| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,747,394 | A→G | intergenic (+14/+26) | cfa → / ← ribE | cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase/riboflavin synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,747,394 | 0 | A | G | 99.6% | 845.0 / NA | 254 | intergenic (+14/+26) | cfa/ribE | cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase/riboflavin synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (136/117); minor base T (0/1); total (136/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
TTTAAACGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCACCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGATTTCAATGTTGACGCG > NZ_CP025268/1747258‑1747527 | tttAAACGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGCAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGccc > 1:518171/1‑140 (MQ=255)tttAAACGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGccc > 1:1907423/1‑140 (MQ=255)tttAAACGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGccc > 1:1602743/1‑140 (MQ=255) ttAAACGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGcccc < 1:3910703/140‑1 (MQ=255) aCGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCctct > 1:2380270/1‑140 (MQ=255) aaTGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCg < 1:3750236/140‑1 (MQ=255) aaTGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCg > 1:3841041/1‑140 (MQ=255) tGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCggg > 1:2986616/1‑140 (MQ=255) tGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCggg > 1:290185/1‑140 (MQ=255) tGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTACCGCGCCCGTGATATTCGGCTCTGGCAGGAGGTGTGCTCACGCGGTGTTTAAGACGGCCTTCGAGGCGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCagg > 2:4533728/1‑140 (MQ=255) tttACCTATTATCTGAATGCCTGTGGAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCCGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAATCCGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCggggg < 2:4892754/140‑1 (MQ=255) tttACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCggggg < 1:1780478/140‑1 (MQ=255) ttACCTATTCTCTGCATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGTCCGTGATATTCAGCTCTCGCCGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGATAACGGCCTTCGATTGGCTCGCTAACGGCTATTCTATCGCCCCCGCTTGGGGGGc < 2:1537246/140‑1 (MQ=255) ttACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTACAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGc < 2:3208409/140‑1 (MQ=255) ttACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGc < 2:1686104/140‑1 (MQ=255) cTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCAGAGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGGCGTGATCTCACGCGGGGTTGAAAACGGCCGTCGGGCGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCACCTCTGCGGGGGCGAtt > 2:4861246/1‑140 (MQ=255) tattatCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGAttt < 1:1595442/140‑1 (MQ=255) ttatCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCa < 1:573303/140‑1 (MQ=255) tGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCa < 2:3539957/140‑1 (MQ=255) tGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCa > 1:2507922/1‑140 (MQ=255) aaTGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAgg > 2:2855593/1‑140 (MQ=255) aTGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGc > 1:2930691/1‑140 (MQ=255) tacTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCCGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCCCTACAGGCTATTCTATCGCCCCCTCCCCGGGGGCGATTTCCGATCAGGCtt < 2:4036484/138‑1 (MQ=255) gCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCtt < 2:2970082/140‑1 (MQ=255) gCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCtt < 1:3700006/140‑1 (MQ=255) ccTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTc > 1:2111291/1‑140 (MQ=255) tgtgCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCCGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCtg > 2:1623354/1‑140 (MQ=255) tgtgCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCtg > 2:3686034/1‑140 (MQ=255) tgCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCtgtg > 2:685387/1‑140 (MQ=255) tgCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCtgtg > 1:1862994/1‑140 (MQ=255) tgCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCtgtg > 1:150381/1‑140 (MQ=255) tgCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGCGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTACGGGGGCGATGTCAGATCAGGCGTCtgtg > 2:2519951/1‑140 (MQ=255) gccggTGCCTTACGCGACAGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTACAGGATATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGc < 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ttCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGAt > 1:858342/1‑140 (MQ=255) ttCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGAt > 1:2135669/1‑140 (MQ=255) ttCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGAt > 1:1105055/1‑140 (MQ=255) ccGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTc > 1:1341935/1‑140 (MQ=255) ccGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTG‑AAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCa < 2:2350843/140‑1 (MQ=255) cgcCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTATGACGAGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGACTGGTTGATTCATg > 2:3287299/1‑140 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ctctGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTgccg > 1:3033436/1‑140 (MQ=255) tctGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTgccgc < 1:4137533/140‑1 (MQ=255) tctGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTgccgc < 1:924132/140‑1 (MQ=255) ctGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTgccgcc < 1:4595213/140‑1 (MQ=255) tGGCAGGTCGTGTTGTCACGCGGTGTTGAAAAAGGCCTTCGAGTGGCTCGCGAAAGGCTATTATAGCGCCCCCTCTGCGAGGGCGGTTTCAGATACGGCTTCTGTGCTGGGTTGGTTCATGGCATTTTCGCGTGCCGCCa > 2:4980837/1‑140 (MQ=255) tGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGTGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCa > 1:4249776/1‑140 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1:4043334/140‑1 (MQ=255) aaCGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTANTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTGCTACCGTATCTACCACTGccn < 1:1145959/140‑2 (MQ=255) ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTAc > 2:1796200/1‑129 (MQ=255) ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAg > 1:4416526/1‑140 (MQ=255) ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAg > 1:4633513/1‑140 (MQ=255) ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAg > 1:1661359/1‑140 (MQ=255) ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAg > 2:821295/1‑140 (MQ=255) ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAg > 1:843708/1‑140 (MQ=255) ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAg > 1:3088704/1‑140 (MQ=255) ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAg > 1:3244890/1‑140 (MQ=255) ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATGTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAg > 2:4425141/1‑140 (MQ=255) ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCCACTCTATCGCCCCCTCTCCGTGGGCGCTCCCAGATCAGGCGCCTGTGCCTGGCTGATTCACGGCCTTTTCTCGTGCCCCCCGCCCCCGTCCTCCCGTATCCCCCACCGCCtacg > 2:1116003/1‑137 (MQ=255) ccTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGtt > 2:1948618/1‑140 (MQ=255) gTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGAt < 1:3542905/140‑1 (MQ=255) gTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGAt < 1:5055472/140‑1 (MQ=255) cGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGAttt < 1:3686034/140‑1 (MQ=255) cGCTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGAttt < 2:3126371/140‑1 (MQ=255) cTAAAGGCTATTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGATTTCa < 2:3841041/140‑1 (MQ=255) aTTCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGATTTCAATGTTGAcg > 1:718491/1‑140 (MQ=255) ttCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGATTTCAATGTTGAcgg > 1:360797/1‑139 (MQ=255) ttCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGATTTCAATGTTGAcgc > 2:2393606/1‑140 (MQ=255) ttCTATCGCCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGATTTCAATGTTGAcgc > 2:1370535/1‑140 (MQ=255) | TTTAAACGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTATCACCCCCTCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGATTTCAATGTTGACGCG > NZ_CP025268/1747258‑1747527 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |