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTGTTAATCACTTGGGCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTCTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAAc < 2:4279632/135‑1 (MQ=14) caccGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCg > 2:4438381/1‑140 (MQ=255) gggTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAgg < 1:2203090/140‑1 (MQ=255) gTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAgggg > 2:2632532/1‑139 (MQ=255) gTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGgc > 1:376532/1‑140 (MQ=255) ttAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTGT‑CAGTTATGAATCTCGCACGCTCCCCCCGATTTCACATCTATAGCTCTCGTTAAGCGCGTAAGCAAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGgcgag‑c > 2:2301368/1‑140 (MQ=2) ttAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGgcgagg > 2:1891637/1‑139 (MQ=255) g‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGag‑cgaa < 1:4403346/140‑1 (MQ=255) g‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGag‑cgaa < 2:558586/140‑1 (MQ=255) g‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGag‑cgaa < 2:4921204/140‑1 (MQ=255) g‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGag‑cgaa < 2:1996765/140‑1 (MQ=255) g‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGag‑cgaa < 1:4458944/140‑1 (MQ=255) g‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGag‑cgaa < 1:3421014/140‑1 (MQ=255) aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGag‑cgaa‑g‑cga > 1:1465706/1‑140 (MQ=18) gTTGGTAGCGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCCCCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAg < 2:150535/140‑1 (MQ=255) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAg < 2:2693426/140‑1 (MQ=255) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAg < 1:1011466/140‑1 (MQ=255) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAg < 1:3314586/140‑1 (MQ=255) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAg < 2:4357940/140‑1 (MQ=255) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAg < 1:3700316/140‑1 (MQ=255) ggTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTTTCATCGTAGTCAGGCGATAAGCGAGTAGGACAACGTTGCGTTCGCCGGGAGCCGTAGGGGGGG‑AGAA‑G‑CGAGTCa < 2:4576739/140‑1 (MQ=2) ggTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCa < 2:3543719/140‑1 (MQ=255) ggTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCa < 1:1552411/140‑1 (MQ=255) ggTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCa < 2:2057719/140‑1 (MQ=255) gCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCTAG‑CGAA‑G‑CGAGTCACCCTGc > 2:1350903/1‑140 (MQ=255) cAGTTGATTTTTAATCACGTGGTAG‑GAGGTTCGACAACAGAACGACCCACCCGTTTTAACCTAGAAGAAAGATGTTAAGCGTGTGGGATACCGTTGCGTCAGCAACGGCCAGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCa < 2:3872861/140‑1 (MQ=14) cAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCa < 1:3412510/140‑1 (MQ=255) cAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCa < 2:376532/140‑1 (MQ=255) cAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCa < 1:2473986/140‑1 (MQ=255) cAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCa < 1:2016938/140‑1 (MQ=255) cAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCa < 1:793758/140‑1 (MQ=255) cAGTTGACCTTAAGTCAATTGGTGG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGGCAGATGTAAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCa < 2:4049089/140‑1 (MQ=14) ttGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGa > 2:689632/1‑140 (MQ=255) tGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAGGAAGG‑CGAGACATCCTGCACg > 1:3520717/1‑140 (MQ=14) gagttttCATGAATCGGTCG‑CAGGTTCGAATCCCGCACGACCCACCAGTTTTCACATCGCAGACAGATGTTAAGCGTGTAGCATCACGTTGCTTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGAcc < 2:2815329/137‑1 (MQ=14) gACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGAcc < 1:1167334/140‑1 (MQ=255) gACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGAcc < 1:3125877/140‑1 (MQ=255) gACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGAcc < 1:4585914/140‑1 (MQ=255) ttttAATCAATGGGTCG‑AGGGTTGGATTCTGGAAGGACCCA‑CAGTTTTAACGTCGGTGACTGGTGTTGAGCGTGTAGGATGACGATGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGACGAA‑GTCGAGTCATCCTGCACGACcca < 2:3057223/140‑1 (MQ=2) ttAAGCAATTTGTAG‑CAGGGTCGAATCCTGCACGGCCAAACATTTATAACAGAGAAGACAGGTGTAAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACccacca < 2:5080753/140‑1 (MQ=14) aTCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAg > 1:852661/1‑117 (MQ=255) aTCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTa < 2:296739/140‑1 (MQ=255) gTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGt < 2:3496142/140‑1 (MQ=255) ttCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCgg < 1:3551103/140‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGaa < 1:5093311/140‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGaa < 1:925552/140‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGaa < 1:138154/140‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGaa < 2:867915/140‑1 (MQ=255) tCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGCCAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAag < 1:3941823/140‑1 (MQ=255) tGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAagtag > 1:396755/1‑140 (MQ=255) gCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAagtagt < 1:2580801/140‑1 (MQ=255) gCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAagtagt < 1:3372759/140‑1 (MQ=255) gCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAagtagt < 2:1012714/140‑1 (MQ=255) gCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAagtagt < 1:50744/140‑1 (MQ=255) gCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAagtagt < 2:121414/140‑1 (MQ=255) cACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGtt > 1:3511189/1‑140 (MQ=255) aCCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCTGTGGAAGTAGTTTgta < 2:4468911/140‑1 (MQ=255) cccACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCTTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTGTgtag > 1:3909429/1‑140 (MQ=255) cccACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTgtag > 1:1663286/1‑140 (MQ=255) cccACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGAAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTCCGGGGGAAGTAGTGTgtag > 1:1839963/1‑140 (MQ=255) accaGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCTTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGCCCGGAGGAAGTAGTTTGCAGTAt > 1:1261413/1‑140 (MQ=18) accaGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTCTTAAAGGTGGGCGCGGTGGAAGAAGCTTgtagtaa > 2:4023807/1‑139 (MQ=17) ccaGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATc < 1:2631347/140‑1 (MQ=255) ccaGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATc < 1:4514691/140‑1 (MQ=255) ccaGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGAGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATc < 1:949586/140‑1 (MQ=255) caGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGGTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATcc > 1:3463713/1‑140 (MQ=255) | CTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAG‑CTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG‑CAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAA‑G‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCA > NZ_CP025268/779829‑780106 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |