Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 1,391,913 | A→G | T126A (ACA→GCA) | tyrR → | transcriptional regulator TyrR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 1,391,913 | 0 | A | G | 98.7% | 513.2 / NA | 155 | T126A (ACA→GCA) | tyrR | transcriptional regulator TyrR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (92/61); minor base T (1/1); total (93/62) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
GGCGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCACACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATG > NZ_CP025268/1391777‑1392048 | ggCGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCcgcac > 1:4931315/1‑140 (MQ=255) ggCGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCcgcac > 1:4931211/1‑140 (MQ=255) ggCGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCcgcac < 2:2659868/140‑1 (MQ=255) cGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGACAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACaa > 2:1629125/1‑140 (MQ=255) gAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGa > 1:4618054/1‑140 (MQ=255) cgcgTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTa < 2:4400407/140‑1 (MQ=255) tACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAAAGGc > 2:1273500/1‑140 (MQ=255) ggAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTa < 2:1701642/140‑1 (MQ=255) ggCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAtt > 2:4474287/1‑140 (MQ=255) gCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAttt > 1:4684580/1‑140 (MQ=255) gCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAttt > 1:3259514/1‑140 (MQ=255) gCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCGTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAttt > 2:609373/1‑140 (MQ=255) gTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAttttt > 2:3934090/1‑140 (MQ=255) gTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAttttt > 1:4819822/1‑140 (MQ=255) ttGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTGTAAttttgt > 2:4616077/1‑138 (MQ=255) tGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTa > 1:5053895/1‑140 (MQ=255) tGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTa > 1:1405476/1‑140 (MQ=255) tGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTa > 1:1955368/1‑140 (MQ=255) tGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTa > 1:4083097/1‑140 (MQ=255) tGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTa > 2:3345500/1‑140 (MQ=255) cTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATCGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGt < 2:4584670/140‑1 (MQ=255) tGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGtt > 1:508501/1‑140 (MQ=255) gtgCTCTCTGTCGATATGAAGAGCAAAGTGGATATCGAGAACCCGGCGAGATGTCCGGTTTTGGCGGAAGAATTGGATCGCCTGCGTATCTATACCGTTTCAAAAATGATAAACACCTTTAATTTTTTAGGTTAGATGGa < 2:2345304/140‑1 (MQ=255) gtgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGa > 1:4114683/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:225764/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 2:138575/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:717088/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:1192330/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:1245934/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 2:2371134/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:2776280/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:279766/1‑140 (MQ=255) ctctctGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAg < 1:4867859/140‑1 (MQ=255) ctctGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCg < 2:2429216/140‑1 (MQ=255) ctctGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCg < 1:3245805/140‑1 (MQ=255) ctctGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCg > 1:4735854/1‑140 (MQ=255) tctGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGa > 1:3825194/1‑140 (MQ=255) tctGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGa > 2:4907967/1‑140 (MQ=255) tctGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGa > 1:2109238/1‑140 (MQ=255) tctGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCGGGAAAGCGa > 2:4448454/1‑140 (MQ=255) tGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAAc > 1:1853707/1‑140 (MQ=255) cGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGc < 1:1010812/140‑1 (MQ=255) cGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGc > 1:842567/1‑140 (MQ=255) atatGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCaa > 2:3138248/1‑140 (MQ=255) atatGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCaa < 1:1285396/140‑1 (MQ=255) atatGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCaa > 2:1866820/1‑140 (MQ=255) tGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGAt > 2:2128181/1‑140 (MQ=255) gAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGAtt < 2:2570587/140‑1 (MQ=255) aaaaGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTc > 1:1492803/1‑140 (MQ=255) aaaaGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTc > 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ccAAAGGGGATATGGCGACCCCGGCGAGCTGTCAGCTTGTTGGGCAAAAATTGGATCGCCGGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGGTTGACTGCGTTAATTTTTTACGTTGGCGGGAAAGCGAACCGCAAGATTctaat < 2:504784/139‑5 (MQ=255) aaaGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATaa < 1:1023792/140‑1 (MQ=255) aaaGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATaa < 1:4161499/140‑1 (MQ=255) aGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATCACg > 2:3554682/1‑140 (MQ=255) aGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAAACATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACg > 1:3735030/1‑140 (MQ=255) gATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGCTCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAGTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCa < 2:979206/140‑1 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cGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATggg < 1:268615/140‑1 (MQ=255) tGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGaa < 2:3487523/140‑1 (MQ=255) aGCTTTTTTGGCAGAATGTGGATCGCCTGCGGAACCATACCGCCGCGCAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTGGGGTGGAAAGAGAACCGCAAGATTCGCATAGCGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGGGTTTc < 2:4553502/140‑1 (MQ=255) aGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACACTTGATTAACGGCTTTAATTTTGTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCACAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTc < 2:4115475/140‑1 (MQ=255) aGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTc < 1:638530/140‑1 (MQ=255) ttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATg < 2:1198431/140‑1 (MQ=255) ttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATg < 2:112612/140‑1 (MQ=255) ttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATg < 1:3760532/140‑1 (MQ=255) gggCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGga > 1:4489428/1‑140 (MQ=255) aaaTTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTAc < 2:4410888/140‑1 (MQ=255) aaTTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACg < 2:4630903/140‑1 (MQ=255) aTTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGc < 1:2264593/140‑1 (MQ=255) ttGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGcc < 1:113432/140‑1 (MQ=255) ccTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCATAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATc > 1:1964400/1‑140 (MQ=255) ccTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCAGAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATc > 1:4244452/1‑140 (MQ=255) tGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCtt < 1:3021624/140‑1 (MQ=255) gcgcAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTc > 2:4049311/1‑140 (MQ=255) gcAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAGTTTTTTCCGTGCGCCAGTACCCGAACCGCAAGCCTCGCAGCACGAGCAGGTCGATCTTACAGAGCAGAGTTTCCTGATGGCGACTCCGCCTGCTGATCCTCAg > 2:1992807/1‑140 (MQ=255) aaCCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGa < 1:4205486/140‑1 (MQ=255) aaCCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGa < 2:3458749/140‑1 (MQ=255) cATACCGGCGCACAATTGATTCACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGAAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCGTGTTTATCTTCAGGAtca < 2:853018/140‑3 (MQ=255) aTACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGaa > 1:1079078/1‑140 (MQ=255) aTACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGaa > 1:3820504/1‑140 (MQ=255) aTACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGaa > 1:3820727/1‑140 (MQ=255) tACCGCCGCACCACTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAACCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCCTGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGaaa < 2:1126556/140‑1 (MQ=255) ccgccgCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAAt < 2:250687/140‑1 (MQ=255) ccgccgCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAAt > 1:3179147/1‑140 (MQ=255) cgccgcACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATg < 1:3650149/140‑1 (MQ=255) | GGCGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCACACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATG > NZ_CP025268/1391777‑1392048 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |