| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | = 779967 | 351 (1.190) | 6 (0.030) +ATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATACTCAAA |
6/176 | 9.1 | 2.7% | noncoding (76/76 nt) | CXP41_RS04095 | tRNA‑Lys |
| ? | NZ_CP025268 | = 780478 | 321 (1.090) | noncoding (61/76 nt) | CXP41_RS04110 | tRNA‑Lys | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
AGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAAT > NZ_CP025268/780339‑780617 | agcgaagcgaGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATc > 1:1120817/1‑140 (MQ=255)agcgaagcgaGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATc > 2:1638970/1‑140 (MQ=255)agcgaagcgaGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATCGGCCCCGAGTCAATATCTTTCAGTTAACACCCGTATAGGTCGTTAGCTCAGATGTGATAGCAGTTGCCTATTAATCAAT‑TGATCGCAGTTTCGAATc > 2:4513264/1‑140 (MQ=37) agcgaGTCATCCTGCACGGCCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGGAAAAATCTTTCAGGTACCCCCCGTTTGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCa < 2:1060535/140‑1 (MQ=25) aTCCTGCACGACCCTCCAATTTTAACGATTGGGCCCGAGGAAAAATCTTTCCGGTAACACCCGTTTGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACccac < 2:50729/140‑1 (MQ=21) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACCCCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACccac < 2:1167079/140‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACccac < 1:1000216/140‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACccac < 1:3265925/140‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACccac < 1:2905641/140‑1 (MQ=255) aTCCTGCACCACCCACCAATCTGAACGATTGGCCCGGAGTAAAAATCTGTCACGTAACTCCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAGG‑TGGTCGAAGGTTCGAATCCTGCACGACccac < 2:1896082/140‑1 (MQ=21) cACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAttt > 1:5068606/1‑140 (MQ=255) cACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGACGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAttt > 2:4870291/1‑140 (MQ=255) gACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTaaa < 1:2058921/140‑1 (MQ=255) aCCCACCAAGCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAATTCTTTATGGTACGGCCCGCATCGGTCGTTAGCTCAGTTCCTAGGGCAGCTG‑CGTCTGATGTATATGGGCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAg < 2:3511060/140‑1 (MQ=16) cccACCAATCTTAAATTTTGCCCCTCAGAAAAAATCTTTCATGTAACACGTGTAGAGGTCGTTAGCCCAGGTGGTATTGAAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGTTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAgg > 2:4130140/1‑140 (MQ=9) cccACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAgg > 1:4382458/1‑140 (MQ=255) cccACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAgg > 1:4818634/1‑140 (MQ=255) caccaATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAggtg < 1:3810555/140‑1 (MQ=255) accaATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAggtgg > 1:397284/1‑140 (MQ=255) ccaATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAggtggt < 1:1783146/140‑1 (MQ=255) ccaATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAggtggt < 1:3331325/140‑1 (MQ=255) ccaATCTGTAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTACAGGTAACACCCGTATGGGTGATTAGCTCAGCTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCCAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAggtggt < 2:3726002/140‑1 (MQ=21) aaTCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTa < 1:2072501/140‑1 (MQ=255) tCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACt < 1:2573809/140‑1 (MQ=255) ttAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTgg > 1:2670947/1‑140 (MQ=255) ttAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGGTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTGACTgg > 1:2135984/1‑140 (MQ=255) ttAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTCGTTACTgg > 1:3784918/1‑140 (MQ=255) aaaGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTACCACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGCATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTa < 1:4113769/140‑1 (MQ=255) aaaGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACATCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTggca < 1:2852134/140‑3 (MQ=255) aaaGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTa < 1:2179246/140‑1 (MQ=255) aaGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTag > 1:3416819/1‑140 (MQ=255) aGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACCCCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTaga < 2:3033741/140‑1 (MQ=255) tGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAAc > 2:4196959/1‑140 (MQ=255) gggcccGAGTAAAAATCTCTCCGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACg < 2:3630164/137‑1 (MQ=255) gCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGt > 1:873824/1‑140 (MQ=255) ccccGAGTAAAGATCCTTCAGGCAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTg < 2:1487678/140‑1 (MQ=255) ccccGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTg < 1:3634277/140‑1 (MQ=255) ccccGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTg < 1:4838589/140‑1 (MQ=255) ccccGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTg < 1:2507835/140‑1 (MQ=255) ccccGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTg < 1:2384324/140‑1 (MQ=255) aGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGa > 2:1136613/1‑140 (MQ=255) aGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGa > 2:1410467/1‑140 (MQ=255) aaaaTCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAAc < 1:3225022/140‑1 (MQ=255) aaaTCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACg < 1:1320184/140‑1 (MQ=255) aaCACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAAc < 1:4301437/140‑1 (MQ=255) cacCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACgg > 1:914391/1‑140 (MQ=255) gTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGa > 1:385987/1‑140 (MQ=255) tATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGt < 1:116285/120‑1 (MQ=255) gTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCg > 1:810575/1‑140 (MQ=255) gTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCACGAAGGGCg > 2:742172/1‑140 (MQ=255) gTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTCACTGGTGGAGCACGTGAGGTATAACGTTGCGTTAGCAACGGGCCGAAgcggg > 2:4671436/1‑136 (MQ=18) gTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGAGGTGACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGATGGGCg > 1:1377850/1‑140 (MQ=255) cGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACt > 1:3497040/1‑89 (MQ=255) cGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCgag > 1:3120245/1‑140 (MQ=255) cGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCgag > 1:4543092/1‑140 (MQ=255) ttAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACTTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAc > 1:1080611/1‑140 (MQ=255) ttAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGCTTACTGGTAGCGAACGTTAAGTATAACGTTGCGTTAGCAACGGGCCGAAGGGCGAGAc > 2:571836/1‑140 (MQ=21) aGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGa > 1:4636974/1‑140 (MQ=255) gCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGCTTACTAGTAGAGAACGTTAAGGATACCGTTGCATGAGCAACTGCAGGAATGGCGAGACGaa > 2:1353649/1‑140 (MQ=18) cAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAGATGCTTACTGGTAGAGAACGTTAAGGATAACGTAGCGTCAGAAACGGCACGCAGCGCGAGACGAAggc > 2:2657483/1‑138 (MQ=18) aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAg < 1:3923762/137‑1 (MQ=255) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGa < 2:873824/140‑1 (MQ=255) ttGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAg < 1:691885/140‑1 (MQ=255) ttGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAg < 2:861604/140‑1 (MQ=255) ttGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAg < 1:1416053/140‑1 (MQ=255) ttGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAg < 2:2055027/140‑1 (MQ=255) ttGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCATGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAg < 2:4746204/140‑1 (MQ=255) ttGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATAAAT‑TGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAg < 1:4211186/140‑1 (MQ=255) gTAGAGCAGTTGTCTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGGATCCCGCAAGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCa < 1:1541815/140‑1 (MQ=255) gTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCa < 2:1624661/140‑1 (MQ=255) tAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCAt > 1:572965/1‑140 (MQ=255) gCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTg > 1:185971/1‑140 (MQ=255) agttaccTTTTAACCAAT‑GGGTCGCAGGTTCGAACCCTGCACGCCCCACCAATTTAACGGCGGTTACTGGTAGAGAGCGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCa < 1:4740504/134‑1 (MQ=21) ttcaCTTTCAATCAAT‑GGGGCGCAGGTTCGAAACATGCACGACCCCCCAATTTATAACTGGTTACTGGTATATAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAATGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACg < 2:4414818/137‑1 (MQ=17) ttGACTTTTGATCAAT‑TGGACGTAGATACGAATCCTGCACGACCCAGCAATATAAAGGTAGTAACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGACTCATCCTGCACg < 2:5022810/140‑1 (MQ=18) ttGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAATGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACg > 1:1987015/1‑140 (MQ=255) ttGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACg < 1:1891637/140‑1 (MQ=255) ttGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTCACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCaag > 2:4798468/1‑138 (MQ=255) ttGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGAGGTTACTGGTAGAGAACGTGTAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGGCAGGCGAGTTCGGGTCATACTGCACg > 2:2347243/1‑140 (MQ=21) gACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACCGTGAGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGGCGAAGTCTAGTCATACTGCAAGAc > 1:4070356/1‑140 (MQ=21) ttttAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACcca < 2:385987/140‑1 (MQ=255) ttttAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACcca < 1:4983526/140‑1 (MQ=255) ttttAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACcca < 2:2937094/140‑1 (MQ=255) tttAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACccac < 1:2606240/140‑1 (MQ=255) aT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGa < 2:3825214/140‑1 (MQ=255) aT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGa < 2:3221552/140‑1 (MQ=255) ttgCAGGTTCGAAACCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGAt < 1:3178417/138‑1 (MQ=255) tCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGAt < 1:4677551/140‑1 (MQ=255) aGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGAGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAATCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAg > 2:1081662/1‑140 (MQ=255) ggTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTCGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAgg < 2:4326137/140‑1 (MQ=255) ggTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAgg < 2:3334428/140‑1 (MQ=255) ggTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAgg < 2:1727581/140‑1 (MQ=255) ggTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAgg < 1:2310698/140‑1 (MQ=255) ggTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAgg < 2:2614118/140‑1 (MQ=255) ggTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAgg < 2:397304/140‑1 (MQ=255) ggTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGAGACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAgg < 1:1630887/140‑1 (MQ=255) ggTTCGAATCCTGAACGACCCCCCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAgg < 2:4071366/140‑1 (MQ=255) gTTCGAATCCTGCACGACCCAGCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACTAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCCCCATCCTGAATGATTAAGgc > 2:4235213/1‑140 (MQ=255) gAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGgcagca < 2:1246633/140‑1 (MQ=255) aaTCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCAt < 1:510148/140‑1 (MQ=255) | AGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT‑TGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAAT > NZ_CP025268/780339‑780617 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |