| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NZ_CP025268 | 2,179,150 | Δ11 bp | coding (1199‑1209/1263 nt) | gatZ ← | tagatose‑bisphosphate aldolase subunit GatZ |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NZ_CP025268 | = 2179149 | 9 (0.030) | 304 (1.040) | 83/272 | 0.4 | 97.1% | coding (1210/1263 nt) | gatZ | tagatose‑bisphosphate aldolase subunit GatZ |
| ? | NZ_CP025268 | 2179161 = | 9 (0.030) | coding (1198/1263 nt) | gatZ | tagatose‑bisphosphate aldolase subunit GatZ | |||||
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ATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGC > NZ_CP025268/2179022‑2179300 | tctcattaccgatatgggttaaaacttcgctacgatcgacaaaagaaattccgctacgaacaaacaggttagtcatctcccgtacttatacctcacagccgtagcgataggcgcgcaaagcatcataaactgtatccatg < 2:1707078‑M2/1‑1 (MQ=255)tctcattaccgagatgggttaaaacttcgctacgatcgacaaaagaaattccgctacgaacaaacaggttagtcatataccgtccttattccgcacagccgtagcgataggcgcgcaaaacatcataaattttatccatg < 1:4845308‑M2/1‑1 (MQ=255)tatcattaccgatatgggttaaaacttcgctacgatcgacaaaagaagttccgctacgaacaaacaggttagtcatattccgtccttattccgcccggccgtagcgataggcgcgcaaaacatcataaattttatccatg < 2:35651‑M2/1‑1 (MQ=255) gatatgggttaaaacttcgctacgatcgacaaaagaaattccgctacgaacaaacaggttagtcatataccgtccttattccgcacagccgtagcgataggcgcgcaaaacatcataaattttatccatGCGGTATTGCt < 2:169437‑M2/11‑1 (MQ=255) 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1:292591‑M2/12‑140 (MQ=255) attttatccatGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATcc < 2:4897931‑M2/129‑1 (MQ=255) ttttatccatGCGGTATTGCGGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCg < 2:4476408‑M2/130‑1 (MQ=255) tttatccatGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTTAATGCGTTCATATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGa > 2:1145034‑M2/10‑140 (MQ=255) atccatGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTa > 2:27145‑M2/7‑140 (MQ=255) tccatGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTAt > 2:3796316‑M2/6‑140 (MQ=255) tGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCgg > 1:4640160‑M2/2‑140 (MQ=255) tGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCgg > 2:4570799‑M2/2‑140 (MQ=255) tGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCgg < 2:1764035‑M2/139‑1 (MQ=255) gCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGc > 1:4987206/1‑140 (MQ=255) gCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGc < 2:650715/140‑1 (MQ=255) gCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGc < 2:3288515/140‑1 (MQ=255) gCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGc < 1:1705290/140‑1 (MQ=255) gCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGc < 1:1569861/140‑1 (MQ=255) | ATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGC > NZ_CP025268/2179022‑2179300 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |