| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,635,805 | G→A | intergenic (‑73/+16) | ydfI ← / ← ydfJ | mannitol dehydrogenase family protein/MHS family MFS transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,635,805 | 0 | G | A | 99.3% | 508.7 / NA | 141 | intergenic (‑73/+16) | ydfI/ydfJ | mannitol dehydrogenase family protein/MHS family MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (86/54); minor base C (1/0); total (87/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGGGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACCTCTGGCATTTTCAGCGCAGAGATTAAACC > NZ_CP025268/1635669‑1635940 | gAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTaagagaa < 1:2320820/140‑1 (MQ=255)gAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTaagagaa < 1:1155997/140‑1 (MQ=255)gAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTaagagaa < 1:1793871/140‑1 (MQ=255)gAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTaagagaa < 1:2944685/140‑1 (MQ=255)gAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTACCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTaagagaa < 1:4066458/140‑1 (MQ=255) gCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTaagagaagg > 1:1589779/1‑140 (MQ=255) ttattaAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTaa < 1:4077077/140‑1 (MQ=255) ttaAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAggg > 2:1730667/1‑140 (MQ=255) gATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTa < 2:548064/140‑1 (MQ=255) aTCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTAc > 2:1951773/1‑140 (MQ=255) tCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACa > 1:1920963/1‑140 (MQ=255) tCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACa > 2:1306054/1‑140 (MQ=255) tCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACa > 2:972201/1‑140 (MQ=255) tCATAAACAGCGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACa < 2:3975135/140‑1 (MQ=255) ccATACACAGGGAGCGTCGCGTGTGCAGCTAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATAACAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTACCAGGTAAGAGAAGGGATTAAGAGTTTCCa < 2:2343039/139‑1 (MQ=255) cATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAg > 2:4553204/1‑140 (MQ=255) aTAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGa < 1:607769/140‑1 (MQ=255) tAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGAc < 1:3971292/140‑1 (MQ=255) gggAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTaagagaa < 1:2928084/114‑1 (MQ=255) gggAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTgg > 2:382791/1‑140 (MQ=255) ggAGTGTCGGTTTGGCTGATAACAAGTTAAATGCCATAACAATGACTGACATAGAAAAAGTGCAAGCTATATGTGTTGTTATATGAATAAAAATACCCTCTCAGAGAAGAGAAGATATTAAGGGTGTACAGAGTTCTGGa > 2:4589115/1‑140 (MQ=255) ggAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGa > 2:2981169/1‑140 (MQ=255) ggAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGa > 1:273536/1‑140 (MQ=255) aGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGACGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAg > 2:3573276/1‑140 (MQ=255) tgtCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATGAAGGGTTTACAGACTTCTGGAATGt > 1:4902350/1‑140 (MQ=255) tCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGTAAGGTTg > 2:2758551/1‑140 (MQ=255) cGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTgc < 1:1723586/140‑1 (MQ=255) gCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTgcg < 2:1840116/140‑1 (MQ=255) gCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTgcg < 1:4362737/140‑1 (MQ=255) gCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTgcg < 1:1008808/140‑1 (MQ=255) cTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTgcgc < 2:2396373/140‑1 (MQ=255) ttGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTaagagaa > 2:1207548/1‑101 (MQ=255) ttGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTaagagaa < 1:1207548/101‑1 (MQ=255) ttGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTAGATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGAGTAAGGGTTGACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGc > 2:2130913/1‑140 (MQ=255) tGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGct < 1:422797/140‑1 (MQ=255) gATAACAAATTATTTCCCATAACACCTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTa < 2:1307540/140‑1 (MQ=255) cAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTacaaca < 1:2674338/140‑1 (MQ=255) attTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGt < 1:772133/140‑1 (MQ=255) attTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGt > 1:157836/1‑140 (MQ=255) atctCCCATAACCATTCCTCACATATAAACATGACCAGCTATATGTCTTGTTATATGACTAAAAATCCCCTCTCCGGTACGAGAAGGGATTAAGGGTTCACAGACTTCTCGACGGTTGCCCAGCACTTACAACAcacgct < 2:524343/137‑3 (MQ=255) ccATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATc > 1:1464/1‑140 (MQ=255) tAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTc > 2:2252071/1‑140 (MQ=255) aCAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCg < 1:650751/140‑1 (MQ=255) ttCCTTAAATATACGTATGGCGAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAACTCCCCTTTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGTGTTTACAGACTTCTGCAAGGTTGCGCCGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTGCCGCAGc < 2:2351206/140‑1 (MQ=255) ttCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGc > 2:3171740/1‑140 (MQ=255) ttCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGc > 2:2089875/1‑140 (MQ=255) ttCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGc > 1:964737/1‑140 (MQ=255) ttCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGc > 1:246076/1‑140 (MQ=255) tCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCg < 2:1118194/140‑1 (MQ=255) taaatataaataTGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCtt > 1:152934/1‑140 (MQ=255) atataaatatGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCa > 1:3202228/1‑140 (MQ=255) tcttactatCGCAAGCTATATCTTCTGTTATATGAATAAAACTCCCCTCTCCGGTAAGAGAACGGATTAAGGGTTTACCGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACCCGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAg < 2:4513153/134‑1 (MQ=255) tataaagctGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCCGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAg < 2:1769705/140‑1 (MQ=255) ataaagatGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAgc < 1:3556883/140‑1 (MQ=255) taaatatGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAgcg < 2:710075/140‑1 (MQ=255) aatatGGCAAGCTATATGTTTTGCTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCa > 2:5082369/1‑140 (MQ=255) atGGCAAGCTATATGTTTTTTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGTAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACtt < 2:2781667/140‑1 (MQ=255) ggCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTaa > 2:1623509/1‑140 (MQ=255) ggCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTaa > 1:227840/1‑140 (MQ=255) aGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTg > 1:3101704/1‑106 (MQ=255) aGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTg < 2:3101704/106‑1 (MQ=255) gCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCAc < 1:1306054/140‑1 (MQ=255) cTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACg < 2:3150949/140‑1 (MQ=255) cTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGCGATTAAGGGTTTACGGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACACCACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACg < 2:3328120/140‑1 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 2:3050073/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 1:4956517/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 1:2015435/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 1:2405402/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 1:547476/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 2:3597297/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 2:4109515/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 1:1400626/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 1:3459233/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 1:4857935/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 1:4815969/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 2:1121024/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 2:1256812/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 1:4671437/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 1:4550377/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 2:144292/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 1:4550306/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 2:1901448/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 1:4144515/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 1:3978573/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 2:2186662/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 2:2385702/1‑140 (MQ=255) tGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGAGTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCAcc > 2:2605667/1‑140 (MQ=255) gTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACct > 1:1333610/1‑140 (MQ=255) gTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACct < 1:4773936/140‑1 (MQ=255) tataTGAATAAAGATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACctct > 2:5042096/1‑140 (MQ=255) tatGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACCTCTgg > 1:4405528/1‑140 (MQ=255) aTAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACCTCTGGCAttt > 2:2516611/1‑140 (MQ=255) aTAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACCTCTGGCAttt > 2:4270601/1‑140 (MQ=255) ccccTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACCTCTGGCATTTTCAGCGCa < 1:1915017/140‑1 (MQ=255) ccccTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACCTCTGGCATTTTCAGCGCa < 2:2132752/140‑1 (MQ=255) ccccTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACCTCTGGCATTTTCAGCGCa < 1:1121024/140‑1 (MQ=255) ccccTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCCTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACCTCTGGCATTTTCAGCGCa < 2:4749102/140‑1 (MQ=255) cccTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCTCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACCTCTGTCATTTTCAGCGCag > 1:1396146/1‑140 (MQ=255) tcCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCGTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACCTCTGGCATTTTCAGCGCAGAGAtt > 2:658019/1‑140 (MQ=255) tAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACCTCTGGCATTTTCAGCGCAGAGATTAAAcc < 1:1730667/140‑1 (MQ=255) | GAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGGGAAGGGATTAAGGGTTTACAGACTTCTGGAAGGTTGCGCAGCTCTTACAACACGCGGTTGATCTTCCGCAGCGTCTTCCAGCGCACTTAAATCACGGTCTTTCACCTCTGGCATTTTCAGCGCAGAGATTAAACC > NZ_CP025268/1635669‑1635940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |