| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 1,625,027 | A→G | *73* (TAA→TAG) | marB → | multiple antibiotic resistance protein MarB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,625,027 | 0 | A | G | 99.7% | 1078.7 / NA | 321 | *73* (TAA→TAG) | marB | multiple antibiotic resistance protein MarB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (173/147); minor base T (1/0); total (174/147) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
GTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCG > NZ_CP025268/1624890‑1625162 | ttACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGtt < 1:2092644/140‑1 (MQ=255) aCTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGACCACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCt < 2:5047028/140‑1 (MQ=255) cttcttGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTg > 2:4517746/1‑140 (MQ=255) cttcttGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTg > 2:803118/1‑140 (MQ=255) 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cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCg > 1:4176025/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCg > 1:4811399/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCg > 2:1002774/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCg > 2:3066822/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCg > 2:3006768/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCg > 2:2776696/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCg > 2:2704826/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATAGCAGAcccc > 2:2874333/1‑139 (MQ=255) cacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACGTCCCACCTTTACCGCTCTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGCCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTCCAGACCCg > 2:107265/1‑140 (MQ=255) tATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAg > 1:1647463/1‑140 (MQ=255) tATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAg > 2:2316713/1‑140 (MQ=255) | GTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCG > NZ_CP025268/1624890‑1625162 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |