| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 1,798,989 | T→C | *327* (TAA→TAG) | btuC ← | vitamin B12 ABC transporter permease BtuC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,798,989 | 0 | T | C | 99.4% | 1063.0 / NA | 323 | *327* (TAA→TAG) | btuC | vitamin B12 ABC transporter permease BtuC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base C (177/142); total (181/142) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
ACCGGCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGTTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCGCTCGCCC > NZ_CP025268/1798852‑1799122 | aCCGGCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTGTTTGCGGCTa < 1:2262959/140‑1 (MQ=255) gCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGt > 1:464669/1‑140 (MQ=255) caaaCTTAACCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCAGCGTTTCTCCTGAGTGTGGTGAGTAAAAATCTTAGATTTTAATCATAGACCGTCTCTTTGCGGCTAACGTc < 2:3006296/138‑1 (MQ=255) gAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTcc < 1:4530021/140‑1 (MQ=255) 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1:2101950/1‑140 (MQ=255) tCTTGTGGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACCCCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAAGAGGCAGCTCTGCCGCAGCTAATGCCAGGCTCGCTACAATATCCGCCAGCAGCAATGCGCt > 2:84623/1‑140 (MQ=255) ttttGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCGCTCGc < 2:1601194/140‑1 (MQ=255) | ACCGGCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGTTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCGCTCGCCC > NZ_CP025268/1798852‑1799122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |