Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 607,037 | A→G | *51* (TAA→TAG) | hokE → | type I toxin‑antitoxin system toxin HokE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 607,037 | 0 | A | G | 99.2% | 1172.4 / NA | 356 | *51* (TAA→TAG) | hokE | type I toxin‑antitoxin system toxin HokE |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.48e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 357 total aligned reads displayed.
CCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAACCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAA > NZ_CP025268/606901‑607170 | cccTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGCCTCGCTGTGTGAGTTTACGGCGAAGGAACGTAATATCGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGCACCCAACAAGTAcccc > 2:4281547/1‑139 (MQ=255) cccTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCg > 1:3593434/1‑140 (MQ=255) ccTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGt < 1:712481/140‑1 (MQ=255) ccTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGt > 1:4038119/1‑140 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |